中心体蛋白Nlp相关长链非编码RNA的鉴定及生物学功能研究
发布时间：2020-12-10 11:23
长链非编码 RNA（Longnon-coding RNAs,LncRNAs）是一大类长度超过 200 nt的非编码RNA,它们利用自身RNA分子参与分子间相互作用而发挥功能。这种笼统的分类方法使lncRNAs在大小、结构、功能上存在多样性和复杂性,LncRNAs主要的生物学功能涵盖了顺式/反式调控基因转录、DNA修饰、RNA剪接、蛋白质支架、蛋白质修饰、miRNA海绵等。LncRNAs广泛地与DNA、RNA和蛋白质发生着复杂多样的相互作用。胚胎发育、心血管疾病、肿瘤发生发展过程中发现不少具有重要角色的lncRNAs。目前对lncRNAs的了解仅仅是冰上一隅,鉴于此我们开展了针对lncRNAs-蛋白质互作的研究,旨在探究lncRNAs-蛋白质相互作用在肿瘤细胞中的生物学功能。Nlp（Ninein like protein）是中心体γ-Tubulin环状复合物的重要成员,Nlp结合到γ-Tubulin定位到中心体上,参与了中心体复制、中心体成熟、微管锚定、有丝分裂纺锤体形成等众多细胞周期事件并发挥重要作用,Nlp表达的异常通常会引起中心体结构和数量的异常,导致单极或多极有丝分裂和核分裂细胞...
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：145 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－?１?ＬｎｃＲＮＡｓ在基因组上位置??
?Ｇｅｎｅ?Ｂ??Ｇｅｎｏｍｉｃ?Ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＩｎｃＲＮＡｓ??图１－?１?ＬｎｃＲＮＡｓ在基因组上位置??图?１－１?Ｔｈｅ?Ｇｅｎｅ?ｌｏｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＬｎｃＲＮＡｓ??ａｎｄ?Ｊｏｈｎｓｏｎ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１２）。基因ＩｎｃＲＮＡ则进一步被细分为与蛋白编码基因基因座正??向或反向（ｓｅｎｓｅ?ａｎｄ?ａｎｔｉｓｅｎｓｅ）重叠，以及与蛋白编码基因的外显子或内含子重叠??等类型（如图?１－１?所示）（Ｚｈａｎｇ?ａｎｄ?Ｌｉｕ?ｅｔａｌ．，２００６；?Ｊｉａ?ａｎｄ?Ｏｓａｋ?ｅｔａｌ．?，２０１０）。??因此，ＬｎｃＲＮＡｓ最常见的命名原则即是基于它们的基因组位置和位置最近蛋白??编码基因的信息。人类基因组组织（ＨｕｍａｎＧｅｎｏｍｅＯｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ）下属的基因命名??委员会（Ｔｈｅ?ＨＵＧＯ?Ｇｅｎｅ?Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ?Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ，?ＨＧＮＣ）是唯一被授权对人类基??１４??
分是缺乏传统的ＲＢＤｓ的（Ｇａｒｃｉａ－Ｍｏｒｅｎｏ?ａｎｄ?Ｊａｒｖｅｌｉｎ?ｅｔ?ａｌ．，２０１８）。目前为止研究得??十分清楚的?ＲＢＤｓ?主要有?ＲＲＭ?（ＲＮＡｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ?ｍｏｔｉｆ）、ＫＨ?（ｈｎＲＮＰＫ?ｈｏｍｏｌｏｇｙ??ｄｏｍａｉｎ）、ＤＥＡＤ?ｂｏｘ?ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ三大类（图１－３Ａ），我们将包含这些结构域的??ＲＮＡ结合蛋白与ＲＮＡ的结合称作传统的结合方式，而大量组学数据库中新鉴定出??的没有己知ＲＤＢｓ的ＲＮＡ结合蛋白与ＲＮＡ的结合方式称为非经典结合。查阅相关??文献对这两类ＲＮＡ和蛋白质间结合方式做简要介绍。??４．１经典的ＲＮＡ结合蛋白与ＲＮＡ结合模式??（１）包含经典的ＲＲＭ结构的ＲＮＡ结合蛋白通常会结合到拥有颈环结构的??ＲＮＡ上，这种结合对ＲＮＡ的作用是对ＲＮＡ进行加工、改变其亚细胞定位、稳定??ＲＮＡ的结构以及调控ｍＲＮＡ的翻译（ＬｕｎｄｅａｎｄＭｏｏｒｅｅｔａｌ．，２００７：）。（２）真核生物翻??译起始因子?４Ｆ?（ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ?ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ?ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ?ｆａｃｔｏｒ?４Ｆ，?ｅＩＦ４Ｆ）与帽子结构结合蛋??白ｅＩＦ４Ｅ、ｅＩＦ４Ｇ以及解旋酶ｅＩＦ４Ａ组成的复合物特异地与ｍＲＮＡ?５‘端帽子结构结??合起始蛋白质翻译过程（Ｐｒｅｖｏｔ?ａｎｄ?Ｄａｒｌｉｘ?ｅｔ?ａｌ．，２００３）。（?３）外显子结合点复合物（Ｅｘｏｎ??ｊｕｎｃｔｉｏｎ?ｃｏｍｐｌｅｘ，?ＥＪＣ）通过与结合在外显子－外显子结合点上游２０个核苷酸位置处??的拼接因子ＣＷＣ２２的结合
【参考文献】：
博士论文
[1]细胞周期调控蛋白Nip在DNA损伤修复中的生物学功能和分子机制研究[D]. 马小娟.北京协和医学院 2015
[2]Aurora B对Bacp/Nlp的磷酸化调控及其参与胞质分裂的机制研究[D]. 晏杰.北京协和医学院 2009
[3]中心体蛋白Bacp/Nlp与乳腺癌紫杉醇化疗敏感性的相关性研究[D]. 赵卫红.中国协和医科大学 2007
[4]BACP在细胞基因组稳定性中的作用研究[D]. 高华.中国协和医科大学 2006
本文编号：2908610
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：145 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－?１?ＬｎｃＲＮＡｓ在基因组上位置??
