柔性区域顺式肽键发生率影响蛋白质热稳定性的研究

发布时间：2021-03-16 10:50

　　蛋白质的热稳定性不仅与氢键、二硫键、离子键、疏水作用等分子间的相互作用和其周围环境有关,还涉及到蛋白质的折叠与解折叠过程,而影响蛋白质折叠与解折叠过程的重要因素之一是蛋白质的刚性与柔性区域的结构,因此增强蛋白质柔性区域的刚性有可能阻碍升温过程造成的蛋白质解折叠的过程,从而提高蛋白质对温度的耐受性。组成蛋白质的肽键类型分为顺式肽键和反式肽键,顺式肽键呈现出天然的弯折结构,可能在蛋白质内部应力减弱或消失时维持其结构的稳定性。研究发现天然的蛋白质虽然在大多数情况下呈现出反式构象,但是理化、生物、遗传等因素可能会导致蛋白质生物合成过程中发生氨基酸替换,从而导致蛋白质中肽键的顺反异构改变。另外,蛋白质顺反异构的过程不是一个静态的过程,而动态过程难以观测,目前缺乏科学的方法测定顺反异构对蛋白质热稳定性的影响。结合上述理论研究,可以推测在蛋白质的柔性区域中引入顺式肽键可能提高蛋白质的热稳定性,这一推论尚且缺乏证据证明。基于对蛋白质顺反异构过程的研究,本论文提出了顺式肽键发生率（ICPB）的概念,并用顺式肽键发生率来描述蛋白质顺反异构动态过程的结果。研究表明ICPB通常取决于蛋白质翻译后修饰、分子伴侣... 

【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：82 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

氢键的作用机制[18]

肽键结合的两种构象[140]

N-酰基-脯氨酸片段的顺反异构化[174]

【参考文献】：
期刊论文
[1]利用脯氨酸效应提高短乳杆菌谷氨酸脱羧酶的热稳定性[J]. 方卉,吕常江,花雨娇,胡升,赵伟睿,方文姬,宋奎,黄俊,梅乐和.  生物工程学报. 2019(04)
[2]米根霉α-淀粉酶热稳定性的理性设计[J]. 杨倩,汤斌,李松.  生物工程学报. 2018(07)
[3]氨基酸残基在蛋白质热稳定性机制中的研究进展[J]. 易弋,韦阳道,邓春,伍时华.  广西科技大学学报. 2015(04)
[4]通过蛋白质序列比对探讨细菌的热适应机制[J]. 张健,张琳,王维.  安徽农业科学. 2011(21)
[5]磷酸化对多肽中Xaa-Pro片段肽脯酰胺键顺反异构的影响研究（英文）[J]. 朱振泰,孙命,郭燕婷,李艳梅.  生物化学与生物物理进展. 2007(06)
[6]嗜热与嗜常温微生物的蛋白质氨基酸组成比较[J]. 卢柏松,王国力,黄培堂.  微生物学报. 1998(01)

博士论文
[1]蛋白质分子结合折叠与构象转变的分子动力学模拟研究[D]. 尚旭.吉林大学 2018
[2]涉及结合的生物分子构象转变的理论研究[D]. 刘飞.吉林大学 2017
[3]蛋白质折叠/解折叠研究[D]. 谭翠燕.中国科学院研究生院（上海生命科学研究院） 2007



本文编号：3085923