采用AFLP和SSR分析鲤生长不同阶段的遗传结构及遗传差异

发布时间：2023-04-05 15:42

　　在对鲤进行遗传多样性分析时，发现很多标记不平衡的现象;在对鲤进行QTL分析中和基于单家系的遗传作图中，发现了很多偏离平衡的位点，这说明某一种基因型严重偏离孟德尔平衡比例，对于这种现象出现的原因还不清楚。本研究利用高效的AFLP和SSR分子标记技术，扫描一个单家系鲤不同生长阶段（出膜前、出膜后平游前、平游时、秋天成鱼）的全基因组DNA，分析了鲤出膜前后部分基因型差异；利用偏离平衡的标记对不同发育阶段进行分析，获得了该单家系鲤的遗传多样性数据，比较在生长发育四个阶段的遗传结构和遗传差异，以期揭示在哪个阶段开始出现不平衡现象以及遗传多样性变化规律。对鲤分子生物学基础研究具有重要理论和现实意义，同时，也为评估鲤种质资源，建立其遗传多样性数据库提供依据。主要结果如下： 本研究利用AFLP标记技术，对出膜前和平游前两个阶段正常及状态不佳群体（畸形群体）进行分析。主要结果和结论如下 1.出膜前多态位点平均比例为23.48%，略高于出膜后多态位点平均比例22.05%。就多态性位点比例来说正常个体与死亡或状态不佳群体差异不大。 2.通过筛选，64对AFLP引物中，共35对引物存在多态性位点；8对引物存在...

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【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
缩略语表
第1章 文献综述
    1.1 我国镜鲤研究现状
    1.2 DNA 分子标记
        1.2.1 AFLP 分子标记
        1.2.2 SSR 分子标记
        1.2.3 其他 DNA 分子标记
    1.3 研究背景
        1.3.1 偏分离现象
        1.3.2 隐性致死突变研究现状
        1.3.3 鲤生长发育阶段
    1.4 研究目的及技术路线
        1.4.1 AFLP 研究目的及技术路线
        1.4.2 微卫星研究目的与技术路线
第2章 采用 AFLP 分析鲤出膜前及平游前阶段的遗传结构及遗传差异
    2.1 材料与方法
        2.1.1 主要的试剂与仪器
        2.1.2 群体的来源
        2.1.3 基因组 DNA 的提取
        2.1.4 AFLP 分析
        2.1.5 差异片段克隆测序
    2.2 结果
        2.2.1 DNA 完整性
        2.2.2 预扩增效果
        2.2.3 选择性扩增效果
        2.2.4 遗传多样性分析
        2.2.5 验证分析结果
        2.2.6 目标片段的测序结果及序列比对分析
    2.3 讨论
        2.3.1 高质量 DNA 的提取
        2.3.2 AFLP 技术体系的注意事项
        2.3.3 AFLP 分子标记技术的应用价值
第3章 利用 SSR 标记分析镜鲤生长不同阶段遗传差异及遗传结构
    3.1 材料与方法
        3.1.1 试剂与器材
        3.1.2 群体来源
        3.1.3 总 DNA 提取
        3.1.4 SSR 分析
        3.1.5 微卫星数据处理
    3.2 实验结果
        3.2.1 总 DNA 提取结果
        3.2.2 微卫星扩增结果及条带统计
        3.2.3 偏分离标记统计
        3.2.4 镜鲤种群不同发育阶段的遗传多样性
        3.2.5 四阶段哈德温伯格平衡分析
        3.2.6 镜鲤种群发育阶段间的遗传一致度和遗传距离
        3.2.7 四阶段连锁群构建比较
    3.3 讨论
        3.3.1 偏分离标记的分析
        3.3.2 镜鲤的遗传多样性
        3.3.3 镜鲤种群不同发育阶段间的遗传一致度、遗传距离及聚类分析
        3.3.4 幼鱼各阶段图谱差异性
    3.5 小结
第4章 结论
参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文
致谢



本文编号：3783679