雨生红球藻植物类型隐花色素基因克隆与序列分析

发布时间：2021-03-21 16:45

　　为了从雨生红球藻中获得感知蓝光信号的植物类型隐花色素（CRY）序列,采用同源克隆和RACE相结合的方法获得了雨生红球藻编码植物类型Hae-P-CRY的c DNA全长,并对其序列进行生物信息学分析。结果表明,Hae-P-CRY基因的c DNA全长为3 608 bp,包含开放阅读框全长2 988 bp,编码995个氨基酸,预测等电点6.19,理论分子质量为107.7 ku。经Blast P分析发现,Hae-P-CRY氨基酸序列与莱茵衣藻来源植物类型Cre CRY氨基酸序列的相似性达到66.6%,与拟南芥CRY氨基酸序列相似性为46.94%。系统进化分析表明,Hae-P-CRY与其他真核绿藻来源的植物型CRY聚在一支,属于植物类型CRY。结构域分析表明,Hae-P-CRY基因含有光感知PHR结构域和信号转导CCT结构域,暗示具有感知和转导光信号功能。试验从雨生红球藻得到植物类型Hae-P-CRY基因序列,可为其表达、功能及互作蛋白研究奠定基础,同时为进一步解析雨生红球藻在蓝光响应中的分子机制奠定基础。 

【文章来源】：山西农业科学. 2020,48(05)

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 材料
        1.1.2 试剂
        1.1.3 仪器
    1.2 试验方法
        1.2.1 总RNA的提取
        1.2.2 模板的制备
        1.2.3 引物设计
        1.2.4 同源片段的获得
        1.2.5 c DNA全长的获得
        1.2.6 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 雨生红球藻总RNA提取
    2.2 雨生红球藻Hae-P-CRY基因cDNA序列的获得
    2.3 雨生红球藻Hae-P-CRY的理化性质分析
    2.4 雨生红球藻Hae-P-CRY的二级结构分析
    2.5 雨生红球藻Hae-P-CRY结构域和序列比对分析
    2.6 雨生红球藻Hae-P-CRY的起源和系统进化
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]拟南芥ZTL/FKF1/LKP2蛋白家族功能研究进展[J]. 曾冰洁,阎晋东,杨飘,周娟,李新梅,赵小英.  生物信息学. 2019(03)
[2]紫苏二酰甘油酰基转移酶基因（PfDGAT1）鉴定及表达分析[J]. 周雅莉,任文燕,郝月茹,安茜,段露露,李润植,王计平.  山西农业科学. 2019(05)
[3]籽粒苋优质贮藏蛋白AhAMA1基因功能分析[J]. 赵熙宁,张飞,岳敏,安茜,宋亚楠,季春丽,崔红利,李润植.  山西农业科学. 2019(05)
[4]光受体介导信号转导调控植物开花研究进展[J]. 马朝峰,戴思兰.  植物学报. 2019(01)
[5]玉米隐花色素CRY1b和CRY2基因转录丰度对不同光质处理的响应[J]. 李红丹,闫蕾,孙蕾,樊晓聪,陈士瞻,张燕,郭林,游光霞,李庄,杨宗举,苏亮,杨建平.  作物学报. 2018(09)
[6]蓝光受体ZTLs家族调控植物光周期途径研究进展[J]. 景艺峰,赵淑靓,刘青青,杨敏,王翠玲.  核农学报. 2018(07)
[7]埃氏小球藻对11种抗生素的敏感性[J]. 王亚君,周广航,季春丽,薛金爱,李润植.  山西农业科学. 2017(03)
[8]种子感光的机理及影响种子感光性的因素[J]. 杨期和,宋松泉,叶万辉,殷寿华.  植物学通报. 2003(02)



本文编号：3093207