中国蛏蚌属的父系与母系线粒体基因组全序列及淡水蚌类系统发育基因组学研究

发布时间：2024-02-14 07:05

　　淡水蚌类(双壳纲：蚌目)广泛分布于世界各地，是淡水生态系统中最重要的生物类群之一。中国长江中下游地区淡水蚌类种类繁多，主要基于贝壳形态学特征的种类鉴定使得一些蚌科物种的种名有效性仍存在争议，属及其以上阶元的分类混乱。 双壳纲中蚌目、贻贝目和帘蛤目的线粒体遗传模式是特殊的双重单亲遗传，存在父系和母系两种高度分化并与性别相关的线粒体基因组，且两种线粒体分布具有组织特异性。基于线粒体基因组全序列的系统发育分析能够增强系统树的解析度和数据置信度，适用于各阶元的系统发育关系。 蛏蚌属(Solenaia)是亚洲特有属，中国目前能采集到活体样本的蛏蚌有3种且均为中国特有种，分别是龙骨蛏蚌S. carinatus、橄榄蛏蚌S. oleivorus以及河蛏蚌S. rivularis。因食用需求的大量捕捞，以及人类活动导致的栖息地退化、改变和破碎化，蛏蚌属物种的分布范围日益狭窄、种群数量急剧下降。仅基于贝壳形态或解剖学特征，蛏蚌属属上单元分类仍具有争议，相关遗传信息也少见报道。 本研究首次报道龙骨蛏蚌、橄榄蛏蚌以及河蛏蚌的父系与母系线粒体基因组全序列，其中所测定的父系线粒体全基因组为中国淡水蚌类中首次报道...

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【部分图文】：

图1.1Heude(1874-1885)描述的龙骨蛏蚌、橄榄蛏蚌、河蛏蚌和三角蛏蚌的原稿图例（大小未按比例绘制）

图1.1Heude(1874-1885)描述的龙骨蛏蚌、橄榄蛏蚌、河蛏蚌和三角蛏蚌的原稿图例（大小未按比例绘制）Figure1.1OriginalfiguresofSolenaiacarinatus,S.oleivorus,S.rivularis,a....

图3.1蛏蚌属父系与母系线粒体基因组的基因排列图示

22个tRNA基因，以及1个全新的性别特异ORF（即雌性特异FORF和雄性特异MORF）。父系和母系线粒体中，典型的37个线粒体基因中的11个基因是在重链上编码，剩余的26个基因都是在轻链上编码（图3.1）。蛏蚌线粒体的38个基因经注释后发现，父系....

图3.2三种蛏蚌父系与母系线粒体基因组中推测控制区串联重复单元的茎环结构

图3.2三种蛏蚌父系与母系线粒体基因组中推测控制区串联重复单元的茎环结构。A：龙骨蛏蚌，B：橄榄蛏蚌，C：河蛏蚌。1：父系线粒体基因组，2：母系线粒体基因组。Figure3.2Stem-loopstructurespredictedfortandemrepeat....

图4.1蚌目线粒体基因排列（基因长度未按比例绘制）

34图4.1蚌目线粒体基因排列（基因长度未按比例绘制）Figure4.1Mitochondrialgeneordersofunionoids.Genesegmentsarenotdrawntoscale.

本文编号：3897923