桃拉综合征病毒的环介导等温扩增联合横向流动试纸条(LAMP-LFD)检测方法的建立
发布时间:2022-10-15 21:03
桃拉综合征病毒(Taura syndrome virus, TSV)是威胁虾类养殖业的主要病毒之一。本试验建立了一种快速检测TSV的环介导等温扩增联合横向流动试纸条(LAMP-LFD)方法,并与荧光定量PCR(qPCR)进行了对比。基于TSV的衣壳蛋白VP2核酸序列,设计3对特异性引物(外引物:FIP/BIP,内引物:F3/B3,环引物:LF/LB),进行LAMP反应体系的优化。其中引物LF以BIO标记,LB以FAM标记,用于横向流动试纸条(LFD)的检测。结果表明:LAMP最佳反应可在63℃恒温条件下40 min内完成。整个扩增反应到LFD结果判定可在45 min内完成。LAMP-LFD可特异性检出TSV特异性片段,未与其它病毒和细菌发生交叉反应,且其检测限为22.9 fg。与qPCR相比,本研究所建立的LAMP-LFD检测体系虽然检测限高于qPCR 10倍,但比qPCR检测时间缩短近1 h,且LAMP-LFD特异性强、操作简单,无需特殊仪器设备,可快捷、方便地检测出TSV,满足TSV基层快速检测的需要。
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试剂
1.2 引物的设计
1.3 LAMP反应体系和条件
1.4 LAMP反应参数的优化
1.5 荧光定量PCR(qPCR)反应
1.6 LAMP产物的LFD检测
1.7 特异性评价
1.8 灵敏度评价
1.9 临床实际样品检测
2 结果与分析
2.1 LAMP体系的优化
2.2 LAMP-LFD特异性分析
2.3 LAMP-LFD灵敏度分析
2.4 实际样品检测
3 结论与讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]环介导等温扩增联合横向流动试纸条检测草鱼呼肠孤病毒方法的建立[J]. 刘露,李伟哲,肖勤. 河北农业大学学报. 2018(02)
[2]应用LAMP-LFD技术可视化检测河流弧菌(Vibrio fluvialis)的研究[J]. 杨梦香,柴方超,周前进,苗亮,黄光亮,陈炯. 海洋与湖沼. 2017(02)
[3]环介导等温扩增联合横向流动试纸条可视化检测哈维氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前进,陈炯. 生物技术通报. 2016(06)
[4]变形杆菌环介导等温扩增检测法的可视化方法的比较[J]. 申培立,王羽,李志辉,郭梦冉,马晓燕,张伟,马雯,李英军,檀建新. 河北农业大学学报. 2016(03)
[5]凡纳滨对虾不同生长阶段的蛋白质需要量[J]. 黄文文,郑昌区,霍雅文,黎明,周歧存. 动物营养学报. 2014(09)
[6]液相芯片技术同时检测对虾桃拉病毒和虾黄头病毒的研究[J]. 尹伟力,张四化,岳志芹,郑小龙,刘荭. 水产科学. 2014(01)
[7]快速荧光定量RT-PCR检测对虾Taura综合征病毒(TSV)的方法建立与应用[J]. 顾松叶,王忠发,施慧,沈飚. 中国卫生检验杂志. 2011(09)
[8]对虾白斑综合征病毒LAMP检测方法的建立[J]. 冯华,张改平,郭军庆,王爱萍,赵丽娜,杜晓明,王林林. 中国兽医科学. 2011(07)
[9]桃拉综合征病毒中国株ZHZC3全基因测序及分子结构预测[J]. 黄新新,陆承平. Virologica Sinica. 2006(03)
[10]RT-PCR法检测我国东南沿海凡纳滨对虾的桃拉综合征病毒[J]. 黄新新,莫胜兰,陆承平. 中国病毒学. 2005(05)
本文编号:3692035
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 试剂
1.2 引物的设计
1.3 LAMP反应体系和条件
1.4 LAMP反应参数的优化
1.5 荧光定量PCR(qPCR)反应
1.6 LAMP产物的LFD检测
1.7 特异性评价
1.8 灵敏度评价
1.9 临床实际样品检测
2 结果与分析
2.1 LAMP体系的优化
2.2 LAMP-LFD特异性分析
2.3 LAMP-LFD灵敏度分析
2.4 实际样品检测
3 结论与讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]环介导等温扩增联合横向流动试纸条检测草鱼呼肠孤病毒方法的建立[J]. 刘露,李伟哲,肖勤. 河北农业大学学报. 2018(02)
[2]应用LAMP-LFD技术可视化检测河流弧菌(Vibrio fluvialis)的研究[J]. 杨梦香,柴方超,周前进,苗亮,黄光亮,陈炯. 海洋与湖沼. 2017(02)
[3]环介导等温扩增联合横向流动试纸条可视化检测哈维氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前进,陈炯. 生物技术通报. 2016(06)
[4]变形杆菌环介导等温扩增检测法的可视化方法的比较[J]. 申培立,王羽,李志辉,郭梦冉,马晓燕,张伟,马雯,李英军,檀建新. 河北农业大学学报. 2016(03)
[5]凡纳滨对虾不同生长阶段的蛋白质需要量[J]. 黄文文,郑昌区,霍雅文,黎明,周歧存. 动物营养学报. 2014(09)
[6]液相芯片技术同时检测对虾桃拉病毒和虾黄头病毒的研究[J]. 尹伟力,张四化,岳志芹,郑小龙,刘荭. 水产科学. 2014(01)
[7]快速荧光定量RT-PCR检测对虾Taura综合征病毒(TSV)的方法建立与应用[J]. 顾松叶,王忠发,施慧,沈飚. 中国卫生检验杂志. 2011(09)
[8]对虾白斑综合征病毒LAMP检测方法的建立[J]. 冯华,张改平,郭军庆,王爱萍,赵丽娜,杜晓明,王林林. 中国兽医科学. 2011(07)
[9]桃拉综合征病毒中国株ZHZC3全基因测序及分子结构预测[J]. 黄新新,陆承平. Virologica Sinica. 2006(03)
[10]RT-PCR法检测我国东南沿海凡纳滨对虾的桃拉综合征病毒[J]. 黄新新,莫胜兰,陆承平. 中国病毒学. 2005(05)
本文编号:3692035
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