内蒙古锡林郭勒盟和蒙古国巴彦洪格尔省传统发酵乳制品中细菌多样性研究

发布时间：2021-12-11 15:49

　　本研究以采集自内蒙古锡林郭勒盟的12份酸马奶和蒙古国巴彦洪格尔省的16份传统发酵乳制品（包括4份酸马奶、3份酸牛奶和9份奶酪样品）样品为研究对象,采用纯培养方法法结合16S rRNA基因测序技术分离鉴定其中的乳酸菌;同时,采用PacBio单分子实时测序技术（PacBio SMRT）分析传统发酵乳中的细菌多样性,并对比分析内蒙古和蒙古国不同地区酸马奶样品中的细菌菌群结构。具体结果如下:1.传统发酵乳制品中共分离得到105株乳酸菌,鉴定为2个属,8个种,优势菌种为 Lactobacillus helveticus 和 Lactobacillus kefiranofaciens,占分离菌株的79.05%,结果表明不同类型的乳制品中乳酸菌种类不同。2.基于PacBio SMRT测序技术检测发现,内蒙古锡林郭勒地区12份酸马奶样品中的细菌归为5个门、34个属和60菌种,其中优势菌种为Streptococcus parauberis（62.82%）和Lactobacillus helveticu和（27.12%）,结果表明酸马奶样品之间的细菌多样性和相对丰度存在差异。3.基于PacBio SMRT... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３酸马奶样品的稀疏曲线（Ａ）和香农多样性曲线（Ｂ）??Ｆｉｇ．３?Ｔｈｅ?Ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅ?（Ａ）?ａｎｄ?Ｓｈａｎｎｏｎ?ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ?ｃｕｒｖｅ?（Ｂ）?ｏｆ?ｋｏｕｍｉｓｓ?ｓａｍｐｌｅｓ??

现物种数、香农指数和辛普森指数（表６）。??依据发现物种数和香农指数绘制稀疏曲线（Ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅ?）和香农曲线??（Ｓｈａｎｎｏｎ?ｃｕｒｖｅ）分析和评价测序质ｉｌ和深度。如图６屮稀疏曲线所示，测定样品??屮的测得ＯＴＵｓ数ｉｔ会随着测序深度的增加而增加，２丨测序量达到１００００时，个别??样品中依然有物种可以测到。侃香农曲线在测序位为４０００时就进入平台期，说明在??该测序深度下，样品中的细菌的多样性可以被允分展示。因此，本试验细菌测序量??可以满足后续生物信息学分析的要求。??３．?３．?２蒙古国巴彦洪格尔省传统发酵乳制品中的细菌构成??通过将ＯＴＵｓ序列与数据库ＲＤＰ、Ｇｒｅｅｎｇｅｎｅｓ和Ｓｉｌｖａ进行比对，鉴定得到隶??

ｆｒｏｍ?Ｂａｙａｎｋｈｏｎｇｏｒ?ｏｆ?Ｍｏｎｇｏｌｉａ??３．?３．?３蒙古国巴彦洪格尔省传统发酵乳制品中的ｐ多样性??基于Ｕｎｉｆｒａｃ距离的ＰＣｏＡ对三类样品进行了分析，如图８所示，第一、二主坐??标的贡献率分别为８８．８７％和５．４７％；基于１）１１＼￥＃矗保蓿ǎ保保蓿叮薜模浚ǎ蕞柊耍?谝弧⒍?鳎崳?坐标的贡献率分别为１９．７２％和１５．２９％。由图８可见，同一类型的传统发酵乳样品??

【参考文献】：
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本文编号：3534951