鱼籽蛋白抗老年痴呆活性肽的高效筛选与工厂设计
发布时间：2021-09-29 17:12
本文以大西洋鲑鱼、鲫鱼、鳀鱼、日本鳗鲡和鲤鱼的鱼籽蛋白为主要原料,通过在线数据库虚拟酶解,对酶解产物活性肽的生物活性、水溶性和毒性等性质进行预测,并结合分子对接技术筛选出具有乙酰胆碱酯酶（AChE）、丁酰胆碱酯酶（BChE）和β-淀粉样前体蛋白裂解酶1（BACE1）抑制活性的二肽和三肽。通过分子对接技术对其分子结合机制进行研究,并进行工厂设计,旨在为鱼籽蛋白资源的利用以及活性肽的开发提供理论依据。主要研究结果如下:1.通过在线工具ExPASy PeptideCutter对大西洋鲑鱼鱼籽蛋白、鲫鱼鱼籽蛋白、鳀鱼鱼籽蛋白、鲤鱼鱼籽蛋白和日本鳗鲡鱼籽蛋白进行虚拟水解,利用PeptideRanker、Innovagen、ToxinPred程序对获得的102个二肽和三肽的生物活性、水溶性、毒性等性质进行预测,并结合分子对接筛选得到4个具有阿尔兹海默症（AD）抑制活性的三肽WIR、MIR、FQK和YPR,其中WIR的AD抑制活性最高,其对AChE和BACE1抑制的IC50值分别为43.32±1.22μM和2.27±0.35 mM,对BChE在1.06±0.87 mM浓度时抑制...
【文章来源】：渤海大学辽宁省
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线图
鱼籽蛋白抗老年痴呆活性肽的高效筛选与工厂设计18(c)图2AChE(a)、BChE(b)和BACE1(c)蛋白结构图Fig.2CrystalstructureofAChE、BChEandBACE13.2.2.3抑制肽与AChE、BChE和BACE1的分子对接使用DiscoveryStudio2017R2Client（DS）软件的CDOCKER模块将AChE、BChE和BACE1与活性肽分别进行半柔性对接，对预测的AChE、BChE和BACE1-肽相互作用位点及结合模式进行分析。每个分子生成的对接构像数目设置为10，其它参数为软件系统的默认值。根据软件中“-CDOCKER_INTERACTION_ENERGY”和“-CDOCKER_ENERGY”打分函数的打分数值，获得AChE、BChE和BACE1-肽复合物的最佳结合构象，并分析其结合位点与相互作用机制。3.3结果与讨论3.3.1AD抑制肽与AChE互作机制分析CDOCKER使用的打分函数为“-CDOCKER_ENERGY”，三肽WIR、YPR、MIR和FQK与AChE的对接打分值分别为76.5174、59.4246、69.7102和88.7739kcal/mol。在DS软件中将三肽WIR、YPR、MIR和FQK与AChE蛋白结构进行分子对接，并从复合物产生的10种构像中选择最紧密结合的一种复合物（通常选择列表第一位的复合物结构），即AChE-WIR（图3）、AChE-YPR（图4）、AChE-MIR（图5）、AChE-FQK（图6）。
渤海大学硕士学位论文19在DS视图框中，可以通过改变受体和配体的可见性与其分子结构的方向，来观察其相互作用关系。左图是对接复合物的3D结构模型图，右图是对接复合物氨基酸残基分子间相互作用的2D模型图。图3AChE-WIR分子对接3D及2D模型图Fig.3BindingconformationsofAChE-WIR图4AChE-YPR分子对接3D及2D模型图Fig.4BindingconformationsofAChE-YPR
【参考文献】：
期刊论文
[1]老年性痴呆的治疗药物研究进展[J]. 杜正彩,范氏芳草,张明哲,陈章美,侯小涛,邓家刚. 广西中医药大学学报. 2019(03)
[2]鱼籽多肽降糖及抗氧化活性评价[J]. 张丽娜,董新亮,王利涛,裴栋,王宁丽,魏鉴腾,刘晔玮. 食品科技. 2019(08)
[3]海洋生物活性肽药物应用的研究进展[J]. 崔琪,陈敬蕊,姜秀云,官丽莉,刘树明,孔令聪,马红霞. 中国海洋药物. 2019(02)
[4]生物活性肽功能分类及研究进展[J]. 马文领,秦铁军,孙永华. 中华损伤与修复杂志(电子版). 2019(02)
[5]克氏原螯虾虾头模拟胃肠道消化产物中ACE抑制肽的分离纯化与鉴定[J]. 李锐,邹茜,孙玉林,王林,冯明会,李想. 食品与发酵工业. 2019(06)
[6]阿尔茨海默病的发病机制研究进展[J]. 田杰,孙荣欣,王萍,谭国鹤,刘斯佳. 山东医药. 2018(27)
[7]不同干燥方式对鱼籽多肽性状和抗氧化活性的影响[J]. 郝玉伟,魏鉴腾,陈长军,裴栋,刘晔玮,邸多隆. 食品工业. 2018(04)
[8]超临界萃取鱼卵鱼油及其脂肪酸组成的研究[J]. 许艳萍,梁鹏,陈丽娇,程文健,赵卉双,钟机. 食品科技. 2015(10)
[9]分子对接软件在药物设计中的应用[J]. 赵晨,夏春光,于敏,潘月,王辂. 中国抗生素杂志. 2015(03)
