基于基因组学及乳清蛋白水解特性的德式乳杆菌保加利亚亚种差异性分析

发布时间：2023-02-25 21:26

　　德式乳杆菌保加利亚亚种是广泛应用于发酵乳制品生产的乳酸菌之一,具有高效的蛋白水解系统。研究表明德式乳杆菌保加利亚亚种的蛋白水解特性存在差异性,但是德式乳杆菌保加利亚亚种菌株的蛋白水解基因型差异性、乳清蛋白的利用能力仍有待进一步研究。本文以采集自青海、四川和新疆的发酵牦牛乳和曲拉等样品的24株德式乳杆菌保加利亚亚种菌株为研究对象,进行了基因草图测序;结合NCBI公布全基因组、染色体组及基因草图测序的39株德式乳杆菌的基因序列,进行包括同源进化分析、核心基因与泛基因分析和蛋白水解体系关键基因的分布等比较基因组学的研究。结果表明德式乳杆菌的泛基因组呈现开放型,仍在进行菌株的进化。COG功能注释结果表明菌株的附属&特有基因组与核心基因组相比具有更多的功能基因,蛋白水解体系关键基因分析结果表明菌株编码寡肽转运系统的OppA最具菌株多样性,编码部分肽酶的PepD、PepQ、PepO和PepI在菌株之间存在多样性,而编码胞壁蛋白酶的基因高度保守。依据基因组学的分析结果,选择了处于不同进化分支且蛋白水解相关基因差异较大的8株德式乳杆菌保加利亚亚种菌株,对其在乳清蛋白培养基中的肽酶活力和主要乳清...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 绪论
    1.1 德式乳杆菌概述
    1.2 德式乳杆菌基因组学概述
    1.3 德式乳杆菌蛋白水解体系概述
        1.3.1 胞壁蛋白酶
        1.3.2 肽转运系统
        1.3.3 胞内肽酶
        1.3.4 蛋白水解体系研究现状
    1.4 乳清蛋白肽及其制备概述
        1.4.1 乳清蛋白的组成和性质
        1.4.2 乳清蛋白肽研究进展
        1.4.3 乳酸菌发酵乳清蛋白研究现状
    1.5 本课题研究意义及主要内容
        1.5.1 立题背景及意义
        1.5.2 本课题的主要内容
2 材料与方法
    2.1 实验材料和试剂
        2.1.1 实验样品
        2.1.2 主要试剂
        2.1.3 培养基
        2.1.4 实验菌株
    2.2 实验仪器和设备
    2.3 实验方法
        2.3.1 德式乳杆菌保加利亚亚种分离纯化与鉴定
        2.3.2 基因组测序及分析方法
        2.3.3 乳清蛋白培养基中生长特性评价
        2.3.4 乳清蛋白培养基中蛋白酶活力的测定
        2.3.5 乳清蛋白培养基中乳清蛋白利用情况的测定
        2.3.6 乳清蛋白-乳糖体系中的生长特性评价
        2.3.7 乳清蛋白-乳糖体系中的肽含量的测定
        2.3.8 乳清蛋白-乳糖体系中菌株蛋白酶活力的测定
        2.3.9 乳清蛋白水解产物肽谱的测定
        2.3.10 数据统计和分析
3 结果与讨论
    3.1 德式乳杆菌保加利亚亚种的分离、纯化与鉴定结果
    3.2 德式乳杆菌的基因组分析
        3.2.1 德式乳杆菌基因组基本特征
        3.2.2 德式乳杆菌基因组同源进化分析
        3.2.3 德式乳杆菌泛基因组和核心基因组分析
        3.2.4 德式乳杆菌功能基因分析
    3.3 德式乳杆菌保加利亚亚种乳清蛋白利用特性分析
        3.3.1 生长特性分析
        3.3.2 产酸特性分析
        3.3.3 三种胞内肽酶的活力分析
        3.3.4 芳族转氨酶的活力分析
        3.3.5 乳清蛋白利用能力分析
    3.4 德式乳杆菌保加利亚亚种在乳清蛋白-乳糖体系的应用
        3.4.1 发酵特性分析
        3.4.2 多肽产量分析
        3.4.3 不同初始pH下菌株的发酵特性分析
        3.4.4 不同初始pH下菌株的多肽产量分析
        3.4.5 不同初始pH下的蛋白酶活力特性分析
        3.4.6 不同菌株的多肽鉴定结果分析
主要结论与展望
    主要结论
    展望
致谢
参考文献
附录 :作者在攻读硕士学位期间发表的论文



本文编号：3749224