刺参微卫星亲子鉴定应用及高温胁迫下表观遗传调控探讨

发布时间：2022-07-29 12:41

　　一、微卫星标记在刺参人工繁育中亲本识别的应用亲子鉴定最早应用于司法鉴定领域，随着其技术发展成熟，现在已经广泛地应用到动物学、植物学及生态学等相关领域。在水产动物遗传育种中，随着现代生物科技的不断发展，亲子鉴定也广泛的为良种选育、系谱追踪提供技术支持，应用亲子鉴定技术鉴别个体身份，清晰系谱信息有着极为重要的现实意义。本研究选取8个高多态性的微卫星位点，对240头刺参幼体和14头疑似亲本进行亲缘关系的鉴定。通过检测，8个微卫星位点共得到53个等位基因，平均等位基因数为6.63；观察杂合度在0.730-0.902之间；各位点的多态信息含量为0.696-0.836。通过亲缘关系分析软件CERVUS3.0分析，微卫星位点累积排除概率分别为0.9934，0.9997，0.99999。基于排除法个体基因型判定，有37个子代有1个候选亲本，194个子代有2个及以上候选亲本；基于似然法判定，置信度为80%时，有198个子代个体找到最似亲本。综合排除法和似然法的亲权鉴定，成功为229个子代个体找到它们的亲本，鉴定成功率达95%以上，研究结果可为刺参良种选育中混养群体优势性状溯源、系谱明晰提供便捷可靠的工具... 

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
上海海洋大学 李雪燕硕士学位论文答辩委员会成员名单
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1 刺参（Apostichopus japonicus）概述
    2 微卫星标记在刺参人工繁育中亲本识别的应用
        2.1 微卫星标记技术
        2.2 利用微卫星标记进行亲缘关系鉴定
        2.3 亲子鉴定方法的简介
        2.4 影响亲子鉴定准确性的因素
        2.5 亲子鉴定的目的和意义
    3 刺参对温度适应的研究
        3.1 温度对刺参生长的影响
        3.2 刺参在夏眠过程中的调控
    4 表观遗传调控
        4.1 表观遗传学
        4.2 表观遗传调控相关基因
        4.3 实时荧光定量 PCR
        4.4 研究的目的和意义
第二章 微卫星标记在刺参人工繁育中亲本识别的应用
    1 材料与方法
        1.1 实验样品
        1.2 主要仪器
        1.3 主要试剂
        1.4 实验方法
            1.4.1 成参 DNA 的提取
            1.4.2 幼参 DNA 的提取
            1.4.3 微卫星位点
            1.4.4 PCR 扩增条件
        1.5 电泳检测与条带统计
            1.5.1 配制非变性聚丙烯酰胺胶
            1.5.2 凝胶电泳
        1.6 数据统计与分析
    2 实验结果
        2.1 DNA 的提取检测及位点扩增结果
        2.2 微卫星位点扩增结果分析
        2.3 排除概率和累积排除概率
        2.4 基于排除法的亲子鉴定结果
        2.5 基于似然法的亲子鉴定结果
    3 讨论
第三章 表观遗传调控相关基因在不同胁迫温度下的表达
    1 材料与方法
        1.1 主要仪器
        1.2 主要试剂
        1.3 实验样品
        1.4 总 RNA 提取
        1.5 逆转录合成 cDNA 模板
        1.6 Real-time PCR
            1.6.1 引物
            1.6.2 real-time PCR 反应体系
        1.7 数据分析
    2 结果与分析
        2.1 RNA 提取与反转录
        2.2 不同温度胁迫下的刺参表观调控相关基因的表达
    3 讨论
第四章 刺参表观遗传调控基因在不同胁迫时间下的表达
    1 材料与方法
        1.1 实验样品
        1.2 总 RNA 的提取
        1.3 逆转录合成 cDNA 模板
        1.4 Real-time PCR
        1.5 数据分析
    2 结果与分析
        2.1 RNA 提取与反转录
        2.2 高温胁迫过程中表观遗传调控基因的表达
    3 讨论
    4 小结
参考文献
已完成文章
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]黑龙江野鲤与德国镜鲤杂交组合的亲子鉴定分析[J]. 葛会争,贾智英,李池陶,柏盈盈,武耀,石连玉.  上海海洋大学学报. 2012(04)
[2]微卫星标记在不同壳色虾夷扇贝家系亲权鉴定的适用性[J]. 程鹏,杨爱国,吴彪,周丽青,李霞.  水生生物学报. 2011(05)
[3]大菱鲆亲子鉴定的微卫星多重PCR技术建立及应用[J]. 苗贵东,杜民,杨景峰,徐营,樊廷俊,陈松林.  中国海洋大学学报(自然科学版). 2011(Z1)
[4]微卫星标记在穿山甲个体识别中的应用[J]. 高赛飞,于冬梅,王莹,彭建军.  生物技术通报. 2010(12)
[5]基于微卫星位点的人工圈养豚鹿亲子关系鉴定[J]. 余建秋,王强,刘选珍,邓家波,赵波,牛李丽,连虹,阮向东.  兽类学报. 2010(02)
[6]刺参基因组DNA提取的探讨[J]. 孙孝德,孙国华,杨建敏,吉成龙,王卫军,宋志乐.  生物技术通报. 2010(03)
[7]萨罗罗非鱼（Sarotherodon melanotheron）与其他5种罗非鱼遗传多样性比较研究[J]. 李学军,李爱景,李思发,蔡完其.  海洋与湖沼. 2010(01)
[8]DNA甲基转移酶的表达调控及主要生物学功能[J]. 苏玉,王溪,朱卫国.  遗传. 2009(11)
[9]微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用[J]. 何小燕,白俊杰,刘小林,樊佳佳,何小平,李胜杰,叶星.  西北农林科技大学学报(自然科学版). 2009(08)
[10]Abscisic Acid-mediated Epigenetic Processes in Plant Development and Stress Responses[J]. Viswanathan Chinnusamy.  Journal of Integrative Plant Biology. 2008(10)

硕士论文
[1]应用微卫星确定中国西门塔尔牛亲缘关系[D]. 贺建宁.中国农业科学院 2010



本文编号：3666487