草鱼微卫星标记开发及9个养殖群体遗传多样性分析

发布时间：2022-01-23 08:02

　　草鱼（Ctenopharyngodon idella）在黑龙江、珠江和长江等水域中分布广泛，是我国最重要的淡水养殖鱼类。本研究通过磁珠富集法，分离筛选多态性微卫星标记400余个，为草鱼遗传连锁图谱加密工作打下基础；建立了5组适用于检测草鱼不同群体遗传多样性的微卫星多重PCR体系；对来自国内外共9个草鱼养殖群体进行了遗传多样性研究，以期为草鱼种质资源的监测、评估和利用提供理论依据。主要内容如下：1.草鱼多态性微卫星标记的筛选与分析通过改进的磁珠富集法，以生物素标记（CA）10和（GACA）6作为探针，构建以两碱基和四碱基为重复单元的草鱼微卫星文库，一共得到3000余条含有微卫星片段的序列。设计引物，并依次通过AGE和PAGE电泳检测，成功筛选出多态性微卫星引物465对，从中随机挑选25对，对60个黑龙江草鱼基因组DNA进行扩增和STR分型，分析其多态性水平。结果显示：此25个微卫星位点全部表现出多态性，每个位点等位基因数量在3-15之间，平均值为6.52；观测杂合度0.350-0.950；期望杂合度0.439-0.843；3个位点表现出偏离群体哈迪-温伯格平衡（P<0.05）；18... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

部分草鱼基因组DNA琼脂糖凝胶电泳(AGE)的拍照图

图 2-2 二次富集后的 PCR产物琼脂糖凝胶电泳(AGE)照片2 Agarose gel electrophoresis pattern of PCR products for second enrichm序及微卫星序列的整理增好的产物连接入 pGEM-T 载体 (由 Promega公司提供)，

图 2-3 微卫星单元的重复次数分布图Fig. 2-3 Number of sequences for different repeats (SSR).2 微卫星标记的不同重复单元类型分布统计显示：以二核苷酸为重复单元的微卫星位点共 4483 个，占总数量

【参考文献】：
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本文编号：3603932