长白山苔原带笃斯越桔内生真菌多样性及其代谢产物的研究

发布时间：2021-03-07 06:57

　　笃斯越桔（Vaccinium uliginosum Linn.）是长白山苔原带的优势植被之一,因其生长在海拔2000—2500m的高山环境条件下,生长季节短,一年内大部分时间生长在寒冷或积雪环境条件下。根据达尔文的“适者生存”的进化机制,笃斯越桔在长白山高山苔原带的逆境条件下一定拥有其内在抗逆适应机制。作为植物体内无所不在的共生物,内生真菌在笃斯越桔的适应进化过程中一定起着非常重要的作用。因受长白山自然保护区严格生物多样性保护管理措施的限制,长白山苔原带笃斯越桔内生真菌还未见有系统的研究报道。作为长白山森林生态系统的重要组成部分,植物内生真菌的功能还未得到深入阐述。另外,随着越来越多的植物内生真菌的药用代谢产物资源的发现,对特殊生境下的笃斯越桔内生真菌的研究则更有现实研究意义。因此,本文于2018和2019年的生长季节对长白山苔原笃斯越桔进行了植株样品采集,并利用组织学分离鉴定技术和高通量测序技术相结合的方法,对不同时期、不同海拔的长白山苔原带笃斯越桔不同组织部位的内生真菌多样性进行了调查分析。此外,笃斯越桔中可分离出大量有效活性成分。鉴于内生真菌通过发酵等方式可产与寄主植物相同或相似... 

【文章来源】：辽宁师范大学辽宁省

【文章页数】：58 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

菌株基因组DNA电泳检测图

长白山苔原带笃斯越桔内生真菌的多样性及其代谢产物的研究15图2.2宏基因组文库的构建Fig.2.2Metagenomiclibraryconstructionprocess2.2.6内生真菌多样性高通量测序分析对测序得到的原始reads进行质量控制，并过滤得到Cleanreads，对Cleanreads进行拼接组装，预测编码基因，并对编码基因进行通用数据库和专用数据库的功能注释；对Cleanreads进行分类学分析，统计样品物种组成和丰度信息。使用MEGAHIT软件进行宏基因组组装，过滤短于300bp的序列。使用cd-hit软件去除冗余，相似性阈值为95%，覆盖度阈值为90%。通过将非冗余基因的蛋白序列和Nr数据库进行BLAST比对，找到在Nr数据库中最相似的序列，该序列对应的注释信息即为对应测序基因组基因的注释信息，比对后可得到样品的物种组成和相对丰度信息。2.3结果与讨论2.3.1长白山苔原带笃斯越桔内生真菌鉴定结果于2018、2019两年的7、8、9月份从长白山苔原带采集到150个笃斯越桔样品，利用组织学方法从这150个样品分成的1500个组织块中总共分离得到775株内生真菌，发现在笃斯越桔上存在大量内生真菌。经形态学和分子生物学鉴定为4门、21目、31科、48属。根据相对分离频率（RF）分析笃斯越桔内生真菌的优势度，一般认为，RF≥10%的内生真菌为优势菌，RF≥1%的为常见菌，RF<1%的为稀有菌[91]，具体结果见表2.1。在所分离到的48属内生真菌中，Alternaria（16.90%）、Fusarium（14.06%）为优势菌群，Colletotrichum（6.45%）、Nigrospora（6.06%）次之。已有研究表明，本文分离到的优势菌Alternaria为普遍存在的真菌类型，在多种植物的组织和土壤中广泛存在[92,93]，Fusarium是普遍存在于植物中的内生真菌，并且在

长白山苔原带笃斯越桔内生真菌的多样性及其代谢产物的研究27图2.6在门水平上笃斯越桔内生真菌群落组成及其相对丰度Fig.2.6CommunitycompositionandrelativeabundanceofendophyticfungiinVacciniumuliginosumatphylalevel图2.7在科水平上笃斯越桔内生真菌群落组成及其相对丰度Fig.2.7CommunitycompositionandrelativeabundanceofendophyticfungiinVacciniumuliginosum


本文编号：3068602