宁夏地区牛源MRSA的毒力分析及对头孢喹肟耐药的比较基因组、转录组学研究
发布时间:2021-02-25 08:54
随着抗生素的广泛使用,细菌逐渐产生了耐药性,出现了大量多药耐药菌。其中MRSA作为一种超级细菌,携带多种耐药基因,在畜牧业和动物性食品中多次被检测到,对公共卫生造成了严重的威胁。MRSA通过表达大量毒力提高菌株的致病能力与对宿主环境的适应力,其感染往往依赖于多种编码粘附蛋白、胞外酶、毒素和铁摄取等相关毒力因子的调控,使细菌产生粘附、损伤宿主细胞,逃避宿主的免疫系统并产生毒性效应等危害动物健康。因此,研究MRSA的耐药机理、毒力表达调控有助于新抗菌药物的研发及感染的临床治疗。本研究对宁夏地区牛源MRSA的毒力相关信息及对头孢喹肟耐药机制进行初步研究,为LA-MRSA的毒力研究及宁夏地区LA-MRSA的临床防治提供参考依据,为LA-MRSA对头孢喹肟的耐药机制研究奠定基础。1.采用微量肉汤稀释法对97株金黄色葡萄球菌进行18种抗菌药物敏感性试验;通过全基因组测序,重点分析LA-MRSA与MSSA携带的耐药基因、毒力因子等相关信息。结果显示97株菌株除了对替米考星、阿米卡星、利奈唑胺、万古霉素、达托霉素全部敏感外,对其他13种抗菌药物均存在不同程度的耐药,尤其青霉素、磺胺异噁唑的耐药率较高,...
【文章来源】:宁夏大学宁夏回族自治区 211工程院校
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略词表
第一章 文献综述
1.1 国内外研究现状
1.1.1 LA-MRSA的发展流行
1.1.2 MRSA的耐药机制及毒力因子调控作用
1.1.3 头孢喹肟的作用机制及耐药研究
1.1.4 细菌全基因组测序及转录组分析
1.2 研究目的与意义
第二章 LA-MRSA与MSSA的耐药性与毒力分析
2.1 试验材料
2.1.1 菌株来源
2.1.2 抗菌药物标准品
2.1.3 主要培养基和试剂
2.1.4 抗菌药物的配制
2.1.5 主要仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 牛源金黄色葡萄球菌抗菌药物敏感性试验
2.2.2 菌株基因组的提取
2.2.3 文库质检、测序及结果处理
2.2.4 数据分析
2.3 试验结果
2.3.1 药敏试验
2.3.2 基因组基本特征
2.3.3 ARDB数据库注释
2.3.4 VFDB数据库注释及重要毒力因子的比较
2.3.5 基因岛预测
2.3.6 物种系进化分析
2.4 讨论
2.4.1 耐药情况
2.4.2 毒力因子及基因岛携带情况
2.5 小结
第三章 LA-MRSA的毒力因子表达分析
3.1 试验材料
3.1.1 菌株来源与细胞系
3.1.2 主要培养基及试剂
3.1.3 主要仪器设备
3.2 试验方法
3.2.1 微量半定量方法检测金黄色葡萄球菌生物被膜
3.2.2 细菌体外侵袭试验
3.2.3 高毒力LA-MRSA菌株的毒力表达谱
3.3 试验结果
3.3.1 金黄色葡萄球菌生物被膜检测结果
3.3.2 细菌体外侵袭试验结果
3.3.3 高毒力LA-MRSA菌株的毒力分析
3.4 讨论
3.4.1 毒力因子的表达
3.4.2 生物被膜的调控
3.4.3 耐药相关基因的表达
3.4.4 细菌的应激表达
3.5 小结
第四章 MRSA对头孢喹肟耐药的比较基因组与转录组学研究
4.1 试验材料
4.1.1 试验菌株
4.1.2 主要培养基与药品
4.1.3 主要仪器设备
4.2 试验方法
4.2.1 菌株MIC值测定及高浓度耐药株的筛选
4.2.2 样品处理
4.2.3 DNA和RNA提取及样品检测
4.2.4 文库构建及库检
4.3 试验结果
4.3.1 菌株MIC值测定及高浓度耐药菌株筛选结果
4.3.2 LA-MRSA D10与高浓度耐药株Induces比较基因组测序突变分析
