河川沙塘鳢MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA的克隆与表达分析

发布时间：2024-02-27 05:42

　　河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)为我国特有的小型淡水底栖肉食性经济鱼类,目前对河川沙塘鳢的研究主要集中在选育种和养殖等方面,对其免疫相关基因和抗病因子研究未见报道。因此,开展河川沙塘鳢的免疫相关基因(因子)研究,初步了解其免疫应答机制,对河川沙塘鳢病害防治和开辟河川沙塘鳢抗病育种新途径具有重要意义。本研究以河川沙塘鳢为研究对象,采用RACE、实时荧光定量PCR等技术,对该鱼的MHCⅡA、MHCⅡB、MyD88和TLR2 4个基因进行了克隆和表达模式分析。主要研究结果如下:1、获得了河川沙塘鳢MHCⅡA、MHCⅡB、MyD88和TLR2基因的全长cDNA序列,分别为884bp、896bp、1445bp和3473bp;预测其包括开放阅读框(ORF)分别为 711bp、726bp、726bp 和 2631bp,分别编码 236、241、288 和 876 个氨基酸;其 5’UTR分别为 19bp、20bp、31bp 和 75bp,3’UTR 分别为 154bp、150bp、557bp 和 767bp。4个基因的3’UTR均有脊椎动物典型的加尾信号AATAAA,以及...

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
    1.1 河川沙塘鳢研究进展
    1.2 鱼类的免疫(抗病)基因的研究进展
        1.2.1 鱼类免疫系统
        1.2.2 MHC基因研究进展
        1.2.3 TLR2和MyD88基因研究进展
    1.3 本研究的主要内容和目的意义
第二章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因的克隆与序列分析
    2.1 材料与方法
        2.1.1 实验材料
        2.1.2 主要仪器设备
        2.1.3 主要试剂
        2.1.4 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA全长的获得
        2.1.5 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因序列生物信息学分析
    2.2 结果与分析
        2.2.1 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因cDNA全长序列特征
        2.2.2 信号肽预测
        2.2.3 蛋白结构和功能预测
        2.2.4 同源性和系统进化分析
    2.3 讨论
第三章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因的组织表达特异性分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 实验材料
        3.1.2 主要仪器设备
        3.1.3 主要试剂
        3.1.4 健康河川沙塘鳢不同组织表达特异性分析
    3.2 实验结果与分析
    3.3 讨论
第四章 MHCⅡ、MyD88和TLR2基因应对嗜水气单胞菌感染下的mRNA水平表达
    4.1 材料与方法
        4.1.1 实验材料
        4.1.2 主要仪器设备
        4.1.3 主要试剂
        4.1.4 菌液制备
        4.1.5 人工感染后不同时期不同组织表达水平变化的分析
    4.2 实验结果与分析
        4.2.1 嗜水气单胞菌感染后MHCⅡA基因表达变化
        4.2.2 嗜水气单胞菌感染后MHCⅡB基因表达变化
        4.2.3 嗜水气单胞菌感染后MyD88基因表达变化
        4.2.4 嗜水气单胞菌感染后TLR2基因表达变化
    4.3 讨论
第五章 全文小结与展望
    5.1 全文小结
    5.2 展望
参考文献
在读期间发表的学术论文与研究成果
致谢



本文编号：3912456