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昼夜节律紊乱对斑马鱼肝脏转录组和肠道菌群影响

发布时间:2021-08-26 11:50
  昼夜节律紊乱严重影响人类身体健康,同时畜牧业生产过程中,昼夜节律紊乱会影响动物的正常生长和相关疾病的发生。昼夜节律受光周期控制,研究不同光周期对动物的影响,有助于发现昼夜节律引发的人类疾病。本研究使用斑马鱼作为研究对象,将4月龄斑马鱼分别养殖于正常昼夜交替环境和全黑暗环境下20d,解剖分离肝脏,进行转录组测序分析,提取肠道内容物进行微生物菌群测序分析,研究昼夜节律紊乱对肠道微生物和肝脏基因表达的影响。结果显示,经20d养殖后,Dark组(全黑暗)游泳距离显著(P<0.05)低于对照组;肠道微生物菌群测序发现不同光制环境肠道优势菌群发生变化,有害菌丰度增加;Dark组各菌群丰度、分布和数量与对照组均有差异,特别是肠道中拟杆菌门(Bacteroidetes)与厚壁菌门(Firmicutes)比例显著降低;肝脏的Cry1a、Per2、Per1a、gpx3和gg1b基因表达差异显著(P<0.05),且基因功能主要与糖类和脂类代谢和免疫力相关。结果表明,昼夜节律紊乱会造成斑马鱼肠道微生物菌群结构变化,益生菌减少,有害菌增多,消化功能降低。值得注意的是肝脏的代谢功能降低影响了肠道菌群稳... 

【文章来源】:内蒙古民族大学内蒙古自治区

【文章页数】:48 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

昼夜节律紊乱对斑马鱼肝脏转录组和肠道菌群影响


图1?不同时间游泳距离差异分析图??

曲线,测序,纵坐标,样本


12?昼夜节律紊乱对斑马鱼肝脏和肠道菌群影响研究???〇?C0??〇?_?-A-?dBflv??T-??.?I/H?■?!??E?°?一?/?I??I?/-,??1^?fy?1????r?'??〇?J?4??0?10000?20000?30000?40000??Sequences?Number??图2稀释曲线??注:横坐标为样本随机抽取的测序条数,纵坐标为基于该测序条数能构建的OUT数量。红色曲线为对照??组;蓝色曲线为Dark组。??

曲线,丰度,杆菌,比例


?内蒙古民族大学硕士学位论文??13??—a??——431.??'a? ̄??①??笔i-??!:v.??I?I??〇?3<X)?l〇〇〇?I9G0??Species?Rank??图3等级聚类曲线??注:横坐标为按OTUs丰度排序的序号,纵坐标为对应的OTUs的相对丰度?红色曲线为对照组:蓝色曲线??为Dark组?曲线的陡度表示出不用样本之间丰度的差异.??3.?2.?2门水平物种相对丰度分析??选取dark组中斑马鱼肠道内门水平丰度排名前七的细菌,包括变形菌门??(Proteobacteria)所占比例为43.?69%、软壁菌门(Tenericutes)所占比例为??21.12%、厚壁菌门(Firmicutes)所占比例为18.?45%、放线菌门??(Actinobacteria)所占比例为?6_81%、酸杆菌门(Acidobacteria?)2.?38%、拟杆??菌门(Bacteroidetes)所占比例为2.?16%、梭杆菌门(Fusobacteria)所占比例??为1.?01%。这七个门水平的肠道细菌相对丰度所占比例高达95.?62%。??与对照组相比,Dark组斑马鱼肠道内梭杆菌门的相对丰度下降了?30.02%,??差异显著(P<〇.?05)。而酸杆菌门、变形菌门的相对丰度分别增加了?1.614%和??21.24%,且差异显著(p<0.?05),(图4)。从表2中可以得出拟杆菌门和厚壁??菌门的比例由0.69降低到0.?12。??

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3364191

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