鞘氨醇单胞菌中威兰胶合成关键基因welE和welC的生物信息学分析

发布时间：2021-03-01 16:23

　　为探究威兰胶合成途径中关键基因welE和welC的结构特性及功能,运用生物信息学手段分析了welE和welC基因的序列信息,预测了其编码蛋白的理化性质、跨膜区、信号肽、磷酸化修饰、结构域及高级结构等.研究结果表明,WelE蛋白是由234个氨基酸组成的稳定亲水性蛋白质,无跨膜结构和信号肽,存在20个磷酸化位点,含有一个BY-kinase结构域,说明WelE可能参与威兰胶的生产与转运,WelE二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,三级结构呈"圆环状";WelC蛋白是由449个氨基酸组成的不稳定亲水性跨膜蛋白质,含有2个跨膜螺旋、无信号肽,存在39个磷酸化位点,含有一个Wzz结构域,这表明WelC可能与威兰胶链长调节有关,WelC二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构呈"条状",这些结果为解析welE和welC基因的功能以及建立威兰胶代谢调控方法奠定了理论基础. 

【文章来源】：河南师范大学学报(自然科学版). 2020,48(01)北大核心

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
    1.2 序列分析
2 实验结果
    2.1 蛋白质理化性质和一级结构分析
        2.1.1 蛋白质理化性质分析
        2.1.2 蛋白质的亲水性和疏水性分析
    2.2 蛋白序列特征和功能分析
        2.2.1 蛋白质的跨膜区分析
        2.2.2 蛋白质的信号肽预测
        2.2.3 蛋白磷酸化修饰预测
        2.2.4 蛋白质结构域预测
    2.3 蛋白质二级结构预测
    2.4 蛋白质三级结构预测
3 讨 论



本文编号：3057730