鳜类的物种界定、系统发育和生物地理以及少鳞鳜属群体遗传现状和演化过程的研究
发布时间:2023-01-06 09:30
鳜类为东亚特有淡水鱼类,其分布受水系范围严格限制,群体间的交流通常被水系阻隔,促进了不同群体间或群体内的遗传分化,是研究中国淡水鱼类区系的良好材料。界定物种和解决鳜类系统发育关系是了解鳜类物种起源,地理历史事件对其进化过程的影响和中国淡水鱼类区系的理论基础。不同水系和不同群体在时间和空间上的遗传结构和遗传多样性可反映其所在水系的地理变化历史。鳜类大部分物种仅分布于中国,部分物种是中国重要的淡水经济鱼类,如翘嘴鳜。在我国早期鳜类的野生资源较丰富,但是从上世纪70年代以后鳜类的野生资源急剧下降,长江以北的大部分地区面临绝迹。为了鳜类资源更好的保护开展和措施制定,鳜类的遗传结构和遗传多样性的分析显得越发紧迫。鳜类作为研究东亚鱼类起源进化和地理分布格局的理想种类,有关其物种鉴定、分类学研究已有相当长的历史,积累了丰富的资料,但对部分物种的有效性、群体的遗传现状、属的分类划分以及鳜类的系统发育关系和进化历史尚存争议。现阶段,对于鳜类的研究主要在形态学、线粒体DNA和少数核基因位点等方面,不同学者基于不同的方法和实验数据得到的分析结果存在较大差异。少鳞鳜属作为鳜类主要的群体,在中国,日本和朝鲜均有...
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.系统发育学
2.物种界定
3.系统发生生物地理学
4.鳜类的地理分布和生理习性
5.鳜类的研究现状
5.1 鳜类的物种界定
5.2 鳜类的遗传多样性
5.3 鳜类分类地位
6.研究意义和目的
第二章 鳜类的物种界定,系统发育和生物地理的研究
1.实验材料与方法
1.1 实验样本和DNA提取
1.2 目标序列的选择、探针的设计和合成
1.3 文库制备、基因富集和测序
1.4 数据组装
2.数据分析
2.1 鳜类物种界定分析
2.2 鳜类系统演化关系的分析
2.3 化石校正
2.4 重建鳜类祖先分布地理
3.实验结果
3.1 数据结果和比对
3.2 系统发育关系结果
3.3 物种界定结果
3.4 鳜类进化时间分析
3.5 祖先分布地理重建结果
4.讨论和分析
4.1 物种界定结果分析
4.2 鳜类系统演化关系结果
4.3 鳜类分化时间和历史生物地理结果
第三章 少鳞鳜属群体遗传现状和演化过程的分析
1.实验材料和方法及数据的初步组装
1.1 实验样本和DNA提取
1.2 基因富集和样本测序及数据的初步组装
2.数据分析
2.1 系统发育关系
2.2 种群遗传结构分析
2.3 群体间基因交流分析
2.4 化石校正和祖先分布地理分析
3.实验结果
3.1 数据的结果
3.2 系统发育关系结果
3.3 种群遗传结构和基因交流分析结果
3.4 物种分化时间和祖先分布地理结果
4 结果讨论
4.1 少鳞鳜属系统发育关系
4.2 少鳞鳜属群体遗传结构分析
4.3 少鳞鳜属系统发育和地理格局演化过程
总结
参考文献
在校期间科研情况
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]鳜鱼[J]. 丁德明. 湖南农业. 2013(12)
[2]中国浙江少鳞鳜属一新种(鲈形目,鮨科,鳜亚科)[J]. 曹亮,梁旭方. 动物分类学报. 2013(04)
[3]长白山区地质地貌演化历史[J]. 万飞. 吉林地质. 2012(03)
[4]中国少鳞鳜不同地理群体遗传变异的AFLP分析[J]. 赵丽丽,赵金良. 农业生物技术学报. 2008(05)
[5]中国少鳞鳜不同群体mtDNA控制区序列的遗传变异分析[J]. 赵丽丽,赵金良. 上海水产大学学报. 2007(05)
[6]闽江和漓江暗鳜mtDNA控制区序列差异分析[J]. 赵丽丽,赵金良,曹阳. 动物学杂志. 2007(01)
[7]我国斑鳜不同群体mtDNA控制区序列的遗传变异[J]. 王伟伟,赵金良,李思发. 上海水产大学学报. 2006(04)
