梁子湖和月湖挺水植物根际Comammox菌生物多样性及丰度研究

发布时间：2021-02-23 13:05

　　硝化作用是生物地球化学循环的关键组成部分。它通常被认为有两步过程,氨首先被氧化成为亚硝酸盐,再氧化成为硝酸盐。最近有研究表明,新发现的全程氨氧化微生物（Complete ammonia oxidizer,Comammox）能独立完成氨氧化和亚硝酸盐氧化过程。目前湖泊岸边带挺水植物根际的Comammox菌的研究还比较缺乏。本论文以梁子湖和月湖岸边带挺水植物根际为研究对象,利用特异性引物进行克隆测序和定量PCR,研究湖泊中Comammox菌的群落结构和丰度,探究了氨氧化古菌（Ammonia Oxidizing Archaea,AOA）、氨氧化细菌（Ammonia Oxidizing Bacteria,AOB）和Comammox菌的共存状况以及环境因子对Comammox菌的多样性和丰度的影响,加深对湖泊氮素循环的了解,并为水体富营养化修复提供理论依据。主要研究结果如下:（1）对梁子湖和月湖挺水植物根际沉积物中的Comammox菌进行克隆测序和定量PCR,在挺水植物根际沉积物中都成功扩增到Comammox菌的特异性序列,证实了Comammox菌在梁子湖和月湖岸边带挺水植物根际沉积物中存在,为C... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

技术路线图

梁子湖和月湖挺水植物根际Comammox菌生物多样性及丰度研究25图3-2梁子湖挺水植物根际AOA、AOB和Comammox细菌与环境因子关系的RDA图(图中红色实线箭头表示环境因子，蓝色虚线箭头表示微生物丰度值，字母名称代表挺水植物采样点，N.rhizosphere:非根际R-P.australis:芦苇根际F-P.australis:芦苇远根际R-N.nucifera:荷花根际F-N.nucifera:荷花远根际R-A.calamus:菖蒲根际F-A.calamus:菖蒲根际R-P.hydropiper：水蓼根际F-P.hydropiper：水蓼远根际)Fig3-2RDAordinationplotsofrelationshipbetweenAOA、AOBandComammoxbacteriaandenvironmentalfactorsintherhizosphereofemergentmacrophytesatdifferentsamplingpointsinLakeLiangzi(Theredsolidarrowindicatestheenvironmentalfactor,thebluedottedarrowindicatesthemicrobialabundancevalueandthequantitativeratioofAnammoxtoN-DAMObacteria,andthelettersrepresenttheemergentplantsandnon-rhizospheresamplingpoints:N.rhizosphere，R-P.australis，F-P.australis，R-N.nucifera，F-N.nucifera，R-A.calamus，F-A.calamu，R-P.hydropipe，F-P.hydropiper)3.2.4梁子湖Comammox菌的群落结构及生物多样性梁子湖沉积物DNA样品中成功扩增出Comammox菌的amoA特异性序列条带。-0.61.2-0.61.0ComammoxamoAAOBamoAAOAamoApHOMTPTNNH4+-NNO3--NNO2--NN.rhizosphereR-P.australisF-P.australisR-N.nuciferaR-A.calamusF-A.calamusR-P.hydropiperF-N.nuciferaF-P.hydropiperRDA1(94.2%)RDA2(5.8%)

梁子湖和月湖挺水植物根际Comammox菌生物多样性及丰度研究27图3-3梁子湖不同采样点挺水植物根际Comammox菌的amoA基因系统发育树(本文中的参比序列来源GenBank数据库，序列后方的字母和数字为提交序列号，分支节点上的数字表示每经过1000次Bootstrap自展分析所支持的次数所占的百分比；计算方法为Jukes-Cantormodel；发育树左下方标尺表示1%序列差异的分支长度)Fig3-3Neighbour-joiningphylogenetictreeofComammoxbacteriaintherhizosphereofemergentmacrophytesatdifferentsamplingpointsinLakeLiangzi(ThereferencesequencesarefromtheGenBank,thelettersandnumbersbehindofthesequencesaresubmittedsequencenumber,thenumberonthebranchnoderepresentsthepercentageoftimessupportedbyeach1000bootstrapanalysis;ThecalculationmethodisJukes-Cantormodel,thescalebarrepresents1%sequencedivergence.)CandidatusNitrospiraInopinata(NZLN885086)Nitrospirasp.(NIUT01000226)OTU2(16/70)OTU15(1/70)freshwaterbiofilm(MF347252)sedimentsofriverreservoirandtidalflat(MG591569)OTU14(1/70)soilfromSwitzerlandAlpineglacier-forefield(LT854238)Cluster1OTU7(2/70)Surfacesoilofricefieldmicrocosm(AB222695)paddysoilofrice(MF347137)OTU11(1/70)OTU12(1/70)sedimentsofriverreservoirandtidalflat(MG591549)OTU4(8/70)sedimentsofriverreservoirandtidalflat(MG591654)wastewatertreatmantplant(MF347372)OTU8(2/70)OTU3(8/70)soilfromShanghaiChongxiWetland(KF264968)Cluster2unculturedmethanotrophicbacteriumfromsoil(FN394210)unculturedmethanotrophicbacteriumfromsoil(FN394185)OTU9(2/70)OT

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3047637