基于时间序列的DNA特征分析

发布时间：2021-09-24 02:25

　　生物与生态构成的统一整体称为生态系统,在这个系统中,生物与环境相互影响、相互制约,并形成了相对稳定的生态平衡状态。对不同物种的生物信息进行研究具有重大意义。生物信息学的主要研究对象由DNA、RNA和蛋白质分子构成,这些大分子中含括了物种进化和遗传的所有信息。其中DNA里的线粒体是生物系统研究中应用最为广泛的遗传物质之一,具有进化速率快,在遗传过程不发生基因重组、倒位、易变等突变,严格遵守母系遗传方式的特点。本文中对于30个哺乳动物的线粒体DNA进行研究,利用短记忆ARIMA模型做出详细阐述,概述了线粒体DNA携带mtDNA的一般属性。我们首先对于30个物种随机抽取5个物种的线粒体DNA（位置4,70个碱基）的碱基序列,对其进行时序化;然后利用ARIMA模型进行模型识别、参数估计、模型诊断（检验及优化）、进行预测（碱基位置71-75）。结果表明:在短记忆模型ARIMA（p,q）模型高度显著拟合下,其作为合适的时间序列模型能帮助我们挖掘DNA序列中的未知特性。 

【文章来源】：科学技术创新. 2020,(12)

【文章页数】：3 页

【部分图文】：

人的时序图

人的一阶差分的时序图

一阶差分自相关图

【参考文献】：
博士论文
[1]基于时间序列理论方法的生物序列特征分析[D]. 高洁.江南大学 2009



本文编号：3406907