西里伯斯青鳉线粒体基因组全序列和中华青鳉群体遗传结构的研究

发布时间：2023-04-21 04:10

　　鱼类是脊椎动物中最原始且种属数量最多的类群,分布极为广泛,它的起源复杂,多样性程度高、且遗传多样性十分丰富,因此其系统进化和遗传多样性研究是长期热点。青鳉属具有体型小、易繁殖等特点,研究深入的日本青鳉等物种已被开发为重要模式生物。然而,该属鱼类属于非食用鱼类,分布于东南亚和中国的多个物种研究滞后。其中,西里伯斯青鳉尚缺少线粒体全序列数据,而中华青鳉尚缺少群体遗传学研究。本研究利用转录组数据测定并注释了亲本源自新加坡的西里伯斯青鳉的线粒体基因组全序列,结果表明:西里伯斯青鳉线粒体基因组序列全长为16493bp(Genbank登录号为MN064715),碱基组成和基因结构与其他硬骨鱼类基本相似,包含37个基因和1个控制区。13个蛋白质编码基因中,除了COⅠ基因的起始密码子为GTG外,其余均为ATG。22个t RNA基因,均能形成完整的三叶草型二级结构(除t RNA-ser)。基于mt DNA构建的青鳉属进化树显示,其与萨拉青鳉和花斑青鳉的亲缘关系较近,在系统发育上属于较晚分化出来的物种。本研究获取了云南保山青华海、吉林莫莫格、云南大理剑湖、云南昆明花红园、云南丽江拉市海、云南香格里拉纳帕海...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 绪论
    1.1 鱼类线粒体基因组研究进展
        1.1.1 鱼类mtDNA的结构及特征
        1.1.2 鱼类线粒体在系统进化及遗传多样分析中的应用
    1.2 青鳉属鱼类研究进展
        1.2.1 国外对青鳉鱼研究现状
        1.2.2 国内对青鳉鱼研究现状
        1.2.3 青鳉属鱼类系统发育分析
    1.3 研究目的及意义
2 西里伯斯青鳉(Oryzias celebensis)线粒体基因组全序列测定
    2.1 实验材料与方法
        2.1.1 实验材料
        2.1.2 RNA的提取
        2.1.3 序列注释及分析
    2.2 结果与分析
        2.2.1 西里伯斯青鳉线粒体基因组组成与排列
        2.2.2 碱基组成
        2.2.3 蛋白质编码基因
        2.2.4 转运RNA(tRNA)基因和核糖体RNA(rRNA)基因
        2.2.5 非编码区
        2.2.6 以mtDNA基因组为基础的分子系统进化树的构建
    2.3 讨论
3 基于COⅠ基因分析比较不同地理群体中华青鳉(Oryzias sinensis)遗传多样性
    3.1 实验材料与方法
        3.1.1 实验材料
        3.1.2 样本DNA提取
        3.1.3 COⅠ序列扩增
        3.1.4 实验数据分析
    3.2 实验结果
        3.2.1 碱基组成
        3.2.2 遗传距离及中性进化分析
    3.3 讨论
4 结论
参考文献
致谢
作者简介
导师简介



本文编号：3795810