植物小开放阅读框编码肽的研究进展

发布时间：2021-02-27 21:46

　　小开放阅读框（small open reading frame,sORF）一般指基因组中能够编码长度在100个氨基酸左右或以内短肽的开放阅读框。它们广泛存在于植物基因组,却因编码短肽而常被基因组注释忽视。随着翻译组学和蛋白质组学测序技术的发展,具有翻译活性的sORF被证实广泛存在于植物基因组,且参与植物生长发育等重要过程的调控。该文归纳了近些年来植物领域sORF的一些研究进展,主要包括sORF的来源与分类、信息学预测方法和生物学功能等,并基于此对植物sORF未来的研究方向进行了展望。 

【文章来源】：植物科学学报. 2020,38(05)北大核心

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 s ORF的分类
    1.1 来源于ncRNA的s ORF
    1.2 来源于mRNA的s ORF
2 s ORF的预测方法
    2.1 基于转录组的生物信息学方法
    2.2 基于翻译组学的生物信息学方法
    2.3 基于质谱的蛋白质组学方法
3 s ORF的生物学功能
5 展望


【参考文献】：
期刊论文
[1]IRESfinder:Identifying RNA internal ribosome entry site in eukaryotic cell using framed k-mer features[J]. Jian Zhao,Jing Wu,Tianyi Xu,Qichang Yang,Junhao He,Xiaofeng Song.  Journal of Genetics and Genomics. 2018(07)



本文编号：3054843