凡纳滨对虾肠道菌群分析及其利用

发布时间：2022-01-20 13:15

　　近年来,水环境恶化和种质退化导致凡纳滨对虾病害频发、大量抗生素引起的抗药性及药物残留等问题,给养殖户造成巨大的经济损失,严重影响了对虾养殖业的健康稳定发展。为了解决养殖病害和食品安全等诸多矛盾,寻找新的绿色环保的抗生素替代品成为目前研究的热点。本研究采用高通量测序技术,分析对虾肠道和养殖水体中主要菌群组成,筛选优势微生物制备益生菌,饲养凡纳滨对虾,研究其对凡纳滨对虾免疫功能及肠道菌群的影响,主要结果与结论如下:1.采用高通量测序技术,分析了凡纳滨对虾肠道和养殖水体的菌群组成,确定对虾肠道和养殖水体的主要菌群是变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、放线菌门（Actinobacteria）、后壁菌门（Firmicutes）,次要菌群为衣原体门（Chlamydiae）、浮霉菌门（Planctomycetes）。各类群所占的比例不同,凡纳滨对虾肠道中各菌群所占比例:变形菌门42.44%、拟杆菌门46.57%、放线菌门2.21%、厚壁菌门4.57%、衣原体门0.23%、浮霉菌门0.03%;养殖水体各菌群所占比例:变形菌门57.74%、拟杆菌门18.27... 

【文章来源】：天津科技大学天津市

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1 前言
    1.1 微生物和有益微生物
        1.1.1 微生物概念
        1.1.2 微生物多样性
        1.1.3 有益微生物
    1.2 变性梯度凝胶电泳(DGGE)
        1.2.1 变性梯度凝胶电泳原理
        1.2.2 变性梯度凝胶电泳特点
        1.2.3 变性梯度凝胶电泳的应用
    1.3 高通量测序
        1.3.1 高通量测序发展历史
        1.3.2 Illumina MiSeq测序原理
        1.3.3 高通量测序相关分析
        1.3.4 高通量测序的优缺点及发展前景
        1.3.5 高通量测序的应用
    1.4 微生态制剂
        1.4.1 微生态制剂定义
        1.4.2 微生态制剂的种类和作用机理
        1.4.3 微生态制剂的应用
        1.4.4 微生态制剂的前景展望与当前存在的问题
    1.5 研究目的意义和技术路线
        1.5.1 目的意义
        1.5.2 技术路线
2. 材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 实验动物选取
        2.1.2 主要实验仪器
    2.2 实验方法
        2.2.1 高通量测序与菌群多样性分析
        2.2.2 微生态制剂在对虾养殖中的应用
3. 结果与讨论
    3.1 凡纳滨对虾肠道总菌群多样性分析
        3.1.1 凡纳滨对虾肠道总菌群DNA提取
        3.1.2 凡纳滨对虾肠道总菌群DNA的PCR扩增
        3.1.3 凡纳滨对虾肠道高通量测序结果
    3.2 养殖水体总菌群多样性分析
        3.2.1 养殖水体总菌群DNA提取
        3.2.2 养殖水体总菌群DNA的PCR扩增
        3.2.3 养殖水体高通量测序结果
    3.3 对虾肠道和养殖水体菌群间的差异性结果
    3.4 微生态制剂对凡纳滨对虾的影响
        3.4.1 微生态制剂对凡纳滨对虾生长情况的结果
        3.4.2 微生态制剂对凡纳滨对虾抗氧化系统的结果
        3.4.3 微生态制剂饲养后DGGE检测结果
4. 结论
5. 展望
6. 参考文献
7. 论文发表情况
8. 致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]DGGE技术对南美白对虾养殖水体中微生物多样性的研究[J]. 王亭芳,金风杰,马士禹,常忠义,赵云龙,高红亮.  生物技术通报. 2012(10)
[2]复合微生态制剂AQ在南美白对虾养殖中应用效果[J]. 吉远军,李家胜,陆峰,冯俊.  水产养殖. 2012(05)
[3]微生态制剂研究进展[J]. 于莲,马丽娜,杜妍,刘思佳,平洋,胡月,魏巍,杨景云.  中国微生态学杂志. 2012(01)
[4]高通量测序技术及其应用[J]. 王兴春,杨致荣,王敏,李玮,李生才.  中国生物工程杂志. 2012(01)
[5]复合池塘循环水养殖系统微生物群落结构分析[J]. 姚延丹,李谷,陶玲,李晓莉,张世羊,赵巧玲,林玉良.  中国水产科学. 2011(02)
[6]中国水产养殖水体净化技术的发展概况[J]. 王玮,陈军,刘晃,何雅萍.  上海海洋大学学报. 2010(01)
[7]微生态制剂的研制[J]. 张祥云,马洪娟.  中国医药导报. 2009(03)
[8]基因芯片与高通量DNA测序技术前景分析[J]. 滕晓坤,肖华胜.  中国科学（C辑:生命科学）. 2008(10)
[9]水霉拮抗菌的筛选及其拮抗作用的初步研究[J]. 张书俊,杨先乐,李聃,李怡,高鹏.  水生生物学报. 2008(03)
[10]应用PCR-DGGE技术解析MBR中微生物群落多样性[J]. 孙宝盛,张斌,吴卿,金敏.  天津大学学报. 2008(03)

博士论文
[1]草莓连作根腐病发生机制与微生物及化学修复研究[D]. 申光辉.西北农林科技大学 2012

硕士论文
[1]养殖对虾肠道微生物区系的特征与功能[D]. 李玉宏.上海海洋大学 2013
[2]微生物对养殖水体水质调控作用的研究[D]. 王京伟.山西大学 2007
[3]微生态制剂对南美白对虾生长和非特异性免疫因子影响的研究[D]. 隋大鹏.中国海洋大学 2003



本文编号：3598891