海水养殖鱼哈维弧菌分离株多位点序列分析及耐药谱型研究

发布时间：2022-07-01 09:57

　　哈维弧菌（Vibrio harveyi）是一种革兰氏阴性菌，广泛分布于海水养殖环境，能够在有利条件下感染水产动物，引起宿主复杂多样的临床致病症状，造成非常高的死亡率，给水产养殖经济产业带来巨大打击。然而，此菌与其类似菌种如坎氏弧菌、副溶血弧菌等具有极其高的表型和基因型相似度，对其进行准确的鉴定分型存在诸多困难。此外，对该菌的耐药谱型特点进行研究可为流行病学调查和合理用药提供指导，是许多研究者目前关注的重点。本研究利用多位点序列分析法对采集自2007-2012年我国南方沿海地区患病海水鱼的哈维弧菌分离株进行鉴定分型，探究多基因位点序列对哈维弧菌类似群的区分力及哈维弧菌分离株多基因位点分型情况。采用K-B法对鉴定的哈维弧菌分离株进行12种抗生素的敏感性实验，研究其耐药谱型特点，运用耐药性情况SPSS聚类分析进一步对哈维弧菌分离株进行分型，探究分型的菌株的耐药性特征。结果如下：1.利用6个保守基因位点16S rRNA、mreB、rctB、rpoD、topA、toxR分别对210株采样分离株进行测序鉴定。通过PCR、测序比对得到95株哈维弧菌类似群菌株，7株创伤弧菌菌株；基因序列的进化分析和系... 

【文章页数】：84 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1. 哈维弧菌概况
        1.1 哈维弧菌分类地位及命名
        1.2 哈维弧菌生物学特性及分布
        1.3 哈维弧菌流行病学及致病性
        1.4 哈维弧菌防治及耐药谱
    2. 哈维类似群（V. harveyi clades）的分子鉴定及分型研究进展
        2.1 哈维类似群
        2.2 哈维弧菌类似群的分子鉴定方法
        2.3 哈维弧菌类似群的分子分型方法
    3. 本论文研究目的和意义
第二章 哈维弧菌单基因位点序列分析
    2.1 材料与方法
        2.1.1 实验材料
        2.1.2 实验方法
    2.2 结果与分析
        2.2.1 受试菌株的活化及纯化
        2.2.2 PCR 扩增及电泳检测
        2.2.3 测序及 BLAST 结果
        2.2.4 系统进化树构建
        2.2.5 基因序列进化分析
    2.3 讨论
第三章 哈维弧菌串联基因位点序列分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 实验材料
        3.1.2 实验方法
    3.2 结果与分析
        3.2.1 串联基因的多态性情况
        3.2.2 串联基因序列的遗传距离情况
        3.2.3 基因区分力情况
        3.2.4 串联基因构建的系统进化树
        3.2.5 基于 5 基因串联分析的哈维弧菌分离株分型情况
    3.3 讨论
第四章 哈维弧菌分离株耐药谱型研究
    4.1 材料及方法
        4.1.1 菌株来源
        4.1.2 药物敏感性实验
        4.1.3 哈维弧菌耐药谱分析
        4.1.4 基于耐药谱的哈维弧菌分型
        4.1.5 相关名词解释
    4.2 结果
        4.2.1 哈维弧菌的耐药谱
        4.2.2 基于耐药谱的哈维弧菌分型
    4.3 讨论
        4.3.1 哈维弧菌耐药情况
        4.3.2 哈维弧菌耐药性与来源相关性分析
        4.3.3 基于耐药谱的哈维弧菌的分型分析
        4.3.4 菌株耐药谱分型与基因分型的相关性分析
总结
参考文献
附录
致谢



本文编号：3654026