4.3.3 LA-MRSA D10与高浓度耐药株Induces比较转录组测序分析结果
4.4 讨论
4.4.1 耐药相关基因
4.4.2 毒力及生存代谢基因
4.5 小结
第五章 结论
参考文献
致谢
个人简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]细菌毒素-抗毒素系统的功能[J]. 何志利,王慧. 生物工程学报. 2018(08)
[2]细菌基因岛研究进展[J]. 邓瑞,陈亮. 重庆医学. 2018(06)
[3]金黄色葡萄球菌毒力调控系统TCRSs和SarA[J]. 唐俊妮,史贤明,曾志光,王红宁,胡瑜. 上海交通大学学报(农业科学版). 2009(02)
[4]青霉素结合蛋白研究进展[J]. 熊亚莉. 国外医药(抗生素分册). 2004(05)
[5]细菌对β-内酰胺类抗生素耐药的热点问题[J]. 陆坚,唐英春. 国外医学(内科学分册). 2003(09)
博士论文
[1]猪源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌流行病学特征及遗传进化分析[D]. 李君.中国农业大学 2017
[2]奶牛乳腺炎性金黄色葡萄球菌耐药基因检测、分子分型和耐甲氧西林菌株全基因组测序[D]. 王登峰.中国农业大学 2016
[3]DNA修复相关基因及耐辐射球菌基因组进化生物信息学研究[D]. 林军.浙江大学 2007
硕士论文
[1]牛源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药性和毒力基因的检测[D]. 陈云.内蒙古农业大学 2019
[2]牛源金黄色葡萄球菌耐药性及分子流行病学研究[D]. 赵吴静.中国农业科学院 2018
[3]体外多酶催化确定乳酸合成途径关键酶的研究[D]. 马春玲.天津科技大学 2016
[4]SOS应答对大肠杆菌抗药性与毒力的调控机制[D]. 王进文.山东大学 2015
[5]志贺菌临床株耐药性分析及对氟喹诺酮抗生素耐药机制的研究[D]. 梁帆.天津医科大学 2012
[6]对苯唑西林耐药的金黄色葡萄球菌耐药性及分子流行病学调查[D]. 杜娜.吉林大学 2007
[7]耐甲氧西林金黄色葡萄球菌femA调控基因的初步研究[D]. 李晓芳.四川大学 2006
本文编号:3050735
【文章来源】:宁夏大学宁夏回族自治区 211工程院校
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
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摘要
Abstract
缩略词表
第一章 文献综述
1.1 国内外研究现状
1.1.1 LA-MRSA的发展流行
1.1.2 MRSA的耐药机制及毒力因子调控作用
1.1.3 头孢喹肟的作用机制及耐药研究
1.1.4 细菌全基因组测序及转录组分析
1.2 研究目的与意义
第二章 LA-MRSA与MSSA的耐药性与毒力分析
2.1 试验材料
2.1.1 菌株来源
2.1.2 抗菌药物标准品
2.1.3 主要培养基和试剂
2.1.4 抗菌药物的配制
2.1.5 主要仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 牛源金黄色葡萄球菌抗菌药物敏感性试验
2.2.2 菌株基因组的提取
2.2.3 文库质检、测序及结果处理
2.2.4 数据分析
2.3 试验结果
2.3.1 药敏试验
2.3.2 基因组基本特征
2.3.3 ARDB数据库注释
2.3.4 VFDB数据库注释及重要毒力因子的比较
2.3.5 基因岛预测
2.3.6 物种系进化分析
2.4 讨论
2.4.1 耐药情况
2.4.2 毒力因子及基因岛携带情况
2.5 小结
