G0S2基因对黄山黑鸡肌内脂肪调控机制及冷鲜鸡肉保鲜技术的研究

发布时间：2020-11-09 10:42

　　 肌肉中的脂肪含量对鸡肉的嫩度和风味会产生重要的影响,研究肌内脂肪代谢调控机制对改善鸡肉风味及嫩度具有重要意义。而为了保证鸡肉的品质,我们在改善其风味和嫩度的同时还需要对其进行保鲜,以此来抑制肉中腐败微生物的生长,保持鸡肉原有的鲜美。本研究选取10只黄山黑鸡,取其大腿肌肉组织,利用索氏抽提法测量肌肉中脂肪的含量。根据肌内脂肪含量的结果选取表型差异极其显著的两组(每组2个样),即肌内脂肪含量极高组(IMFH)和肌内脂肪含量极低组(IMFL)。将两组样品进行转录组测序,筛选出14个影响肌内脂肪含量的候选基因。其中将G0/G1开关基因(G0S2)作为影响肌内脂肪含量最有希望的候选基因,并对其进行功能验证。最后,为了保证鸡肉的品质,以冷鲜鸡肉为实验材料,对其保鲜技术进行探讨。主要得出以下结果:1.肌内脂肪含量测定:采用索氏抽提法检测大腿组织中10个样本的肌内脂肪含量,挑选2组肌内脂肪含量低(2.691%和2.223%)和2组肌内脂肪含量高(5.858%和5.934%)作为实验材料。2.转录组测序筛选关键基因:共筛选出128个差异表达基因,其中34个基因下调,94个基因上调。对差异表达基因,GO和KEGG结果以及QTL映射和基因功能的综合分析,我们将G0S2,FABP4,PLIN1,SCD,LFABP,SLC1A6,SLC45A3,ACSBG1,LY86,ST8SIA5,SNAI2,HPGD,EDN2和THRSP作为影响肌内脂肪含量的14个候选基因。并且G0S2为最有希望的候选基因。3.关键基因的功能验证:构建G0S2基因的RNA干扰慢病毒表达载体,转染鸡前脂肪细胞后鉴定其干扰效率,筛选出有效干扰片段G2并进行正式实验,干扰效率可达55%。通过设置阴性对照组,将干扰组和阴性对照组进行转录组测序筛选差异表达基因。共检测到2242个差异表达基因,其中1344个基因下调,898个基因上调。通过综合分析差异表达基因、通路富集和基因功能发现,有10个脂肪代谢关键基因受G0S2基因的调节,包括ACACA、ACSL3、ACSS2、ELOVL1、FADS1、FADS2、PNPLA2、SCD、SREBP-1和PPARG。G0S2通过影响这10个脂肪代谢关键基因的表达来调控脂肪代谢过程。4.冷鲜鸡肉保鲜技术研究:研究4种单一保鲜剂即茶多酚、Nisin、溶菌酶和壳聚糖的保鲜作用。
【学位单位】：合肥工业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2019
【中图分类】：TS251.55
【部分图文】：

图 2.1 测序错误率分布图Fig 2.1 Distribution of error ratio of RNA-seq注：横坐标表示的是 reads 的碱基位置，纵坐标表示的是单碱基的错误率GC 含量的分布检查是用来检测有没有 AT 和 GC 分离的现象，但是这类情况多是测序也有可能是建库的时候带来的，而且可能会对后续的定量分析产生影响，如图 2.2 所示是四个样品的 GC 含量分布图。从图中可看出 GC 含量的分布总体呈水平线，并没有 AT、GC 分离现象。然而前 6-7 个碱基却呈现比较大的波动。对Illumina 测序来讲，因为随机引物扩增会产生偏差，测序所得的每一个 read 前 6-7个碱基呈现较大的波动是正常情况。

图 2.2 转录组测序 GC 含量分布见图Fig 2.2 Base quality statistics of RNA-seq：横坐标表示的是 reads 的碱基位置，纵坐标表示的是每个碱基所占的比例；不同的碱基由不同颜色表示经由原始数据过滤、测序错误率检查、GC 含量分布检查，会取得后面分析用的 clean reads，数据汇总见表 2.4 所示。表 2.4 数据产出质量情况一览表Tab 2.4 Data output quality listamplenameRaw readsCleanreadscleanbasesErrorrate(%)Q20(%)Q30(%)GC content(%)MFH1 62285352 60063910 9.01G 0.02 96.57 91.82 51.21

图 2.3 转录组测序数据在参考基因组不同区域的分布情况Fig 2.3 The distribution of RNA-Seq reads mapped to reference genome in different regions
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本文编号：2876301