基于转录组学分析miR-34b/c与miR-449对小鼠输出小管结构与功能的影响

发布时间：2021-05-08 23:24

　　目的:研究miR-34b/c、miR-449在维持输出小管正常结构与功能中发挥的作用,探索miR-34b/c^-/-、miR-449^-/-双敲除小鼠不育的分子机制。方法:HE染色对小鼠输出小管形态进行观察;利用转录组测序技术对野生型小鼠和miR-34b/c^-/-、miR-449^-/-双敲除小鼠输出小管基因表达进行分析,从中筛选出miR-34b/c、miR-449可能的靶基因与差异表达基因进行联合分析;qRT-PCR法验证测序结果。结果:双敲除小鼠输出小管形态异常;与野生型小鼠相比,双敲除小鼠输出小管中参与纤毛等结构形成以及水、离子、蛋白质转运等活动的基因表达显著下降。结论:miR-34b/c、miR-449的缺失导致双敲除小鼠输出小管结构异常,输出小管纤毛运动与重吸收功能障碍,导致双敲除小鼠不育。 

【文章来源】：中华男科学杂志. 2020,26(12)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验动物
    1.2 主要试剂与仪器
    1.3 小鼠基因型鉴定
    1.4 小鼠输出小管HE染色
    1.5 组织样本采集
    1.6 转录组测序及分析
        1.6.1 基因文库的构建与测序
        1.6.2 测序数据分析
    1.7 靶基因预测与分析
    1.8 qRT-PCR验证mRNA表达水平
    1.9 统计学分析
2 结果
    2.1 小鼠基因型鉴定
    2.2 小鼠输出小管形态学观察
    2.3 测序结果与分析
        2.3.1 差异表达基因检测
        2.3.2 差异表达基因GO功能分析
        2.3.3 DEG的KEGG通路分析
        2.3.4 靶基因联合分析
    2.4 qRT-PCR验证
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒.  遗传. 2011(11)



本文编号：3176177