乌鳢性别相关的Dmrt基因的克隆及其组织表达特征
发布时间:2022-07-29 18:08
近年来随着养殖业的需要,乌鳢(Channa argu)逐渐成为国内的特种养殖品种。为提高乌鳢子代雄性率及开展乌鳢的单性养殖,本研究采用RT-PCR和RACE的方法克隆出了乌鳢的Dmrt1基因和Dmrt4的部分基因,并对Dmrt1的表达特性进行了具体的分析,这将有助于了解乌鳢的性别决定机制。Dmrt基因是涉及到性别决定和分化的保守基因家族,它广泛存在于不同物种中。本研究通过使用简并引物从乌鳢的基因组DNA中获得了Dmrt1的保守域DM1及Dmrt4的保守域DM4,对DM结构域进行测序,通过比对确定为Dmrt基因的保守域。根据获得的保守域序列,设计3’RACE和5’RACE的引物,采用RACE的方法扩增Dmrt的全长cDNA。在乌鳢的精巢组织克隆得到乌鳢Dmrt1基因的cDNA序列,并采用半定量和定量的手段对Dmrt1mRNA在乌鳢成鱼中不同组织的表达差异进行分析。研究获得的乌鳢Dmrt1基因cDNA全长为1573bp,5’端非翻译区25bp,编码266个氨基酸的800bp的开放阅读框,747bp含有脊椎动物典型的多腺苷酸化加尾信号AATAAA的3’端非翻译区。通过对氨基酸序列的同源性进行...
【文章页数】:50 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 绪论
1 乌鳢的养殖情况和其研究意义
2 鱼类的性别决定
2.1 鱼类的性别及性染色体
2.2 鱼类性别决定相关因素
3 Dmrt 基因的研究现状
3.1 Dmrt 基因的发现
3.2 鱼类 Dmrt 基因的研究现状
4 本论文的研究意义
4.1 理论意义
4.2 生产意义
第2章 实验材料与方法
1 实验材料
1.1 实验用鱼
1.2 实验药品与仪器
1.2.1 主要实验仪器
1.2.2 主要实验药品和配制方法
1.3 引物设计与合成
1.3.1 DM 区的引物
1.3.2 3′RACE 引物
1.3.3 5′RACE 引物
1.3.4 验证 Dmrt1 全长的引物
1.3.5 用于定量分析的引物
2 实验方法
2.1 乌鳢基因组 DNA 的提取
2.2 乌鳢精巢总 RNA 的提取
2.3 琼脂糖凝胶电泳
2.4 琼脂糖凝胶中回收 DNA
2.5 PCR 扩增 DM 结构域
2.6 乌鳢总 RNA 的反转录
2.7 3′RACE 扩增 Dmrt 的 3′端
2.8 5′RACE 扩增 Dmrt 的 5′端
2.9 PCR 产物的连接反应
2.10 重组质粒的筛选
2.11 菌种的保存
第3章 实验结果
1 乌鳢基因组 DNA 的提取
2 乌鳢精巢总 RNA 的提取
3 DM-domain 区的扩增
4 Dmrt1 基因的序列分析
4.1 Dmrt1 保守域的比对
4.2 乌鳢Dmrt1基因的3′RACE和5′RACE
4.3 乌鳢 Dmrt1 氨基酸的同源性分析
4.4 乌鳢 Dmrt1 系统树的分析
4.5 Dmrt1 基因在成体乌鳢不同组织的表达
5 Dmrt4 基因的序列分析
5.1 Dmrt4 保守域的对比
5.2 乌鳢 Dmrt4 基因的 5′RACE
第4章 讨论
1 乌鳢 Dmrt1 基因结构、表达
2 乌鳢 Dmrt4 基因结构
3 Dmrt 家族的特点
4 系统发育树的构建
结语
参考文献
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]团头鲂Dmrt4基因的克隆与表达分析[J]. 苏利娜,丁祝进,李鸿,周凤娟,王卫民,刘红. 华中农业大学学报. 2013(06)
[2]鱼类DMRT基因的研究进展[J]. 曹谨玲,陈剑杰,甘西,罗永巨. 广东海洋大学学报. 2011(01)
[3]共同祖先原则和系统发育树的解读[J]. 韩凤侠. 生物学通报. 2008(09)
[4]尼罗罗非鱼Dmrt1基因克隆及在不同组织中的表达[J]. 杨东,余来宁. 湖北农业科学. 2008(07)
[5]半滑舌鳎DMRT 1基因的克隆与表达分析[J]. 孙业盈,张全启,齐洁,王志刚,陈妍婕,李春梅,钟其旺. 武汉大学学报(理学版). 2008(02)
[6]Dmrt基因家族的研究近况[J]. 吴宝林,葛熹凯,何荣华. 内陆水产. 2007(06)
[7]Expression Detection of DMRTs and Two sox9 Genes in Takifugu rubripes (Tetraodontidae, Vertebrata)[J]. SHEN Xueyan, CUI Jianzhou, YANG Guanpin, GONG Qingli, and GU Qianqun Division of Life Science and Technology, Ocean University of China, Qingdao 266003, P. R. China. Journal of Ocean University of China. 2007(02)
