鲟形目鱼类分子系统发育研究

发布时间：2023-02-27 20:16

　　鲟形目鱼类(简称:鲟类;Acipenseriformes)隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)辐鳍亚纲(Actinopterygii),是软骨硬鳞下纲(Chondrostei)鱼类现生类群中唯一一目,在鱼类乃至脊椎动物演化史中有着十分重要的位置。鲟类现存种包含2科6属27个物种,全部分布于北半球,是目前公认的鱼类“活化石”。尽管在约2亿年前的侏罗纪时期就存在鲟类的化石,然而在形态上鲟类的变化却很小,加上其独特的底栖生活特性、咸淡水两栖生活史特征以及濒危或濒临灭绝的处境,使得鲟类成为系统学、生态学以及保护生物学研究的热点。尽管鲟类的系统发育研究中取得了一定的进展,但目前研究所采用的分子标记主要集中在少数几个线粒体基因,近年来,部分线粒体基因乃至全线粒体基因组在更多的鲟类中得以测定,这使得从线粒体分子标记的角度较完整的重建该类群的系统发育关系成为可能。然而,由于线粒体DNA具有母系遗传且进化速率快等特点,使得核基因分子标记成为解决古老类群系统发育关系研究的首选,特别是核蛋白编码基因(NPC)因其外显子区域较高的保守性,使其成为研究诸多古老类群系统发育关系的首选分子标记。另外,由于鲟类...

【文章页数】：104 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第1章 文献综述
    1.1 鲟形目鱼类研究进展
        1.1.1 鲟形目物种组成、分布和分类地位
        1.1.2 鲟形目鱼类系统分类研究现状
    1.2 系统发育学概述
        1.2.1 系统发育学简介
        1.2.2 系统发育学常用分析方法
        1.2.3 分子标记及其应用
    1.3 本研究的目的和意义
第2章 基于线粒体基因组的鲟类系统发育研究
    2.1 引言
    2.2 材料与方法
        2.2.1 数据获取
        2.2.2 序列处理
        2.2.3 系统发育分析
    2.3 结果
        2.3.1 序列分析
        2.3.2 分子系统发育结果
            2.3.2.1 贝叶斯推断(BI)与最大似然法(ML)结果
            2.3.2.2 分子钟估算结果
    2.4 讨论
        2.4.1 鲟形目鱼类系统发育关系
        2.4.2 分化时间
    2.5 小结
第3章 基于核基因分子标记的鲟类系统发育研究
    3.1 引言
    3.2 材料与方法
        3.2.1 利用转录组数据开发核基因分子标记
        3.2.2 数据分析
        3.2.3 系统发育分析
    3.3 结果
        3.3.1 分子标记开发
        3.3.2 分子系统发育分析结果
    3.4 讨论
        3.4.1 核基因分子标记开发
        3.4.2 鲟形目鱼类系统发育关系
        3.4.3 鲟形目鱼类分化时间研究
    3.5 小结
参考文献
致谢
发表论文及参加科研项目



本文编号：3751373