基于异构网络的lncRNA-disease关联关系预测
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【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1lncRNA五种类型人类疾病的发生除了与不可控的外界因素有关,更多的是与lncRNA相关
东北师范大学硕士学位论文2图1lncRNA五种类型人类疾病的发生除了与不可控的外界因素有关,更多的是与lncRNA相关。癌症等许多严重危害人类身体健康的重大疾病[14-16]都离不开lncRNA的突变,比如乳腺癌,肺癌,结肠癌、结直肠癌和肺腺癌等癌症。利用信息生物学的计算方法,发....
图2LncRNADisease数据库(2)DiseaseOntology[29]:DiseaseOntology是一个社区驱动的开源本体,旨在通过疾病概念链接不同的数据集
东北师范大学硕士学位论文9图2LncRNADisease数据库(2)DiseaseOntology[29]:DiseaseOntology是一个社区驱动的开源本体,旨在通过疾病概念链接不同的数据集。提供一个可计算的人类疾病遗传、环境和传染源结构,以便于通过人类疾病的视角将遗传数据....
图3DiseaseOntology数据库(3)LncReg[30]:LncReg数据库中包含从259篇文章中手动编辑的1081个条目
东北师范大学硕士学位论文9图2LncRNADisease数据库(2)DiseaseOntology[29]:DiseaseOntology是一个社区驱动的开源本体,旨在通过疾病概念链接不同的数据集。提供一个可计算的人类疾病遗传、环境和传染源结构,以便于通过人类疾病的视角将遗传数据....
图4LncReg数据库(4)DisGeNet[31]:DisGeNET包含与人类疾病相关的最大的公开基因和变体集合
东北师范大学硕士学位论文10这些条目包含258个非重复性lncRNA和571个非重复性基因。尤其是在LncReg中有659个正调控关系和374个负调控关系。LncReg数据库提供lncRNA的调控网络和具体的调控信息,对于lncRNA-gene的调控关系,它更加的全面和详细。对应....
本文编号:3997313
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