六种白蚁线粒体基因组序列及遗传多样性分析
发布时间：2021-08-18 23:21
白蚁作为一种古老的,起源悠久,种类众多且品级分化明显的社会性昆虫,在昆虫分类系统中处于较原始和古老的地位。本论文首次测定了小楹白蚁（Incisitermes minor）,新渡户近扭白蚁（Pericapritermes nitobei）,古田近扭白蚁（Pericapritermes gutianensis）,细颚散白蚁（Reticulitermes leptomandibularis）,近黄胸散白蚁（Reticulitermes periflaviceps）和近圆唇散白蚁（Reticulitermes perilabralis）等六种白蚁的线粒体全基因组,并对每种白蚁序列进行了详细的注释与分析。同时,对6种白蚁的线粒体全基因组的碱基组成、氨基酸组成、密码子使用等方面进行了系统地分析,并对其进行了系统发育树的构建与简单的进化关系分析。另外,本研究对已有的14种散白蚁属白蚁（NCBI数据库中11种,实验测得3种）线粒体全基因组数据进行多重序列比对,以期找到Cytb基因中片段可作为DNA条形码应用于散白蚁属白蚁的分子分类鉴定。本论文研究的主要结果如下:（1）完成小楹白蚁、古田近扭白蚁、新渡户...
【文章来源】：浙江农林大学浙江省
【文章页数】：102 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
小楹白蚁的线粒体基因组织结构示意图
3.1.1.5 核糖体 RNA 和转运 RNA小楹白蚁线粒体基因组有两个核糖体 RNA为 12sRNA和 16sRNA基因，长度分别是 830bp 和 1311bp。同时还有 22 个转运 RNA，其中 8 个（Gln，Cys，Tyr，Phe，His，Pro，Leu1，Val）位于 L 链上反向编码，其余的转运 RNA 都位于 H 链上，所有 tRNA 基因合计全长 1452bp。通过 MITOS 对所有的转运RNA进行二级结构预测[125]，发现所有的 tRNA均具有典型的三叶草结构（一个反密码子臂和反密码子环，一个 TΨC 臂或 TΨC 环，一个 D 臂或 D 环，一个氨基酸接受臂以及一个可变环），除了 tRNA-Ser 缺失了二氢尿嘧啶（DHU）臂。所有二级结构预测结果如图（3-2），同时我们发现小楹白蚁转运 RNA 共有 9 处碱基错配现象。
33图 3-3 新渡户近扭白蚁的线粒体基因组织结构示意图外圈基因为正向编码（H），内圈基因为反向编码（L）Figure 3-3 Gene map of the Pericapritermes nitobei.The outer circle gene is forwardcoded (H) and the inner circle gene is forward coded (L)
本文编号：3350821
【文章来源】：浙江农林大学浙江省
【文章页数】：102 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
小楹白蚁的线粒体基因组织结构示意图
3.1.1.5 核糖体 RNA 和转运 RNA小楹白蚁线粒体基因组有两个核糖体 RNA为 12sRNA和 16sRNA基因，长度分别是 830bp 和 1311bp。同时还有 22 个转运 RNA，其中 8 个（Gln，Cys，Tyr，Phe，His，Pro，Leu1，Val）位于 L 链上反向编码，其余的转运 RNA 都位于 H 链上，所有 tRNA 基因合计全长 1452bp。通过 MITOS 对所有的转运RNA进行二级结构预测[125]，发现所有的 tRNA均具有典型的三叶草结构（一个反密码子臂和反密码子环，一个 TΨC 臂或 TΨC 环，一个 D 臂或 D 环，一个氨基酸接受臂以及一个可变环），除了 tRNA-Ser 缺失了二氢尿嘧啶（DHU）臂。所有二级结构预测结果如图（3-2），同时我们发现小楹白蚁转运 RNA 共有 9 处碱基错配现象。
33图 3-3 新渡户近扭白蚁的线粒体基因组织结构示意图外圈基因为正向编码（H），内圈基因为反向编码（L）Figure 3-3 Gene map of the Pericapritermes nitobei.The outer circle gene is forwardcoded (H) and the inner circle gene is forward coded (L)
本文编号：3350821
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