水稻Aux/IAA基因家族进化分析及OsIAA23基因功能的鉴定
发布时间：2021-04-02 10:33
生长素/吲哚-3-乙酸（Aux/IAA）基因家族在植物生长素信号转导中扮演着重要的角色。其与植物细胞的伸长、分裂与分化、向光性及重力性、根和芽的发生等植物生理生化过程都密切相关。该基因家族及其各自的功能在拟南芥中有比较详尽的研究,但在水稻这种全球性重要粮食作物中的研究相对较少。本文通过对水稻Aux/IAA基因家族进化与群体遗传学的分析,试图系统性地探讨水稻中Aux/IAA家族基因的进化过程,进而对其功能进行验证,为水稻高产育种提供理论支撑。Aux/IAA基因家族属于生长素响应基因家族,其编码的短寿命核蛋白包含四个高度保守的结构域（结构域Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ）。我们的研究表明,水稻Aux/IAA基因家族中共有31个成员;通过群体遗传学方法,引入394个不同品系的水稻的基因组数据,系统比较不同生态型样本中Aux/IAA同源基因序列的核苷酸多样性、非同义/同义突变比等遗传多态性指标。计算结果表明:基因OsIAA2,OsIAA23和OsIAA27的CDS区域显示出相对较高的遗传多态性（≥2‰）,而基因OsIAA2,OsIAA22,OsIAA23和OsIAA29在其结构域II中检测到了强烈的正选择。以...
【文章来源】：南京大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１典型的Ａｕｘ／ＩＡＡ蛋白的结构域１２８１
种植物的Au以IAA基因和ARF基因系统进化树
图３．１本研究中使用的载体。Ａ：载体ｐＯｓ－ｓｇＲＮＡ；?Ｂ：载体ｐ丨丨－Ｕｂｉ－ｃａｓ９－７??试剂准备：??ＬＢ?培养基（１?Ｌ＞：蛋白胨（ＴＲＹＰＴＯＮＥ）?１０?ｇ：酵母粉（ＹＥＡＳＴ?ＥＸＴＲＡＣＴ）?５?ｇ；??ＮａＣｌ?１０?ｇ：加水至１０００?ｍＬ，调节ｐＨ至７．０，如需要固体培养基则加入琼脂糖??（Ａｇａｒｏｓｅ）约１６?ｇ，高温高压灭菌冷却后，根据需要加入一定量５０?ｍｇ／ｍＬ卡那霉??素（终浓度５０?ｍｇ／Ｌ）或一定量５０?ｍｇ／ｍＬ壮观霉素和一定量５０?ｍｇ／ｍＬ链霉素（终??浓度均为５０ｍｇ／Ｌ），分装至皿。??５０?ｍｇ／ｍＬ卡那霉素（２０?ｍＬ）：称取卡那霉素粉末１?ｇ，溶于２０?ｍＬ?ｄｄＨ２〇中，??过滤除菌，分装到１．５?ｍＬ离心管，－２０?°Ｃ冰箱冷冻保存。??５０?ｍｇ／ｍＬ壮观霉素（２０?ｍＬ）：称取壮观霉素粉末１?ｇ，溶于２０?ｍＬ?ｄｄＨ２０中，??过滤除菌，分装到１．５?ｍＬ离心管，－２０?°Ｃ冰箱冷冻保存。??５〇１＾尬链霉素（２〇１１１１）：称取链霉素粉末１８，溶于２〇１１１１＾出０中，过??°
【参考文献】：
期刊论文
[1]生长素信号转导研究进展[J]. 冯寒骞,李超. 生物技术通报. 2018(07)
[2]植物AUX/IAA基因家族研究进展[J]. 李俊男,燕晓杰,李枢航,张荣沭. 中国农学通报. 2018(15)
[3]基于高通量测序的植物群体基因组学研究进展[J]. 王云生. 遗传. 2016(08)
[4]A Gain-of-Function Mutation in IAA7/AXR2 Confers Late Flowering under Short-day Light in Arabidopsis[J]. Yan-Xia Mai1,Long Wang1 and Hong-Quan Yang2 1National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics,Institute of Plant Physiology and Ecology,Shanghai Institutes for Biological Sciences,the Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200032,China 2Plant Science Institute,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
本文编号：3115118
【文章来源】：南京大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：78 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１典型的Ａｕｘ／ＩＡＡ蛋白的结构域１２８１
种植物的Au以IAA基因和ARF基因系统进化树
图３．１本研究中使用的载体。Ａ：载体ｐＯｓ－ｓｇＲＮＡ；?Ｂ：载体ｐ丨丨－Ｕｂｉ－ｃａｓ９－７??试剂准备：??ＬＢ?培养基（１?Ｌ＞：蛋白胨（ＴＲＹＰＴＯＮＥ）?１０?ｇ：酵母粉（ＹＥＡＳＴ?ＥＸＴＲＡＣＴ）?５?ｇ；??ＮａＣｌ?１０?ｇ：加水至１０００?ｍＬ，调节ｐＨ至７．０，如需要固体培养基则加入琼脂糖??（Ａｇａｒｏｓｅ）约１６?ｇ，高温高压灭菌冷却后，根据需要加入一定量５０?ｍｇ／ｍＬ卡那霉??素（终浓度５０?ｍｇ／Ｌ）或一定量５０?ｍｇ／ｍＬ壮观霉素和一定量５０?ｍｇ／ｍＬ链霉素（终??浓度均为５０ｍｇ／Ｌ），分装至皿。??５０?ｍｇ／ｍＬ卡那霉素（２０?ｍＬ）：称取卡那霉素粉末１?ｇ，溶于２０?ｍＬ?ｄｄＨ２〇中，??过滤除菌，分装到１．５?ｍＬ离心管，－２０?°Ｃ冰箱冷冻保存。??５０?ｍｇ／ｍＬ壮观霉素（２０?ｍＬ）：称取壮观霉素粉末１?ｇ，溶于２０?ｍＬ?ｄｄＨ２０中，??过滤除菌，分装到１．５?ｍＬ离心管，－２０?°Ｃ冰箱冷冻保存。??５〇１＾尬链霉素（２〇１１１１）：称取链霉素粉末１８，溶于２〇１１１１＾出０中，过??°
【参考文献】：
期刊论文
[1]生长素信号转导研究进展[J]. 冯寒骞,李超. 生物技术通报. 2018(07)
[2]植物AUX/IAA基因家族研究进展[J]. 李俊男,燕晓杰,李枢航,张荣沭. 中国农学通报. 2018(15)
[3]基于高通量测序的植物群体基因组学研究进展[J]. 王云生. 遗传. 2016(08)
[4]A Gain-of-Function Mutation in IAA7/AXR2 Confers Late Flowering under Short-day Light in Arabidopsis[J]. Yan-Xia Mai1,Long Wang1 and Hong-Quan Yang2 1National Key Laboratory of Plant Molecular Genetics,Institute of Plant Physiology and Ecology,Shanghai Institutes for Biological Sciences,the Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200032,China 2Plant Science Institute,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiaotong University,Shanghai 200240,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(06)
本文编号：3115118
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3115118.html
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