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基于DNA链置换反应动力学和GFET对DNA甲基化的检测

发布时间:2021-09-04 01:29
  DN A甲基化,作为新型的生物检测标志物,在人类疾病检测和预后方面展示出巨大的应用潜能。现已研发了传统检测和生物传感器等方法实现了对DNA甲基化水平的检测,但是上述检测技术由于设备昂贵或操作过程繁琐等缺陷,限制了它们在临床诊断上的应用。石墨烯,因其优良的导电性,已广泛应用于传感领域,尤其是以单层石墨烯为通道的场效应制备的晶体管(GFET),因检测灵敏度高,己实现了对多种生物分子的检测。到目前为止,仍缺少关于利用GFET对DN A甲基化水平检测的研究。因此,在本研究中,我们主要是开发一种基于GFET无标的检测方法实现对DN A甲基化的检测。本研究中,我们选取谷胱甘肽巯基转移酶(GSTP1)启动子区域中中的一段序列,将该序列中的胞嘧啶进行不同数目和不同位点的甲基化修饰后,作为本实验的目的序列。首先,为了 了解不同甲基化水平修饰的目的序列与DN A探针反应的动力学,我们利用实时荧光定量PCR技术,对不同甲基化修饰水平的目的序列与DNA探针的杂交过程进行系统的分析:同时利用荧光淬灭原理,观测不同甲基化修饰水平的序列对DN A探针链置换反应速率的影响。结果表明:无论足与DN A探针的杂交还是链置... 

【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】:88 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

基于DNA链置换反应动力学和GFET对DNA甲基化的检测


图2?甲基化异常对DNA转录的影响??Fig.2?Effects?of?abnormal?mcthylation?on?DNA?transcription??注:图片引自参务文献15

过甲基化,癌症,去甲基化


异位点的过甲基化是癌细胞的两个重要特征。低甲基化主要是导致了细胞内原癌??基因的异常激活、印迹基因的缺失或者基因组的不稳定而引发了癌症的发生;过??甲基化主要是导致了抑癌基因和DNA修复基因的失活而引发了癌症(图3?)U6-37]。??闪此,人们Li经将DNA甲基化的水平用于癌症的筛查、分类、预后和癌症治疗??监测等领域。??Centromere?9?t?t?*?卜??肴?I?1?|?I?1?I?1?,?I?I?I?I?I???//???^一^??LLLL^?TSG?;???Hypermethylated?七」?CpG?island??pericentromeric?(hypomethylated)??heterochromatin??I?Hypomethylation?Hypermethylation??▼?^??Mitotic?recombination,?Transcriptional?repression,??genomic?instability?loss?of?TSG?expression????DNA?tepea!?'?.??I?Methylated??丽?Unmethylated??图3?dna序列的过甲基化和去甲基化与癌症引发的关系??Fig.3?The?relationship?between?I)N八(liypo/hypci.)?methylated?and?human?cancer??注:屬片闢自参芩殳献16。??H的

甲基化分析,步骤,亚硫酸氢钠


1.3?传统方式对DNA甲基化的检测??在过去的20年里,人们己经开发出多种用于检测生物组织或者体液中DNA??甲基化水平的技术[5”,所有的方法均需要通过以下三个步骤来完成(图4)。简??介如下:首先,通过亚硫酸氢钠转化法_、中基敏感型限制性内切酶酶切法和特异??性亲和吸附纯化等三种方法实现DNA甲基化序列的分离。其中亚硫酸氢钠转化??法使用的最为广泛,该种方法主要是依赖于亚硫酸氢钠能够将C转化成尿嘧啶??(U)


本文编号:3382278

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