拟南芥中AtR8 lncRNA功能及作用机制初探
发布时间：2021-05-21 14:13
非编码RNA（non-coding RNA）不翻译成蛋白质,它们通过转录、转录后及翻译水平调控靶基因表达,在生物体生长发育过程中发挥重要作用。大于200个核苷酸长度的为长非编码RNA（long non-coding RNA,IncRNA）,它们以调节因子形式,在植物开花、雄性不育、营养代谢、生物和非生物胁迫等过程中起着重要作用。AtR8lncRNA（259 nt）是 2012 年于拟南芥（Arabidopsisthaliana）中发现的一个 RNA 聚合酶IⅢ转录的lncRNA,种子萌发期其于拟南芥根尖端大量表达,并响应ABA、NaCl、GA3、SA、Mannitol等应激环境;其同源物存在于结球甘蓝（Brassica oleracea L.var capitat L.）和白菜（Brassica rapa ar pekinensis）等十字花科芸薹属植物中。目前,AtR8 lncRNA的详细功能及作用机制尚不清楚。本研究表明,正常条件下,atr8 突变体导致种子干瘪、长角果发育不完全、莲座叶边缘锯齿状、成熟植株纤细矮小、种子萌发率大幅度降低,这些表型在AtR8 lncRNA过表达（At...
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 长非编码RNA
1.2 植物中已知功能性lncRNA
1.3 植物种子萌发生理及其相关非编码RNA的研究
1.3.1 种子的休眠与萌发
1.3.2 种子休眠与萌发相关的非编码RNA
1.4 植物谷胱甘肽转移酶家族
1.4.1 谷胱甘肽转移酶
1.4.2 植物谷胱甘肽转移酶研究进展
1.5 研究目的意义
2 实验材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 植物培养基制备
2.1.3 拟南芥培养
2.2 仪器设备
2.3 生化实验方法
2.3.1 植物RNA提取
2.3.2 植物基因组DNA的提取
2.3.3 整体原位杂交
2.3.4 Northern杂交
2.3.5 实时荧光定量(RT-qPCR)
3 拟南芥中AtR8 lncRNA功能及作用机制初探
3.1 AtR8 lncRNA染色体位置分析
3.2 GSTU7表达特性分析
3.3 gstu7突变体筛选
3.4 拟南芥生长发育过程中AtR8 lncRNA与GSTU7功能分析
3.5 ABA应激条件下,AtR8 lncRNA与GSTU7功能分析
3.6 正常和ABA应激条件下,AtR8 lncRNA和GSTU7影响基因表达分析
3.7 本章小结
4 结球甘蓝中AtR8 lncRNA同源物,BoNR8 lncRNA功能及作用机制初探
4.1 正常条件下,BoNR8 lncRNA过表达影响了拟南芥发育
4.2 BoNR8 lncRNA过表达降低了拟南芥萌发种子对高盐的抗性
4.3 BoNR8 lncRNA过表达降低了拟南芥萌发种子对高浓度ABA的敏感性
4.4 BoNR8 lncRNA改变了拟南芥中ABA响应基因的表达
4.5 本章小结
讨论
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
附件
【参考文献】：
期刊论文
[1]十字花科植物种子低分子RNA提取方法比较[J]. 刘春晓,黄小庆,刘自广,彭疑芳,李丹丹,张晓旭,李爽,汤川泰,吴娟. 基因组学与应用生物学. 2019(03)
[2]脱落酸调控种子休眠和萌发的分子机制[J]. 伍静辉,谢楚萍,田长恩,周玉萍. 植物学报. 2018(04)
[3]植物长链非编码RNA进展分析[J]. 高成香,邓粉妮,沈法富. 分子植物育种. 2018(03)
[4]miRNA在植物种子发育过程中的作用[J]. 龚淑敏,丁艳菲,朱诚. 遗传. 2015(06)
[5]植物长链非编码RNA研究进展[J]. 黄小庆,李丹丹,吴娟. 遗传. 2015(04)
[6]种子的休眠与萌发[J]. 刘宁. 生物学通报. 2014(10)
[7]谷胱甘肽S-转移酶的研究进展[J]. 陈秀华,王臻昱,李先平,朱延明,刘丽,陈威,陈勤. 东北农业大学学报. 2013(01)
[8]植物激素对种子休眠和萌发调控机理的研究进展[J]. 杨荣超,张海军,王倩,郭仰东. 草地学报. 2012(01)
[9]谷胱甘肽过氧化物酶和谷胱甘肽转硫酶研究进展[J]. 马森. 动物医学进展. 2008(10)
[10]Arabidopsis RAV1 is down-regulated by brassinosteroid and may act as a negative regulator during plant development[J]. Yu Xin HU~*, Yong Hong WANG~*, Xin Fang LIU, Jia Yang LI~(**) Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China.. Cell Research. 2004(01)
