柑橘CAMTA基因家族的鉴定与功能的初步研究
发布时间：2021-03-25 14:57
柑橘是重要的经济型水果作物之一,在全世界范围内广泛种植。我国柑橘栽培历史悠久,种类繁多,是世界柑橘生产与消费大国。在南方地区柑橘产业已成为农民增收致富的支柱产业,对于当地经济有着重要的推动作用。近年来,我国柑橘产业虽然取得了巨大的发展,但各种生物和非生物逆境严重影响其产量与品质。因此,培育抗逆性强的柑橘品种至关重要。然而,常规育种存在多种局限和困难,难以在短时间内获得良好的抗性品种。利用基因工程技术将一些重要的抗性基因转入柑橘是获得抗性品种最为高效和快捷的途径。这就要求深入挖掘和利用柑橘抗性相关功能基因。CAMTA（calmodulin-binding transcription activator）转录因子是一类钙调素结合蛋白,广泛存在于多细胞真核生物中,在植物逆境胁迫应答过程中发挥着十分重要的作用。然而,在柑橘中迄今未见有对这个家族的系统报道。本文基于克里曼丁和甜橙基因组（http://www.phytozome.net）,首次对柑橘CAMTA成员进行了系统鉴定,分析了各成员的基因结构、系统进化关系及其在不同组织和逆境处理下的表达模式等。构建CitCAMTA8和CitCAMTA9过...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
植物CAMTA参与激素和环境胁迫调控的网络图
普通烟草（Nicotiana tabacum）有13个（Kakar Kaleem U等，2018），菜豆（Phaseolusvulgaris L.）有8个（Büyük lker等，2019）。为了了解各植物CAMTA成员之间的遗传进化关系，利用不同植物的CAMTA成员构建了NJ进化树（图1-3）。结果表明，所有CAMTAs大致聚类形成6个分支（不同的颜色标记），在不同分支中均含有来自不同植物的CAMTA成员，表明单子叶和双子叶植物的CAMTA起源同祖先，并在进化过程中非常保守。图 1-3 不同植物中 CAMTAs 的系统发育关系Figure 1-3 Phylogenetic relationships of CAMTAs in different plants拟南芥CAMTA3是功能研究的最深入的成员，其通过直接调控EDS1、NDR1和EIN3基因的表达，既参与SA介导的抗病信号途径，也参与乙烯信号转导途径。在进化树中油菜BnaA04g12770D和BnaC04g34700D与AtCAMTA3有最近的遗传距
第 3 章 柑橘 CAMTA 的鉴定与生物信息学分析有典型的 CaMBD 结构域。此外，CitCAMTA2、3、5、和 6 都包含 CG-1 结构域、TIG 结构域、ANK 重复序列以及 IQ 基序；CitCAMTA4 和 7 都含有 CG-1 结构域；CitCAMTA8 拥有一个 IQ 基序；然而，CitCAMTA9 却不含其它蛋白结构域。
【参考文献】：
期刊论文
[1]我国柑橘生产现状及未来发展预测[J]. 沈兆敏. 果农之友. 2019(02)
[2]转香樟CcCBFs烟草的抗逆性分析[J]. 王建格,周婵,张佳佳,朱逢玲,焦晓琳,杜丽. 园艺学报. 2018(10)
[3]水杨酸介导植物抗病的研究进展[J]. 汪尚,徐鹭芹,张亚仙,曾后清,杜立群. 植物生理学报. 2016(05)
[4]紫花苜蓿NAC类转录因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析[J]. 申玉华,徐振军,唐立红,杨晓坡,黄文婕,武小斌,张文波. 中国农业科学. 2015(15)
[5]植物钙调素结合转录因子CAMTA/SR功能的研究进展[J]. 曾后清,王国平,王慧中,林金星,杜立群. 植物生理学报. 2015(05)
[6]基于芯片数据的烟草qRT-PCR内参基因鉴定与验证[J]. 王燃,许亚龙,李泽锋,卢鹏,孟利军,曹培健. 烟草科技. 2015(02)
[7]植物应答低温胁迫的转录调控网络研究进展[J]. 刘辉,李德军,邓治. 中国农业科学. 2014(18)
[8]植物具IQ基序的钙调素结合蛋白的研究进展[J]. 田长恩,周玉萍. 植物学报. 2013(04)
[9]Salicylic Acid and its Function in Plant Immunity[J]. Chuanfu An and Zhonglin Mou Department of Microbiology and Cell Science,University of Florida,Gainesville,FL 32611,USA. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
[10]植物非生物胁迫应答的分子机制[J]. 杨献光,梁卫红,齐志广,马闻师,沈银柱. 麦类作物学报. 2006(06)
博士论文
[1]分裂源激活蛋白二激酶、钙调蛋白结合转录因子、NADPH氧化酶和腺苷同型半胱氨酸水解酶在番茄抗病抗逆反应中的功能研究[D]. 李小辉.浙江大学 2014
