基于Cytb和D-Loop的日本囊对虾遗传多样性分析

发布时间：2022-02-19 07:23

　　2018年8月至2019年3月,在浙江舟山、福建福州、福建厦门、广西北海和广东湛江5个近海水域,各采集约20尾日本囊对虾,取其腹部第六腹节肌肉,利用线粒体细胞色素b基因和DNA控制区分析方法,研究日本囊对虾这5个地理群体的种群遗传结构及变异情况,探明我国日本囊对虾种质资源现状。Cytb和D-Loop序列分析发现,5个群体中A+T含量分别为60.65%和82.54%,明显高于C+G含量（39.35%和17.46%）。在Cytb和D-Loop序列中分别检测到了76和75个简约信息位点,55和78个单倍型。Cytb和D-Loop单倍型多态性分别为0.969和0.995,核苷酸多态性分别为0.033和0.036,群体内遗传距离分别为0.004～0.022和0.005～0.017,群体间遗传距离分别为0.007～0.068和0.012～0.075。分子方差分析显示,群体间变异是变异的主要来源,占总变异的70.01%和74.39%。单倍型系统发育树显示,北海和湛江群体聚为一支,其他3个群体聚为另外一支,同一单系间又有不同程度的分化。种群历史动态显示种群相对稳定,近期未曾经历过瓶颈效应和明显扩张。综... 

【文章来源】：水产科学. 2020,39(04)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 基因组DNA的提取
    1.3 PCR扩增
    1.4 数据分析
2 结 果
    2.1 碱基组成
    2.2 遗传多样性和遗传结构
    2.3 单倍型系统发育树
    2.4 种群历史动态
3 讨 论
    3.1 序列碱基组成分析
    3.2 群体遗传多样性与遗传分化分析


【参考文献】：
期刊论文
[1]5种类型鲤鱼线粒体DNA D-loop及邻近区段的遗传多样性分析[J]. 白云,王妍,胡莹,张兴华,金万昆,高永平,杨建新,董仕.  水产科学. 2019(04)
[2]新疆塔什库尔干牦牛mtDNA Cytb基因和D-Loop区遗传多样性及系统进化分析[J]. 胡丹,钟金城,柴志欣.  家畜生态学报. 2018(11)
[3]大鳞副泥鳅群体线粒体DNA D-loop序列遗传变异分析[J]. 白晓慧,杨华,孟一耕,王娜,姜巨峰,吴会民,冯守明.  水产科学. 2018(05)
[4]基于Cytb基因多态性研究西藏地区8个藏山羊群体遗传结构及母系起源[J]. 邓娟,张红平,巴贵,次仁德吉,宋天增,李利.  畜牧兽医学报. 2018(01)
[5]基于线粒体DNA控制区序列的6个凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）养殖群体的遗传多样性分析[J]. 刘红,张海强,蔡生力,戴习林.  渔业科学进展. 2016(01)
[6]基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究[J]. 胡静,侯新远,尹绍武,祝斐,贾一何,王小军.  水生生物学报. 2014(06)
[7]不同地理群体日本囊对虾遗传多样性微卫星DNA分析[J]. 孔沛球,申玉春,刘堃.  水产科学. 2011(07)
[8]三个野生群体日本囊对虾遗传多样性的SSR分析[J]. 郭慧,申玉春.  生物技术通报. 2011(03)
[9]南海海区鲻鱼（Mugil cephalus）COⅠ基因序列的遗传多样性分析[J]. 孙鹏,彭士明,尹飞,施兆鸿.  海洋与湖沼. 2011(01)
[10]基于线粒体Cytb基因探讨我国日本囊对虾4个地理群体的遗传结构及种群分化[J]. 曾凡荣,王军,周孔霖,游欣欣,毛勇.  厦门大学学报(自然科学版). 2010(05)



本文编号：3632491