硕士论文
[1]紫花苜蓿MsGSTU8基因的克隆及其功能研究[D]. 张雪.哈尔滨师范大学 2017
本文编号：3199848
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：55 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 长非编码RNA
1.2 植物中已知功能性lncRNA
1.3 植物种子萌发生理及其相关非编码RNA的研究
1.3.1 种子的休眠与萌发
1.3.2 种子休眠与萌发相关的非编码RNA
1.4 植物谷胱甘肽转移酶家族
1.4.1 谷胱甘肽转移酶
1.4.2 植物谷胱甘肽转移酶研究进展
1.5 研究目的意义
2 实验材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 植物培养基制备
2.1.3 拟南芥培养
2.2 仪器设备
2.3 生化实验方法
2.3.1 植物RNA提取
2.3.2 植物基因组DNA的提取
2.3.3 整体原位杂交
2.3.4 Northern杂交
2.3.5 实时荧光定量(RT-qPCR)
3 拟南芥中AtR8 lncRNA功能及作用机制初探
3.1 AtR8 lncRNA染色体位置分析
3.2 GSTU7表达特性分析
3.3 gstu7突变体筛选
3.4 拟南芥生长发育过程中AtR8 lncRNA与GSTU7功能分析
3.5 ABA应激条件下,AtR8 lncRNA与GSTU7功能分析
3.6 正常和ABA应激条件下,AtR8 lncRNA和GSTU7影响基因表达分析
3.7 本章小结
4 结球甘蓝中AtR8 lncRNA同源物,BoNR8 lncRNA功能及作用机制初探
4.1 正常条件下,BoNR8 lncRNA过表达影响了拟南芥发育
4.2 BoNR8 lncRNA过表达降低了拟南芥萌发种子对高盐的抗性
4.3 BoNR8 lncRNA过表达降低了拟南芥萌发种子对高浓度ABA的敏感性
4.4 BoNR8 lncRNA改变了拟南芥中ABA响应基因的表达
4.5 本章小结
讨论
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
附件
【参考文献】：
期刊论文
[1]十字花科植物种子低分子RNA提取方法比较[J]. 刘春晓,黄小庆,刘自广,彭疑芳,李丹丹,张晓旭,李爽,汤川泰,吴娟. 基因组学与应用生物学. 2019(03)
[2]脱落酸调控种子休眠和萌发的分子机制[J]. 伍静辉,谢楚萍,田长恩,周玉萍. 植物学报. 2018(04)
[3]植物长链非编码RNA进展分析[J]. 高成香,邓粉妮,沈法富. 分子植物育种. 2018(03)
[4]miRNA在植物种子发育过程中的作用[J]. 龚淑敏,丁艳菲,朱诚. 遗传. 2015(06)
[5]植物长链非编码RNA研究进展[J]. 黄小庆,李丹丹,吴娟. 遗传. 2015(04)
[6]种子的休眠与萌发[J]. 刘宁. 生物学通报. 2014(10)
[7]谷胱甘肽S-转移酶的研究进展[J]. 陈秀华,王臻昱,李先平,朱延明,刘丽,陈威,陈勤. 东北农业大学学报. 2013(01)
[8]植物激素对种子休眠和萌发调控机理的研究进展[J]. 杨荣超,张海军,王倩,郭仰东. 草地学报. 2012(01)
[9]谷胱甘肽过氧化物酶和谷胱甘肽转硫酶研究进展[J]. 马森. 动物医学进展. 2008(10)
[10]Arabidopsis RAV1 is down-regulated by brassinosteroid and may act as a negative regulator during plant development[J]. Yu Xin HU~*, Yong Hong WANG~*, Xin Fang LIU, Jia Yang LI~(**) Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China.. Cell Research. 2004(01)
硕士论文
[1]紫花苜蓿MsGSTU8基因的克隆及其功能研究[D]. 张雪.哈尔滨师范大学 2017
本文编号：3199848
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3199848.html
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