?Ｇｅｎｅ?Ｂ??Ｇｅｎｏｍｉｃ?Ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＩｎｃＲＮＡｓ??图１－?１?ＬｎｃＲＮＡｓ在基因组上位置??图?１－１?Ｔｈｅ?Ｇｅｎｅ?ｌｏｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＬｎｃＲＮＡｓ??ａｎｄ?Ｊｏｈｎｓｏｎ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１２）。基因ＩｎｃＲＮＡ则进一步被细分为与蛋白编码基因基因座正??向或反向（ｓｅｎｓｅ?ａｎｄ?ａｎｔｉｓｅｎｓｅ）重叠，以及与蛋白编码基因的外显子或内含子重叠??等类型（如图?１－１?所示）（Ｚｈａｎｇ?ａｎｄ?Ｌｉｕ?ｅｔａｌ．，２００６；?Ｊｉａ?ａｎｄ?Ｏｓａｋ?ｅｔａｌ．?，２０１０）。??因此，ＬｎｃＲＮＡｓ最常见的命名原则即是基于它们的基因组位置和位置最近蛋白??编码基因的信息。人类基因组组织（ＨｕｍａｎＧｅｎｏｍｅＯｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ）下属的基因命名??委员会（Ｔｈｅ?ＨＵＧＯ?Ｇｅｎｅ?Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ?Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ，?ＨＧＮＣ）是唯一被授权对人类基??１４??
分是缺乏传统的ＲＢＤｓ的（Ｇａｒｃｉａ－Ｍｏｒｅｎｏ?ａｎｄ?Ｊａｒｖｅｌｉｎ?ｅｔ?ａｌ．，２０１８）。目前为止研究得??十分清楚的?ＲＢＤｓ?主要有?ＲＲＭ?（ＲＮＡｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ?ｍｏｔｉｆ）、ＫＨ?（ｈｎＲＮＰＫ?ｈｏｍｏｌｏｇｙ??ｄｏｍａｉｎ）、ＤＥＡＤ?ｂｏｘ?ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ三大类（图１－３Ａ），我们将包含这些结构域的??ＲＮＡ结合蛋白与ＲＮＡ的结合称作传统的结合方式，而大量组学数据库中新鉴定出??的没有己知ＲＤＢｓ的ＲＮＡ结合蛋白与ＲＮＡ的结合方式称为非经典结合。查阅相关??文献对这两类ＲＮＡ和蛋白质间结合方式做简要介绍。??４．１经典的ＲＮＡ结合蛋白与ＲＮＡ结合模式??（１）包含经典的ＲＲＭ结构的ＲＮＡ结合蛋白通常会结合到拥有颈环结构的??ＲＮＡ上，这种结合对ＲＮＡ的作用是对ＲＮＡ进行加工、改变其亚细胞定位、稳定??ＲＮＡ的结构以及调控ｍＲＮＡ的翻译（ＬｕｎｄｅａｎｄＭｏｏｒｅｅｔａｌ．，２００７：）。（２）真核生物翻??译起始因子?４Ｆ?（ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ?ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ?ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ?ｆａｃｔｏｒ?４Ｆ，?ｅＩＦ４Ｆ）与帽子结构结合蛋??白ｅＩＦ４Ｅ、ｅＩＦ４Ｇ以及解旋酶ｅＩＦ４Ａ组成的复合物特异地与ｍＲＮＡ?５‘端帽子结构结??合起始蛋白质翻译过程（Ｐｒｅｖｏｔ?ａｎｄ?Ｄａｒｌｉｘ?ｅｔ?ａｌ．，２００３）。（?３）外显子结合点复合物（Ｅｘｏｎ??ｊｕｎｃｔｉｏｎ?ｃｏｍｐｌｅｘ，?ＥＪＣ）通过与结合在外显子－外显子结合点上游２０个核苷酸位置处??的拼接因子ＣＷＣ２２的结合
【参考文献】：
博士论文
[1]细胞周期调控蛋白Nip在DNA损伤修复中的生物学功能和分子机制研究[D]. 马小娟.北京协和医学院 2015
[2]Aurora B对Bacp/Nlp的磷酸化调控及其参与胞质分裂的机制研究[D]. 晏杰.北京协和医学院 2009
[3]中心体蛋白Bacp/Nlp与乳腺癌紫杉醇化疗敏感性的相关性研究[D]. 赵卫红.中国协和医科大学 2007
[4]BACP在细胞基因组稳定性中的作用研究[D]. 高华.中国协和医科大学 2006
本文编号：2908610
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/2908610.html
教材专著