[8]鳜类系统发育的线粒体Cytb基因全序列分析[J]. 章群,任岗,钱开诚,陈泉梅. 生态科学. 2006(05)
[9]鳜类鱼类的线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析(英文)[J]. 赵金良,王伟伟,李思发,蔡完其. 遗传学报. 2006(09)
[10]基于细胞色素b基因序列的东亚鳜类系统发育关系[J]. 赵金良,李思发,蔡完其,王伟伟. 动物学报. 2006(04)
本文编号:3728091
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.系统发育学
2.物种界定
3.系统发生生物地理学
4.鳜类的地理分布和生理习性
5.鳜类的研究现状
5.1 鳜类的物种界定
5.2 鳜类的遗传多样性
5.3 鳜类分类地位
6.研究意义和目的
第二章 鳜类的物种界定,系统发育和生物地理的研究
1.实验材料与方法
1.1 实验样本和DNA提取
1.2 目标序列的选择、探针的设计和合成
1.3 文库制备、基因富集和测序
1.4 数据组装
2.数据分析
2.1 鳜类物种界定分析
2.2 鳜类系统演化关系的分析
2.3 化石校正
2.4 重建鳜类祖先分布地理
3.实验结果
3.1 数据结果和比对
3.2 系统发育关系结果
3.3 物种界定结果
3.4 鳜类进化时间分析
3.5 祖先分布地理重建结果
4.讨论和分析
4.1 物种界定结果分析
4.2 鳜类系统演化关系结果
4.3 鳜类分化时间和历史生物地理结果
第三章 少鳞鳜属群体遗传现状和演化过程的分析
1.实验材料和方法及数据的初步组装
1.1 实验样本和DNA提取
1.2 基因富集和样本测序及数据的初步组装
2.数据分析
2.1 系统发育关系
2.2 种群遗传结构分析
2.3 群体间基因交流分析
2.4 化石校正和祖先分布地理分析
3.实验结果
3.1 数据的结果
3.2 系统发育关系结果
3.3 种群遗传结构和基因交流分析结果
3.4 物种分化时间和祖先分布地理结果
4 结果讨论
4.1 少鳞鳜属系统发育关系
4.2 少鳞鳜属群体遗传结构分析
4.3 少鳞鳜属系统发育和地理格局演化过程
总结
参考文献
在校期间科研情况
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]鳜鱼[J]. 丁德明. 湖南农业. 2013(12)
[2]中国浙江少鳞鳜属一新种(鲈形目,鮨科,鳜亚科)[J]. 曹亮,梁旭方. 动物分类学报. 2013(04)
[3]长白山区地质地貌演化历史[J]. 万飞. 吉林地质. 2012(03)
[4]中国少鳞鳜不同地理群体遗传变异的AFLP分析[J]. 赵丽丽,赵金良. 农业生物技术学报. 2008(05)
[5]中国少鳞鳜不同群体mtDNA控制区序列的遗传变异分析[J]. 赵丽丽,赵金良. 上海水产大学学报. 2007(05)
[6]闽江和漓江暗鳜mtDNA控制区序列差异分析[J]. 赵丽丽,赵金良,曹阳. 动物学杂志. 2007(01)
[7]我国斑鳜不同群体mtDNA控制区序列的遗传变异[J]. 王伟伟,赵金良,李思发. 上海水产大学学报. 2006(04)
[8]鳜类系统发育的线粒体Cytb基因全序列分析[J]. 章群,任岗,钱开诚,陈泉梅. 生态科学. 2006(05)
[9]鳜类鱼类的线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析(英文)[J]. 赵金良,王伟伟,李思发,蔡完其. 遗传学报. 2006(09)
[10]基于细胞色素b基因序列的东亚鳜类系统发育关系[J]. 赵金良,李思发,蔡完其,王伟伟. 动物学报. 2006(04)
本文编号:3728091
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