基于mtDNA全序列的噪鹛科部分鸟类的系统进化

发布时间：2021-03-25 00:58

　　噪鹛科鸟类来自于雀形目一目中的原来的画眉科。原来的画眉科所包含的鸟类俗称画眉,其物种相互间的系统进化关系大多都是未知或有争议的,噪鹛科中的鸟类也不例外。本实验采用LA-PCR,引物步移法,以及测序得到大草鹛（Garrulax waddelli）（英文名:Giant Babax）、山噪鹛（Garrulax davidi）（英文名:Plain Laughingthrush）、灰腹噪鹛（Trochalopteron henrici）（英文名:Brown-cheeked Laughingthrush）和橙翅噪鹛（Trochalopteron elliotii）（英文名:Elliot’s Laughingthrush）的mtDNA全序列;分别对这4种鸟类的mtDNA序列长度、碱基含量、蛋白编码基因（PCGs）、核糖体RNA基因（rRNA genes）、转运RNA基因（tRNA genes）,以及D-loop区进行分析;同时使用这4种鸟类mtDNA序列,及从NCBI中获得的草鹛属、噪鹛属及彩翼噪鹛属的10种鸟类与2种相思鸟属鸟类,共16种噪鹛科鸟类的mtDNA全序列和它们序列中的13/12个蛋白编... 

【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

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【部分图文】：

鸟类mtDNA的基因排列顺序（Singh，2008）

和D-loop1（图3-1）。图 3-1 橙翅噪鹛 mtDNA 的基因图谱Fig 3-1 The gene map of Trochalopteron elliotii mtDNA

22图 3-2 橙翅噪鹛 mtDNA 的 tRNA 二级结构Fig 3-2 The tRNA secondary structure of Trochalopteron elliotii mtDNA3.1.6 控制区橙翅噪鹛 mtDNA 中有 2 个 D-loop 区，又称为非编码区或者控制区。D-loop1长 1,135 bp，A+T 的含量为 53.57%；D-loop2长 1,162 bp，A+T 的含量为 54.73%。经 NCBI Blast 比对发现，这两个控制区的相似度达到 100%。D-loop1分布于tRNAThr和 tRNAPro之间，D-loop2分布于 tRNAGlu和 tRNAPhe之间。

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]鸫属九种鸟线粒体基因组全序列比较及系统发生关系[D]. 江波.兰州大学 2018
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本文编号：3098726