基因组三维结构研究进展
发布时间:2021-05-09 03:48
由于三维基因组结构在基因调控和细胞功能中起到了关键性作用,因此了解染色质是如何在细胞核内组织,以及这种三维结构如何影响基因调控、决定细胞命运和推动物种演变是当前生命科学研究的主要命题之一.本综述首先描述了与基因组三维结构密切相关的主要染色质构象捕获技术,然后介绍了常用的基因组三维结构重构算法和相关可视化工具,最后结合应用阐述三维基因组研究目前存在的问题和未来的发展方向.
【文章来源】:中国科学:生命科学. 2020,50(05)北大核心CSCD
【文章页数】:13 页
【文章目录】:
1 染色质空间构象捕获技术
2 交互数据模拟染色质空间构建方法
2.1 基于热动力学(TB)建模
2.2 基于约束的(RB)建模
2.3 混合模型和基于机器学习的模型
3 染色质三维空间模型可视化工具
4 染色质空间结构的生物学意义
4.1 染色质空间结构与基因表达的关系
4.2 染色质空间结构与进化的关系
5 总结
【参考文献】:
期刊论文
[1]三维基因组数据分析方法进展[J]. 张祥林,方欢,汪小我. 生物化学与生物物理进展. 2018(11)
[2]染色质三维结构重建及其生物学意义[J]. 彭城,李国亮,张红雨,阮一骏. 中国科学:生命科学. 2014(08)
[3]起航三维基因组学研究[J]. 李国亮,阮一骏,谷瑞升,杜生明. 科学通报. 2014(13)
本文编号:3176560
【文章来源】:中国科学:生命科学. 2020,50(05)北大核心CSCD
【文章页数】:13 页
【文章目录】:
1 染色质空间构象捕获技术
2 交互数据模拟染色质空间构建方法
2.1 基于热动力学(TB)建模
2.2 基于约束的(RB)建模
2.3 混合模型和基于机器学习的模型
3 染色质三维空间模型可视化工具
4 染色质空间结构的生物学意义
4.1 染色质空间结构与基因表达的关系
4.2 染色质空间结构与进化的关系
5 总结
【参考文献】:
期刊论文
[1]三维基因组数据分析方法进展[J]. 张祥林,方欢,汪小我. 生物化学与生物物理进展. 2018(11)
[2]染色质三维结构重建及其生物学意义[J]. 彭城,李国亮,张红雨,阮一骏. 中国科学:生命科学. 2014(08)
[3]起航三维基因组学研究[J]. 李国亮,阮一骏,谷瑞升,杜生明. 科学通报. 2014(13)
本文编号:3176560
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3176560.html
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