蛤仔AMPK/SIRT/PPAR特征分析及干露胁迫下响应研究

发布时间：2024-10-02 21:24

　　蛤仔作为典型的滩涂埋栖型贝类,生活在海洋与陆地过渡的潮间带区域。除每天在经历数小时的干露胁迫下,需应对温度、溶解氧、水中CO₂、盐度及pH等环境条件的复杂变化。在蛤仔全基因组的基础上,研究干露胁迫下蛤仔能量代谢相关的AMPKs、SIRTs、PPARs基因家族响应机制,对揭示蛤仔滩涂生活适应性具有重要意义,同时也为滩涂贝类抗逆研究提供重要参考。在蛤仔基因组中,选取能量代谢相关基因基因家族:AMPKs、PPARs和SIRTs作为研究对象。通过生物信息学方法分析表明,蛤仔AMPKs包含AMPKα、AMPKβ和AMPKγ三个亚基。开放阅读框长度分别为1722、837和1137bp,编码595、284和392个氨基酸,预测相对分子量范围为30.83-64.55kDa,等电点范围是6.28-8.69。基因结构分析表明:AMPKα含21个外显子,AMPKβ含8个外显子,AMPKγ含12个外显子。系统发育分析表明,蛤仔和福寿螺AMPKα/β/γ亲缘关系较近。蛤仔SIRT基因家族鉴定出五种亚型,分别命名为SIRT1、SIRT2、SIRT4、SIRT6和SIRT7,开放阅读框长度分别为...

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【部分图文】：

图2-2.蛤仔AMPKrandomcoil蛋白二级结构预测

注：圆柱形代表α螺旋，箭头代表β折叠，横线代表无规卷曲Note：Thecylindricalshapesindicateα-helix,thearrowsindicatetheβ-fold,andthehorizontallinesindicateth....

图2-3.蛤仔AMPKtapes蛋白三级结构预测

注：圆柱形代表α螺旋，箭头代表β折叠，横线代表无规卷曲Note：Thecylindricalshapesindicateα-helix,thearrowsindicatetheβ-fold,andthehorizontallinesindicateth....

图2-4.蛤仔与其他物种AMPK种The蛋白多序列比对及功能域Fig2-4.MultiplesequencealignmentandfunctionaldomainofAMPKα/β/γproteinbetweenRuditapesphilippinarumandotherspecies

19注：黑色部分为保守氨基酸，灰色部分为相似氨基酸Note:Theblackpartareconservedaminoacid,thegraypartaresimilaraminoacid图2-4.蛤仔与其他物种AMPK种The蛋白多序列比....

图2-6.蛤仔不同发育时期及不同组织中AMPKα/β/γ相对表达量Fig2-6.RelativeexpressionlevelsofAMPKα/β/γindifferentdevelopmentalstagesandtissuesof

肌）AMPK表达进行分析。AMPK在五种组织中均有一定表达，其中在性腺，鳃和肠组织中表达水平较高（图6）。肠中AMPKα表达量最高，其次是性腺和鳃，在闭壳肌和外套膜中表达很低；AMPKβ和AMPKγ在五中组织中表达模式类似，均在鳃组织中表达量最高，其次是肠组织（图....

本文编号：4006373