[8]奥利亚罗非鱼DMRT1,DMO基因片段的克隆及序列分析[J]. 唐永凯,王光花,吴婷婷. 生物技术. 2006(02)
[9]Dmrt基因的功能和特点[J]. 程子华. 安徽农业科学. 2006(05)
[10]SOX、DMRT性别决定基因家族及其应用研究进展[J]. 李楠,王秀利,仇雪梅. 生物技术通报. 2005(03)
本文编号:3666929
【文章页数】:50 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 绪论
1 乌鳢的养殖情况和其研究意义
2 鱼类的性别决定
2.1 鱼类的性别及性染色体
2.2 鱼类性别决定相关因素
3 Dmrt 基因的研究现状
3.1 Dmrt 基因的发现
3.2 鱼类 Dmrt 基因的研究现状
4 本论文的研究意义
4.1 理论意义
4.2 生产意义
第2章 实验材料与方法
1 实验材料
1.1 实验用鱼
1.2 实验药品与仪器
1.2.1 主要实验仪器
1.2.2 主要实验药品和配制方法
1.3 引物设计与合成
1.3.1 DM 区的引物
1.3.2 3′RACE 引物
1.3.3 5′RACE 引物
1.3.4 验证 Dmrt1 全长的引物
1.3.5 用于定量分析的引物
2 实验方法
2.1 乌鳢基因组 DNA 的提取
2.2 乌鳢精巢总 RNA 的提取
2.3 琼脂糖凝胶电泳
2.4 琼脂糖凝胶中回收 DNA
2.5 PCR 扩增 DM 结构域
2.6 乌鳢总 RNA 的反转录
2.7 3′RACE 扩增 Dmrt 的 3′端
2.8 5′RACE 扩增 Dmrt 的 5′端
2.9 PCR 产物的连接反应
2.10 重组质粒的筛选
2.11 菌种的保存
第3章 实验结果
1 乌鳢基因组 DNA 的提取
2 乌鳢精巢总 RNA 的提取
3 DM-domain 区的扩增
4 Dmrt1 基因的序列分析
4.1 Dmrt1 保守域的比对
4.2 乌鳢Dmrt1基因的3′RACE和5′RACE
4.3 乌鳢 Dmrt1 氨基酸的同源性分析
4.4 乌鳢 Dmrt1 系统树的分析
4.5 Dmrt1 基因在成体乌鳢不同组织的表达
5 Dmrt4 基因的序列分析
5.1 Dmrt4 保守域的对比
5.2 乌鳢 Dmrt4 基因的 5′RACE
第4章 讨论
1 乌鳢 Dmrt1 基因结构、表达
2 乌鳢 Dmrt4 基因结构
3 Dmrt 家族的特点
4 系统发育树的构建
结语
参考文献
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]团头鲂Dmrt4基因的克隆与表达分析[J]. 苏利娜,丁祝进,李鸿,周凤娟,王卫民,刘红. 华中农业大学学报. 2013(06)
[2]鱼类DMRT基因的研究进展[J]. 曹谨玲,陈剑杰,甘西,罗永巨. 广东海洋大学学报. 2011(01)
[3]共同祖先原则和系统发育树的解读[J]. 韩凤侠. 生物学通报. 2008(09)
[4]尼罗罗非鱼Dmrt1基因克隆及在不同组织中的表达[J]. 杨东,余来宁. 湖北农业科学. 2008(07)
[5]半滑舌鳎DMRT 1基因的克隆与表达分析[J]. 孙业盈,张全启,齐洁,王志刚,陈妍婕,李春梅,钟其旺. 武汉大学学报(理学版). 2008(02)
[6]Dmrt基因家族的研究近况[J]. 吴宝林,葛熹凯,何荣华. 内陆水产. 2007(06)
[7]Expression Detection of DMRTs and Two sox9 Genes in Takifugu rubripes (Tetraodontidae, Vertebrata)[J]. SHEN Xueyan, CUI Jianzhou, YANG Guanpin, GONG Qingli, and GU Qianqun Division of Life Science and Technology, Ocean University of China, Qingdao 266003, P. R. China. Journal of Ocean University of China. 2007(02)
[8]奥利亚罗非鱼DMRT1,DMO基因片段的克隆及序列分析[J]. 唐永凯,王光花,吴婷婷. 生物技术. 2006(02)
[9]Dmrt基因的功能和特点[J]. 程子华. 安徽农业科学. 2006(05)
[10]SOX、DMRT性别决定基因家族及其应用研究进展[J]. 李楠,王秀利,仇雪梅. 生物技术通报. 2005(03)
本文编号:3666929
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