[10]酶解法制备鱼籽多肽的工艺研究[J]. 魏鉴腾,刘永峰,刘毅,裴栋,邸多隆. 食品工业. 2015(01)
博士论文
[1]多巴胺、5-羟色胺和谷氨酸递质系统相关基因与人类认知能力的关系研究[D]. 龚平原.西北大学 2010
硕士论文
[1]丝胶蛋白源ACE抑制多肽的筛选及其抑制机理研究[D]. 孙华菊.广西大学 2018
[2]发酵豆制品中乙酰胆碱酯酶抑制剂的分离纯化研究[D]. 宋庆.上海师范大学 2011
本文编号：3414115
【文章来源】：渤海大学辽宁省
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线图
鱼籽蛋白抗老年痴呆活性肽的高效筛选与工厂设计18(c)图2AChE(a)、BChE(b)和BACE1(c)蛋白结构图Fig.2CrystalstructureofAChE、BChEandBACE13.2.2.3抑制肽与AChE、BChE和BACE1的分子对接使用DiscoveryStudio2017R2Client（DS）软件的CDOCKER模块将AChE、BChE和BACE1与活性肽分别进行半柔性对接，对预测的AChE、BChE和BACE1-肽相互作用位点及结合模式进行分析。每个分子生成的对接构像数目设置为10，其它参数为软件系统的默认值。根据软件中“-CDOCKER_INTERACTION_ENERGY”和“-CDOCKER_ENERGY”打分函数的打分数值，获得AChE、BChE和BACE1-肽复合物的最佳结合构象，并分析其结合位点与相互作用机制。3.3结果与讨论3.3.1AD抑制肽与AChE互作机制分析CDOCKER使用的打分函数为“-CDOCKER_ENERGY”，三肽WIR、YPR、MIR和FQK与AChE的对接打分值分别为76.5174、59.4246、69.7102和88.7739kcal/mol。在DS软件中将三肽WIR、YPR、MIR和FQK与AChE蛋白结构进行分子对接，并从复合物产生的10种构像中选择最紧密结合的一种复合物（通常选择列表第一位的复合物结构），即AChE-WIR（图3）、AChE-YPR（图4）、AChE-MIR（图5）、AChE-FQK（图6）。
渤海大学硕士学位论文19在DS视图框中，可以通过改变受体和配体的可见性与其分子结构的方向，来观察其相互作用关系。左图是对接复合物的3D结构模型图，右图是对接复合物氨基酸残基分子间相互作用的2D模型图。图3AChE-WIR分子对接3D及2D模型图Fig.3BindingconformationsofAChE-WIR图4AChE-YPR分子对接3D及2D模型图Fig.4BindingconformationsofAChE-YPR
【参考文献】：
期刊论文
[1]老年性痴呆的治疗药物研究进展[J]. 杜正彩,范氏芳草,张明哲,陈章美,侯小涛,邓家刚. 广西中医药大学学报. 2019(03)
[2]鱼籽多肽降糖及抗氧化活性评价[J]. 张丽娜,董新亮,王利涛,裴栋,王宁丽,魏鉴腾,刘晔玮. 食品科技. 2019(08)
[3]海洋生物活性肽药物应用的研究进展[J]. 崔琪,陈敬蕊,姜秀云,官丽莉,刘树明,孔令聪,马红霞. 中国海洋药物. 2019(02)
[4]生物活性肽功能分类及研究进展[J]. 马文领,秦铁军,孙永华. 中华损伤与修复杂志(电子版). 2019(02)
[5]克氏原螯虾虾头模拟胃肠道消化产物中ACE抑制肽的分离纯化与鉴定[J]. 李锐,邹茜,孙玉林,王林,冯明会,李想. 食品与发酵工业. 2019(06)
[6]阿尔茨海默病的发病机制研究进展[J]. 田杰,孙荣欣,王萍,谭国鹤,刘斯佳. 山东医药. 2018(27)
[7]不同干燥方式对鱼籽多肽性状和抗氧化活性的影响[J]. 郝玉伟,魏鉴腾,陈长军,裴栋,刘晔玮,邸多隆. 食品工业. 2018(04)
[8]超临界萃取鱼卵鱼油及其脂肪酸组成的研究[J]. 许艳萍,梁鹏,陈丽娇,程文健,赵卉双,钟机. 食品科技. 2015(10)
[9]分子对接软件在药物设计中的应用[J]. 赵晨,夏春光,于敏,潘月,王辂. 中国抗生素杂志. 2015(03)
[10]酶解法制备鱼籽多肽的工艺研究[J]. 魏鉴腾,刘永峰,刘毅,裴栋,邸多隆. 食品工业. 2015(01)
博士论文
[1]多巴胺、5-羟色胺和谷氨酸递质系统相关基因与人类认知能力的关系研究[D]. 龚平原.西北大学 2010
硕士论文
[1]丝胶蛋白源ACE抑制多肽的筛选及其抑制机理研究[D]. 孙华菊.广西大学 2018
[2]发酵豆制品中乙酰胆碱酯酶抑制剂的分离纯化研究[D]. 宋庆.上海师范大学 2011
本文编号：3414115
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