飘鱼微卫星位点的筛选及珠江流域5个地理群体的遗传多样性分析

发布时间：2022-12-07 01:17

　　为了解珠江流域飘鱼（Pseudolaubuca sinensis）群体间的遗传多样性及其分化程度,利用RAD-Seq技术开发出微卫星位点,并设计了100对微卫星引物,筛选出66个可稳定扩增出目的条带的位点,其中16个具有较高的多态性（PIC＞0.5）,以2碱基重复居多。利用其中10对多态性位点对珠江流域的郁江（YuJ）、左江（ZJ）、右江（YJ）、融江（RJ）和桂江（GJ）飘鱼群体进行遗传多样性研究,得到有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度范围分别为5.2028—6.3800、0.6773—0.7667和0.7975—0.8425,表明珠江流域5个飘鱼群体具有较高的遗传多样性,以YuJ群体遗传多样性最高, RJ群体遗传多样性为最低。且群体间各个遗传参数相差较小,说明他们的遗传多样性水平相近。AMOVA分析显示,遗传变异主要来自于群体内（98.45%）,仅一小部分的变异来自于群体间（1.55%）,总群体的遗传分化系数Fst为0.015,两两群体间的Fst在–0.0033—0.0295波动,属于低等程度的分化。群体间基因交流值（Nm）在8.2246—76.0075,表明群体间基因交流频繁... 

【文章页数】：8 页

【参考文献】：
期刊论文
[1]大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析[J]. 孙成飞,谢汶峰,胡婕,董浚键,田园园,吴灶和,叶星.  南方水产科学. 2019(02)
[2]基于RAD-seq技术开发灵宝杜鹃多态性SSR标记[J]. 周晓君,王海亮,李方玲,张凯,王俞娜,押辉远.  农业生物技术学报. 2019(01)
[3]江苏省6个翘嘴鳜群体的遗传多样性分析[J]. 颜元杰,曹哲明,丁炜东,邴旭文.  海洋渔业. 2019(01)
[4]RAD-seq技术在鱼类基因组学中的研究进展[J]. 刘涛,李蓉,肖蘅,陈善元.  云南大学学报(自然科学版). 2018(06)
[5]A genome-wide association study on growth traits in orangespotted grouper（Epinephelus coioides） with RAD-seq genotyping[J]. Hui Yu,Xinxin You,Jia Li,Xinhui Zhang,Shuai Zhang,Shoujia Jiang,Xueqiang Lin,Hao-Ran Lin,Zining Meng,Qiong Shi.  Science China（Life Sciences）. 2018(08)
[6]基于微卫星标记的拟鲤遗传多样性及群体遗传结构分析[J]. 李可,马徐发,谢鹏,高萌,郭焱,谢从新,侯杰.  华中农业大学学报. 2018(04)
[7]实验用狨猴微卫星引物筛选及遗传多样性分析[J]. 滕永康,刘先菊,张旭,向志光,阮研硕,肖冲,刘云波.  中国比较医学杂志. 2018(06)
[8]郁江中游金陵江段鱼类早期资源现状[J]. 徐田振,李新辉,李跃飞,杨计平,武智,朱书礼,李捷.  南方水产科学. 2018(02)
[9]基于RAD-seq数据开发烟草多态性SSR标记[J]. 李海洋,李荣华,夏岩石,袁清华,张振臣,赵伟才,郭培国.  中国烟草科学. 2018(01)
[10]RAD测序技术及其在水生生物研究中的应用[J]. 胡景杰,任红艳.  水产科学. 2018(01)



本文编号：3711971