第三章 LA-MRSA的毒力因子表达分析
3.1 试验材料
3.1.1 菌株来源与细胞系
3.1.2 主要培养基及试剂
3.1.3 主要仪器设备
3.2 试验方法
3.2.1 微量半定量方法检测金黄色葡萄球菌生物被膜
3.2.2 细菌体外侵袭试验
3.2.3 高毒力LA-MRSA菌株的毒力表达谱
3.3 试验结果
3.3.1 金黄色葡萄球菌生物被膜检测结果
3.3.2 细菌体外侵袭试验结果
3.3.3 高毒力LA-MRSA菌株的毒力分析
3.4 讨论
3.4.1 毒力因子的表达
3.4.2 生物被膜的调控
3.4.3 耐药相关基因的表达
3.4.4 细菌的应激表达
3.5 小结
第四章 MRSA对头孢喹肟耐药的比较基因组与转录组学研究
4.1 试验材料
4.1.1 试验菌株
4.1.2 主要培养基与药品
4.1.3 主要仪器设备
4.2 试验方法
4.2.1 菌株MIC值测定及高浓度耐药株的筛选
4.2.2 样品处理
4.2.3 DNA和RNA提取及样品检测
4.2.4 文库构建及库检
4.3 试验结果
4.3.1 菌株MIC值测定及高浓度耐药菌株筛选结果
4.3.2 LA-MRSA D10与高浓度耐药株Induces比较基因组测序突变分析
4.3.3 LA-MRSA D10与高浓度耐药株Induces比较转录组测序分析结果
4.4 讨论
4.4.1 耐药相关基因
4.4.2 毒力及生存代谢基因
4.5 小结
第五章 结论
参考文献
致谢
个人简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]细菌毒素-抗毒素系统的功能[J]. 何志利,王慧. 生物工程学报. 2018(08)
[2]细菌基因岛研究进展[J]. 邓瑞,陈亮. 重庆医学. 2018(06)
[3]金黄色葡萄球菌毒力调控系统TCRSs和SarA[J]. 唐俊妮,史贤明,曾志光,王红宁,胡瑜. 上海交通大学学报(农业科学版). 2009(02)
[4]青霉素结合蛋白研究进展[J]. 熊亚莉. 国外医药(抗生素分册). 2004(05)
[5]细菌对β-内酰胺类抗生素耐药的热点问题[J]. 陆坚,唐英春. 国外医学(内科学分册). 2003(09)
博士论文
[1]猪源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌流行病学特征及遗传进化分析[D]. 李君.中国农业大学 2017
[2]奶牛乳腺炎性金黄色葡萄球菌耐药基因检测、分子分型和耐甲氧西林菌株全基因组测序[D]. 王登峰.中国农业大学 2016
[3]DNA修复相关基因及耐辐射球菌基因组进化生物信息学研究[D]. 林军.浙江大学 2007
硕士论文
[1]牛源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药性和毒力基因的检测[D]. 陈云.内蒙古农业大学 2019
[2]牛源金黄色葡萄球菌耐药性及分子流行病学研究[D]. 赵吴静.中国农业科学院 2018
[3]体外多酶催化确定乳酸合成途径关键酶的研究[D]. 马春玲.天津科技大学 2016
[4]SOS应答对大肠杆菌抗药性与毒力的调控机制[D]. 王进文.山东大学 2015
[5]志贺菌临床株耐药性分析及对氟喹诺酮抗生素耐药机制的研究[D]. 梁帆.天津医科大学 2012
[6]对苯唑西林耐药的金黄色葡萄球菌耐药性及分子流行病学调查[D]. 杜娜.吉林大学 2007
[7]耐甲氧西林金黄色葡萄球菌femA调控基因的初步研究[D]. 李晓芳.四川大学 2006
本文编号:3050735
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3050735.html
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