水稻NAM基因家族的全基因组鉴定及表达分析（英文）

发布时间：2021-08-07 04:34

　　植物特异性转录因子NAM家族从属于NAC转录因子超家族,在植株生长发育、生理代谢以及应对各种胁迫反应中均发挥重要作用。该研究采用生物信息学方法鉴定水稻基因组中的NAM基因,分析其时空表达模式、亚细胞定位以及蛋白相互作用,并采用实时定量qRT-PCR方法分析不同外源激素（如SA、ABA和MeJA）以及非生物胁迫（包括干旱、盐和冷）处理下各NAM基因的表达特征,为进一步探索NAM基因在非生物胁迫中的功能和应激机制以及激素调控途径奠定基础。结果显示:（1）从水稻基因组中共鉴定出48个NAM基因,进化分析将其分为5个亚家族;NAM基因在水稻基因组中存在9对片段复制事件。（2）组织表达分析显示,NAM基因在水稻不同组织及发育时期表现特异性表达,特别是叶鞘、茎和节的生长过程中高表达,且大多数是核定位,并存在多种蛋白互作。（3）实时定量qRT-PCR表达分析显示,10个NAM基因在不同组织中均特异表达;大部分NAM基因在盐和干旱胁迫下表达上调,而在冷胁迫下表达降低;SA、ABA和MeJA处理均可显著改变各NAM基因的表达水平。研究表明,NAM基因在水稻生长发育、激素应答和非生物胁迫响应中具有重要作用... 

【文章来源】：西北植物学报. 2020,40(06)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 Materials and methods
    1.1 Materials
    1.2 Methods
        1.2.1 Identification of NAM proteins in rice
        1.2.2 Gene structure and protein motif analysis
        1.2.3 Phylogenetic and duplication analysis
        1.2.4 Spatio-temporal expression and induced expression analysis
        1.2.5 Sub-cellular location and protein interaction
2 Results
    2.1 Rice NAM genes structure, distribution and protein motif
    2.2 Systematic evolutionary and duplication analysis of rice NAM gene family
    2.3 Spatio-temporal expression levels of the NAM genes in rice
    2.4 Induced expression profiles of rice NAM genes
    2.5 Subcellular location and protein interactions of rice NAM proteins
3 Discussion


【参考文献】：
期刊论文
[1]穿心莲转录因子ApNAC1的克隆、亚细胞定位及原核表达[J]. 王健,齐梦蝶,郭娟,申业,林慧馨,黄璐琦.  中国中药杂志. 2017(05)



本文编号：3327092