海水网箱养殖花鲈和日本黄姑鱼肠道细菌的多样性

发布时间：2023-04-02 15:29

　　利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析了网箱养殖花鲈(Lateolabrax japonicus)和日本黄姑鱼(Nibea japonica)肠道细菌组成,同时分析了配合饲料和网箱中海水的细菌组成,以确定鱼类肠道细菌与环境之间的关系。花鲈投喂冰鲜鱼,日本黄姑鱼投喂配合饲料。从花鲈和日本黄姑鱼前肠、中肠、后肠、配合饲料和网箱内海水中共鉴定出886个细菌OTU (operational taxonomic unit),分别隶属8个门、40个属,其中从花鲈和日本黄姑鱼肠道中鉴定出的550个细菌OTUs分别隶属5个门、15个属。在门的水平上,厚壁菌门(Firmicutes)在两种鱼类肠道中均占优势;在属的水平上,梭菌属(Clostridium_sensu_stricto₁)在花鲈肠道中占优势,芽孢杆菌属(Bacillus)在日本黄姑鱼肠道中占优势。花鲈与日本黄姑鱼之间肠道细菌的相似性高于日本黄姑鱼肠道细菌与配合饲料中细菌的相似性,也高于花鲈或日本黄姑鱼肠道细菌与其养殖网箱内海水中细菌的相似性。日本黄姑鱼肠道与配合饲料中共...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 鱼类肠道、饲料和海水的采样
    1.2 细菌基因组DNA的提取
    1.3 PCR扩增和16S rDNA测序
    1.4 数据分析
2 结果与分析
    2.1 鱼类肠道、配合饲料和海水中的细菌组成
    2.2 鱼类肠道、配合饲料和海水中的细菌多样性
    2.3 鱼类肠道细菌的空间异质性
    2.4 鱼类肠道、配合饲料和养殖网箱海水中细菌之间的关系
3 讨论
4 结论



本文编号：3779472