正常和低品质中华绒螯蟹肠道菌群结构的比较分析

发布时间：2023-05-18 04:11

　　为探讨正常与低品质中华绒螯蟹的肠道菌群结构差异,采用高通量测序技术,测定细菌16S rDNA V3 V5区基因序列,通过生物信息学方法,分析比较肠道菌群结构和多样性以及可培养菌群结构的特点。结果表明,中华绒螯蟹正常组(NG)肠道中绝对优势菌群为厚壁菌门(93.54%),而其他门的丰度均很低(2.81%以下),其中以厚壁菌门的乳球菌属丰度最高(86.00%);低品质组(LG)以厚壁菌门(62.60%)、变形菌门(22.42%)、拟杆菌门(5.74%)和软壁菌门(5.69%)为主,其中以厚壁菌门的尚无属名的ZOR0006(46.20%)和变形菌门的Caedibacteraceae uncultured(21.33%)丰度最为优势,厚壁菌门的乳卵属(5.81%)和乳球菌属(4.63%)以及软壁菌门的Candidatus Bacilloplasma属(5.26%)丰度较高。低品质组肠道中与营养代谢和生长相关的厚壁菌门显著降低和拟杆菌门显著增加,通过提高肠道中厚壁菌门和减少拟杆菌门丰度从而降低两门间的丰度比,有望减少低品质河蟹的出现。可培养菌群的分析,正常培养组(NCG)绝对优势菌群为变形菌门(...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验蟹和肠道菌群的采集
        1.1.1 试验蟹
        1.1.2 肠道菌群
        1.1.3 肠道可培养菌群
    1.2 细菌DNA提取和PCR扩增
    1.3 16S rDNA高通量测序及数据分析处理
2 结果与分析
    2.1 正常河蟹与低品质河蟹的特征
    2.2 OTU聚类、分类学分析、多样性指数分析
    2.3 菌群结构组成及相对丰度
    2.4 河蟹肠道中菌群相关性分析
    2.5 肠道中菌群差异性分析
3 讨论
    3.1 肠道菌群的分析方法
    3.2 肠道菌群的影响因素
    3.3 肠道菌群结构特点和减少低品质河蟹的途径
    3.4 肠道中可培养菌群结构



本文编号：3818649