哺乳动物病毒受体的进化研究

发布时间：2021-04-30 00:34

　　病毒与宿主间的遗传冲突会导致循环往复的进化军备竞赛。病毒需结合宿主细胞表面上的受体分子（绝大多数为蛋白）来感染宿主细胞。病毒受体蛋白是具有正常生物学功能的宿主蛋白,但被病毒“挟持”用来辅助入侵宿主细胞。病毒受体在进化上受到两个相互冲突的作用力,即由于功能限制而导致的负选择和因宿主病毒军备竞赛而引起的正选择。尚不清楚病毒受体在多重选择压力下是如何进化的。本研究系统地整理了目前已知的96个哺乳动物病毒受体的信息,并通过比较基因组学和分子进化分析的方法来研究哺乳动物病毒受体基因在灵长类动物中发生的进化模式。研究发现52.1%的病毒受体基因在灵长类动物进化过程中经历了适应性进化。位点分析表明42.7%病毒受体基因中存在受正选择的氨基酸位点。本研究将受正选择的氨基酸位点与病毒和受体互作界面进行了关联分析,发现病毒受体中许多受选择的氨基酸位点位于病毒和受体互作界面。本研究通过对灵长目动物病毒受体基因以及对照基因进行比较分析发现病毒受体基因的d N/d S显著高于对照基因,病毒受体基因中受正选择的基因比例显著高于对照基因,病毒受体基因中受正选择的支系以及正选择位点比例显著高于对照基因。这些结果表明宿... 

【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：109 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 绪论
    1 病毒入侵
        1.1 病毒受体
        1.2 病毒入侵机制
    2 病毒与宿主进化
        2.1 进化军备竞赛
        2.2 病毒-宿主军备竞赛研究进展
    3 正选择检测
    4 群体遗传学分析
    5 本研究的目的和意义
第2章 病毒受体基因在灵长类的进化研究
    1 材料方法
        1.1 灵长类基因组的获取
        1.2 病毒受体信息收集
        1.3 病毒受体基因GO富集分析
        1.4 病毒受体基因同源序列识别
        1.5 病毒受体基因的进化分析
    2 结果
        2.1 病毒受体基因信息
        2.2 病毒受体GO富集分析
        2.3 病毒受体选择压力分析
        2.4 病毒与受体互作界面的正选择位点
    3 讨论
第3章 病毒受体基因与对照基因进化的比较研究
    1 材料方法
        1.1 病毒受体对照基因的选取
        1.2 统计学检验
    2 结果
        2.1 病毒受体与对照基进化的对比研究
        2.2 病毒受体与对照基GO富集的对比研究
        2.3 病毒受体间的进化的对比研究
    3 讨论
第4章 病毒受体基因在人群中的进化研究
    1 材料方法
        1.1 人类群体遗传变异数据提取
        1.2 中性检验
        1.3 单倍型纯合度检验
        1.4 群体差异分析
        1.5 受体基因疾病关联
    2 结果
        2.1 病毒受体的群体遗传分析
        2.2 病毒受体疾病关联
    3 讨论
第5章 总结
参考文献
在读期间发表的学术论文及研究成果
致谢
附录A



本文编号：3168488