养殖密度对墨吉明对虾肠道和生物絮团菌群的影响

发布时间：2023-05-07 05:51

　　运用Miseq高通量测序技术,分析高、中、低3种养殖密度(700、300、100尾/m3)下墨吉明对虾肠道和其养殖系统中生物絮团的菌群结构。结果显示:对虾肠道菌群中,高密度组的丰富度和多样性均最高,丰富度随放养密度的增大而增加,而在生物絮团菌群中,高密度组的丰富度最低;在门水平上,肠道和絮团样本菌群均以变形菌门(相对丰度49.25%～80.33%)、放线菌门、拟杆菌门、绿弯菌门为主,但丰度差异较大;在属水平上,优势菌属的组成和所占比例明显不同,梭菌属、Spongiibacter、Faecalibacterium、Rhodovulum、Blautia仅在肠道样本中存在,Coccinimonas仅在絮团样本中存在;肠道样本中,中密度组弧菌属的相对丰度最小,为5.23%,高密度组弧菌属的相对丰度最大,为23.39%,絮团样本中,低密度组弧菌属的相对丰度最大,为16.15%,中、高密度弧菌属的相对丰度均较小,分别为5.51%和4.20%;随养殖密度增大,肠道样本中拟杆菌属的相对丰度减小,分别为1.36%、0.41%、0.02%,而不同密度絮团样本拟杆菌属的相对丰度差异不明显。可见,生物絮团养殖...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 养殖试验
    1.3 样品采集
    1.4 DNA提取
    1.5 PCR扩增和高通量测序
    1.6 生物信息分析
    1.7 数据处理
2 结果与分析
    2.1 供试样品的物种分类
    2.2 供试样品的细菌丰富度和多样性指数
    2.3 供试样品的微生物菌群结构组成
3 结论与讨论



本文编号：3810408