香蕉Metacaspases家族基因的鉴定及表达分析

发布时间：2021-06-24 03:21

　　半胱天冬氨酸酶（metacaspases,MC）在植物生长发育调控和逆境胁迫的细胞程序性死亡（PCD）中扮演着重要角色。本研究对香蕉MuMCs基因序列和蛋白序列进行生物学信息分析,采用qTR-PCR技术对香蕉幼苗中MuMCs进行基因表达分析。结果表明,香蕉MuMCs具有8个成员,分为2种类型,Ⅰ型MuMC1～MuMC5和Ⅱ型MuMC6～MuMC8;顺式调控元件预测显示在MuMCs启动子区域存在19种激素和逆境胁迫相关的顺式调控元件;基因表达分析发现Mu MCs具有组织表达特性,在大部分MuMCs中叶的相对表达量最高,假茎的次之,根的最低;此外,Mu MCs对盐胁迫有不同程度的应答模式,盐胁迫后MuMC5和MuMC8相对表达量最高,MuMC2和MuMC6相对表达量最低。本研究为深入了解MuMCs基因特点及验证其生物学功能提供了理论基础,同时也为进一步探究PCD的调控途径提供了理论依据。 

【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(01)北大核心CSCD

【文章页数】：14 页

【部分图文】：

香蕉MuMCs的基因结构

植物的根是最先感受土壤逆境胁迫的重要部位(Huang et al.,2014)，因此植物感受盐胁迫的最早部位为根系。实验中采用NaCl人工模拟盐胁迫，去探讨香蕉根系中MuMCs盐诱导表达特性。计算分析同上组织表达特性分析，仍然以0 h的根为对照，将其相对表达量标准化为1，得到2 h处理和2 h对照各基因相对表达量(图5)。总体来看Mu MCs每个成员中的0、2 h处理和2 h对照之间的相对表达量均达到显著差异水平(p<0.05)。其中MuMC5中处理组相对表达量最高，达5.60，说明MuMC5能够被盐胁迫诱导表达上调。MuMC3和MuMC8中2 h处理和2 h对照都显著上调，说明2 h对照产生了一定的水分胁迫，这两个基因对水分胁迫响应的强度较低。MuMC2、MuMC6和MuMC7中处理组都显著下调，最低达0.37(MuMC6)，说明盐胁迫能负向调控这3个基因的表达。MuMC1和MuMC4中处理组显著上调，说明盐胁迫能诱导其表达上调。盐胁迫能诱导Mu MCs在香蕉根中特异性表达，但是不同基因诱导表达特性和响应的强度不同。图2 香蕉(Mu)和拟南芥(At)多重序列比对

香蕉(Mu)和拟南芥(At)多重序列比对

【参考文献】：
期刊论文
[1]番茄Ⅱ型metacaspase蛋白SlMC7抗体效价检测及其在果实中表达特性分析[J]. 王志超,马秋敏,叶彦雄,温帅,曹景顺,曲桂芹.  北方园艺. 2017(16)
[2]番茄与马铃薯TIFY家族基因的鉴定与比较分析[J]. 胡利宗,王俊生,赵锦慧,王秋霞,韩娇月,纪秀娥.  分子植物育种. 2017(04)
[3]香蕉叶片响应盐胁迫转录组分析[J]. 吉福桑,李元元,唐露,王文昌,李新国.  分子植物育种. 2017(03)
[4]陆地棉苯丙氨酸解氨酶家族基因的鉴定及分析[J]. 杨郁文,李双,黄俊宇,张保龙.  分子植物育种. 2017(04)
[5]西瓜BADH基因序列分析及其乙烯和茉莉酸甲酯诱导表达特性[J]. 徐子健,孙梦利,龙娅丽,乔飞,党选民,江雪飞.  分子植物育种. 2017(04)
[6]实时荧光定量检测盐胁迫下香蕉幼苗CaM和Ca2+-ATPase基因的相对表达量[J]. 王文昌,周双云,乔飞,吉福桑,李元元,李新国.  分子植物育种. 2017(05)
[7]茉莉酸甲酯诱导西瓜ClTPS1基因的表达特性及其生物学信息分析[J]. 龙娅丽,徐子健,朱白婢,江雪飞,张文.  分子植物育种. 2016(12)
[8]拟南芥根毛衰老死亡过程的PCD检测[J]. 李林,谭康,唐秀光,晁晓婷,汶晨曦,白壮东,丰华玲,刘文哲,苏慧.  植物学报. 2016(02)
[9]植物Metacaspase研究进展[J]. 马聪,孔维文.  植物学报. 2012(05)
[10]环境因子诱导的植物细胞程序性死亡[J]. 高赟,琴英玉,李绍波.  现代生物医学进展. 2011(06)



本文编号：3246259