拟南芥和菘蓝SEP3基因不同剪接本以及菘蓝IiSEP1和IiSEP2基因功能研究

发布时间：2020-12-31 17:39

　　本工作研究了拟南芥和菘蓝SEP3直系同源基因不同剪接本以及菘蓝E类花同源异型基因IiSEP1和IiSEP2的生物学功能。拟南芥的AtSEP3基因和菘蓝的IiSEP3基因具有同样的剪接方式,可以产生全长剪接本（AtSEP3-2与IiSEP3-2）和缺少第六个外显子的可变剪接本（AtSEP3-3与IiSEP3-3）,这种保守的剪接方式对植物生长过程可能具有重要的调节功能。IiSEP3-2、IiSEP3-3、IiSEP1和IiSEP2蛋白的N-末端都存在一个核定位信号KRIENKINRQVTFAKRR,它们均定位于细胞核中。对氨基酸序列进行分析,发现这几个蛋白质的C末端都有三个保守的基序,分别为SEP motifⅠ（FFQPLE）、SEP/AGL6motif（PILQIGY）和SEP motifⅡ（NNYMLGWLP）,所以这几种蛋白质可能具有冗余性功能。采用qRT-PCR技术对AtSEP3-2、AtSEP3-3、IiSEP3-2和IiSEP3-3四种剪接本以及IiAP1、IiSEP1和IiSEP2基因在转录水平的表达模式进行分析,结果表明IiAP1和AtAP1存在相似的表达模式,在营养生长... 

【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校

【文章页数】：185 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

可变剪接示意图

西北大学博士学位论文指在一定情况下外显子被作为内含子的一个部分，通过可变剪接方式在哺乳动物中比较常见[4]。内含子保留是也有可能会与两个外显子的侧翼相连形成一个新的外显指两个外显子中只有一个能够存在于最终的 mRNA 分上游外显子的 3′-端边界发生了改变。可变的 3′-端受体发生了改变。除了上述 5 种可变剪接方式，还有一些其和可变 poly(A)等[6]。

着 U1 snRNA 和 U4 snRNA 被释放出来，在 U2 snRNA、用下内含子弯曲，外显子靠近，pre-mRNA 结构发生改变， C。最后 U2 snRNA、U6 snRNA、U5 snRNA 和外显子得到A。释放的 UsnRNA 可以进入下一轮循环（图 1.3）[9]。除许多 RNA 结合蛋白在 mRNA 的加工、剪接位点的选择以及[8]。真核生物中，具有内含子的基因通过可变剪接可以产生多种一过程中，对不同剪接位点的识别会导致内含子保留、外显可变选择。可变剪接能够产生具有不同功能的蛋白质，加强外，可变剪接也可以在编码序列中过早地引入终止密码子，无义降解（nonsense-mediated decay）。同时，可变剪接可以率对基因表达起到调节作用[10]。

【参考文献】：
期刊论文
[1]Graft-accelerated virus-induced gene silencing facilitates functional genomics in rose flowers[J]. Huijun Yan,Shaochuan Shi,Nan Ma,Xiaoqian Cao,Hao Zhang,Xianqin Qiu,Qigang Wang,Hongying Jian,Ningning Zhou,Zhao Zhang,Kaixue Tang.  Journal of Integrative Plant Biology. 2018(01)
[2]甜樱桃成花相关MADS-box基因的克隆及表达分析[J]. 段续伟,倪杨,张晓明,闫国华,王晶,周宇,张开春.  果树学报. 2018(01)
[3]枣SEP1基因的克隆和表达分析[J]. 张力曼,冯春芳,刘孟军,赵锦.  河北农业大学学报. 2016(05)
[4]八氢番茄红素脱氢酶的研究进展[J]. 李春季,李炳学,韩晓日.  微生物学报. 2016(11)
[5]春兰CgSEP3基因的克隆和表达分析[J]. 贾春蕾,向林,秦德辉,李小白,吴超,孙崇波.  西北植物学报. 2014(07)



本文编号：2950034