奥利亚罗非鱼遗传多样性相关研究

发布时间：2023-05-13 05:57

　　罗非鱼被誉为未来动物性蛋白质的主要来源之一,是联合国粮农组织(FAO)向全世界推荐养殖的主要对象,罗非鱼产业也成为我国水产养殖业的支柱产业之一。本研究采用奥利亚罗非鱼为实验材料,采用分子生物学的方法,对奥利亚罗非鱼的遗传多样性进行了一系列的研究,希望对我国罗非鱼产业的发展起到一定的促进作用。主要研究结果如下： 1.对两个奥利亚罗非鱼群体的70个个体的mtDNA D-loop区序列进行了研究,整段序列大小为1000bp左右。那马群体的变异位点数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数、平均核苷酸差异数分别为24、0.795、0.00176、1.640,武鸣群体的变异位点数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数、平均核苷酸差异数分别为25、0.822、0.00191、1.788。两个群体70尾个体总共检测出32种单倍型,共享单倍型为6个,分布最为广泛的单倍型是Hap₂4。单倍型系统发育树结果显示,两个群体的奥利亚罗非鱼先与尼罗罗非鱼聚成一支,然后与萨罗罗非鱼聚为一支,最后再分别与虹鳟、鲈鱼、香鱼、鲤鱼和斑马鱼聚为一支。两个群体的个体交错在一起,没有体现出地理差异性,表明群体...

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1 前言
        1.1 我国罗非鱼产业现状
        1.2 我国罗非鱼养殖现状
        1.3 我国罗非鱼产业面临的问题
    2 线粒体DNA(mtDNA)及其研究概况
        2.1 线粒体DNA的结构组成
        2.2 mtDNA控制区、CoI、Cyt b基因的属性
    3 微卫星DNA及其研究概况
        3.1 微卫星DNA
        3.2 微卫星标记在生物学研究的应用
    4 本研究的目的与意义
第二章 基于线粒体DNA基因序列分析不同群体的奥利亚罗非鱼遗传多样性
    2.1 实验材料、试剂及仪器
        2.1.1 实验材料
        2.1.2 实验主要试剂
        2.1.3 实验主要仪器
    2.2 实验方法
        2.2.1 奥利亚罗非鱼总DNA的提取
        2.2.2 引物合成
        2.2.3 PCR扩增
        2.2.4 PCR扩增产物回收、测序
        2.2.5 数据分析
    2.3 结果与分析
        2.3.1 线粒体DNA D-loop区基因序列分析结果
        2.3.2 线粒体DNACoI基因序列分析结果
        2.3.3 线粒体DNA Cytb基因序列分析结果
        2.3.4 序列单倍型分析
        2.3.5 mtDNA D-loop区基因的单倍型系统发育树
        2.3.6 mtDNA COI基因的单倍型系统发育树
        2.3.7 mtDNA Cytb基因的单倍型系统发育树
    2.4 讨论
        2.4.1 两个奥利亚罗非鱼群体mtDNA基因序列的遗传变异分析
        2.4.2 两个奥利亚罗非鱼群体mtDNA基因序列的遗传多样性
        2.4.3 系统发育建树方法的选择
        2.4.4 奥利亚罗非鱼单倍型系统进化树分析
    2.5. 结论
第三章 基于微卫星分子标记对奥利亚罗非鱼遗传多样性的研究
    3.1 实验材料、试剂及仪器
        3.1.1 实验材料
        3.1.2 实验主要试剂
        3.1.3 实验主要仪器
    3.2 实验方法
        3.2.1 奥利亚罗非鱼总DNA的提取
        3.2.2 引物合成
        3.2.3 PCR扩增
        3.2.4 PCR扩增产物检测
        3.2.5 聚丙烯酰胺凝胶板的制备
        3.2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳
        3.2.7 银染显色
        3.2.8 结果记录及数据分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 PAGE凝胶电泳结果
        3.3.2 奥利亚罗非鱼群体位点多态性分析
        3.3.3 奥利亚罗非鱼群体的遗传分化与基因流
    3.4 讨论
        3.4.1 尼罗罗非鱼微卫星引物在奥利亚罗非鱼中的适用性
        3.4.2 奥利亚罗非鱼群体的遗传多样性
        3.4.3 影响奥利亚罗非鱼种群的因素
    3.5 结论
参考文献
附录
致谢
攻读硕士学位期间发表的论文



本文编号：3815445