[2]小麦TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡伟.华中科技大学 2013
硕士论文
[1]TaCAMTA4在小麦与叶锈菌互作过程中的功能研究及其调控基因的转录组分析[D]. 牛笑南.河北农业大学 2015
[2]番茄SR/CAMTA转录因子家族基因SlSR4的克隆与功能研究[D]. 褚桂花.重庆大学 2015
[3]油菜CAMTA1参与冷胁迫应答的功能研究[D]. 王晴晴.华中师范大学 2013
本文编号：3099871
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
植物CAMTA参与激素和环境胁迫调控的网络图
普通烟草（Nicotiana tabacum）有13个（Kakar Kaleem U等，2018），菜豆（Phaseolusvulgaris L.）有8个（Büyük lker等，2019）。为了了解各植物CAMTA成员之间的遗传进化关系，利用不同植物的CAMTA成员构建了NJ进化树（图1-3）。结果表明，所有CAMTAs大致聚类形成6个分支（不同的颜色标记），在不同分支中均含有来自不同植物的CAMTA成员，表明单子叶和双子叶植物的CAMTA起源同祖先，并在进化过程中非常保守。图 1-3 不同植物中 CAMTAs 的系统发育关系Figure 1-3 Phylogenetic relationships of CAMTAs in different plants拟南芥CAMTA3是功能研究的最深入的成员，其通过直接调控EDS1、NDR1和EIN3基因的表达，既参与SA介导的抗病信号途径，也参与乙烯信号转导途径。在进化树中油菜BnaA04g12770D和BnaC04g34700D与AtCAMTA3有最近的遗传距
第 3 章 柑橘 CAMTA 的鉴定与生物信息学分析有典型的 CaMBD 结构域。此外，CitCAMTA2、3、5、和 6 都包含 CG-1 结构域、TIG 结构域、ANK 重复序列以及 IQ 基序；CitCAMTA4 和 7 都含有 CG-1 结构域；CitCAMTA8 拥有一个 IQ 基序；然而，CitCAMTA9 却不含其它蛋白结构域。
【参考文献】：
期刊论文
[1]我国柑橘生产现状及未来发展预测[J]. 沈兆敏. 果农之友. 2019(02)
[2]转香樟CcCBFs烟草的抗逆性分析[J]. 王建格,周婵,张佳佳,朱逢玲,焦晓琳,杜丽. 园艺学报. 2018(10)
[3]水杨酸介导植物抗病的研究进展[J]. 汪尚,徐鹭芹,张亚仙,曾后清,杜立群. 植物生理学报. 2016(05)
[4]紫花苜蓿NAC类转录因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析[J]. 申玉华,徐振军,唐立红,杨晓坡,黄文婕,武小斌,张文波. 中国农业科学. 2015(15)
[5]植物钙调素结合转录因子CAMTA/SR功能的研究进展[J]. 曾后清,王国平,王慧中,林金星,杜立群. 植物生理学报. 2015(05)
[6]基于芯片数据的烟草qRT-PCR内参基因鉴定与验证[J]. 王燃,许亚龙,李泽锋,卢鹏,孟利军,曹培健. 烟草科技. 2015(02)
[7]植物应答低温胁迫的转录调控网络研究进展[J]. 刘辉,李德军,邓治. 中国农业科学. 2014(18)
[8]植物具IQ基序的钙调素结合蛋白的研究进展[J]. 田长恩,周玉萍. 植物学报. 2013(04)
[9]Salicylic Acid and its Function in Plant Immunity[J]. Chuanfu An and Zhonglin Mou Department of Microbiology and Cell Science,University of Florida,Gainesville,FL 32611,USA. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
[10]植物非生物胁迫应答的分子机制[J]. 杨献光,梁卫红,齐志广,马闻师,沈银柱. 麦类作物学报. 2006(06)
博士论文
[1]分裂源激活蛋白二激酶、钙调蛋白结合转录因子、NADPH氧化酶和腺苷同型半胱氨酸水解酶在番茄抗病抗逆反应中的功能研究[D]. 李小辉.浙江大学 2014
[2]小麦TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡伟.华中科技大学 2013
硕士论文
[1]TaCAMTA4在小麦与叶锈菌互作过程中的功能研究及其调控基因的转录组分析[D]. 牛笑南.河北农业大学 2015
[2]番茄SR/CAMTA转录因子家族基因SlSR4的克隆与功能研究[D]. 褚桂花.重庆大学 2015
[3]油菜CAMTA1参与冷胁迫应答的功能研究[D]. 王晴晴.华中师范大学 2013
本文编号：3099871
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3099871.html
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