七种枝角类分子系统分类的初步研究

发布时间：2023-04-30 01:32

　　溞属和裸腹溞属都是节肢动物门(Arthropoda)、甲壳纲(Crustacea)、腮足亚纲(Branchiopoda=Phyllopoda)、双甲目(Diplostraca)、枝角亚目(Cladocera)、盘肠溞总科(Chydoroidea Brooks)的动物，分别隶属于溞科(Daphniidae)和裸腹溞科(Moinidae)。溞属、裸腹溞属动物是我国多数湖泊中枝角类的优势种，由于它们的近源物种形态相似度较高，存在分类鉴定模糊、甚至错误的现象。本研究通过直接测序的方法对获得的分子标记基因进行序列分析，并分别检验了两属7个种类的系统分类，校正了部分种类的分类错误。 为了检验已记录的4个溞属种类（隆线溞Daphnia carinata、透明溞D. hyalina、蚤状溞D. pulex、大型溞D. magna）的系统分类，用试剂盒法分别提取4种溞类的基因组DNA。利用特异性引物，通过PCR扩增了4种溞属种类的16S rDNA、CO I基因部分序列和ITS2序列，并与来自GenBank中每个种类相似度较高的同种序列进行分析。结果表明，基于16S rDNA、CO I基因和ITS2序列，...

【文章页数】：54 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 枝角类概述
    1.2 传统的分类方法及缺陷
第二章 分子系统学
    2.1 分子系统学常用方法介绍
    2.2 系统分析方法简介
    2.3 枝角类分子系统学研究进展
第三章 溞属枝角类 DNA 序列分析及分子系统学研究
    3.1 材料与试剂
        3.1.1 实验材料
        3.1.2 主要仪器设备与试剂
    3.2 实验方法
        3.2.1 基因组 DNA 提取
        3.2.2 溞属基因组 DNA 的检测
        3.2.3 溞属动物所用的分子标记
        3.2.4 PCR 扩增引物及条件
        3.2.5 PCR 扩增产物的检测与序列测定
        3.2.6 系统发生分析
    3.3 结果
        3.3.1 基于 16S rDNA 序列的系统发生分析
        3.3.2 基于 CO I 基因序列的系统发育分析
        3.3.3 基于 ITS 2 基因序列的系统发育分析
    3.4 讨论
        3.4.1 有关几种争议溞类的命名和分类地位的探讨
        3.4.2 四种溞类的系统进化关系分析
第四章 裸腹溞属枝角类 DNA 序列分析及分子系统学研究
    4.1 材料与方法
        4.1.1 实验材料
        4.1.2 基因组 DNA 提取
        4.1.3 PCR 扩增及序列测定
        4.1.4. 系统发生分析
    4.2 结果
    4.3 讨论
        4.3.1 三种裸腹溞的 16S rDNA 序列分析
        4.3.2 三种裸腹溞的系统分类探讨
第五章 小结
参考文献
攻读硕士学位期间出版或发表的论著、论文
致谢



本文编号：3806146