基于SSR技术对黄河三角洲二色补血草遗传多样性研究
发布时间:2021-10-24 22:48
应用GENALEX6.502、ARLEQUINversion3.5、STRUCTUREv2.3.4、STRUCTURE Harvester、CLUMP和Distruct等软件进行遗传参数估算、主成分分析、遗传变异分析及遗传结构分析。在这项研究中,我们系统地从分布在中国黄河三角洲的12个二色补血草居群中采集到202份个体。我们通过使用共显性的微卫星标记探索微地理遗传结构,旨在解决黄河三角洲二色补血草居群结构和动态问题。结果表明:二色补血草呈中等程度的遗传分化,遗传变异主要存在于居群内,微弱的遗传分化存在于居群间,为(FST=0.067)。香农信息指数平均是1.037,基因流平均是4.106,观测杂合度和期望杂合度平均值分别是0.43和0.529。通过分析二色补血草群体的遗传多样性和遗传结构,旨在为资源的管理、保护和利用提供依据。总之,保护遗传多样性时,应保存尽可能多的居群和特异单株。
【文章来源】:植物研究. 2020,40(06)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
二色补血草部分样品在SSRLB1引物处扩增的毛细管电泳检测
通过Mantel检验,结果显示:黄河三角洲二色补血草居群的遗传距离与地理距离之间无相关性(R2=0.001 2,P=0.374)(见图3);遗传距离与土壤盐度差异没有相关性(R2=0.005 8,P=0.4)(见图4);土壤盐度与遗传参数He、参数I关系结果显示:(R2=0.001,P=0.918),说明土壤盐度和遗传参数I没有相关性;(R2=0.005 9,P=0.821),说明土壤盐度和遗传参数He没有相关性(见图5)。图3 SSR分析的遗传距离矩阵与地理位置矩阵的相关性
SSR分析的遗传距离矩阵与地理位置矩阵的相关性
【参考文献】:
期刊论文
[1]新麦草种质的SSR遗传多样性及群体结构分析[J]. 张晨,云岚,李珍,王俊,郭宏宇,盛誉,石子英,徐学宝. 植物遗传资源学报. 2019(01)
[2]富民枳种质资源的SSR遗传多样性研究[J]. 张珊珊,甘云浩,杨文忠,段宗亮,丁红茜,康红梅,诺苏那玛. 西部林业科学. 2018(04)
[3]基于荧光SSR标记的白杨派种质资源遗传多样性研究[J]. 姚俊修,毛秀红,李善文,刘学良,吴德军. 北京林业大学学报. 2018(06)
[4]基于SSR标记的杜仲群体遗传多样性及遗传结构[J]. 李洪果,贾宏炎,李武志,杜红岩,乌云塔娜,刘攀峰,包文泉. 中南林业科技大学学报. 2018(05)
[5]椭圆叶花锚简化基因组的SSR信息分析及SSR引物开发[J]. 王久利,陈世龙,邢睿,宋相杰,朱明星,张发起. 植物研究. 2018(02)
[6]基于SSR标记的西藏光核桃群体遗传多样性和遗传结构分析[J]. 包文泉,乌云塔娜,杜红岩,李铁柱,刘慧敏,王淋,白玉娥. 林业科学. 2018(02)
[7]二色补血草研究现状和在渭南地区的综合开发利用[J]. 李红芳,韩建华,孙占育. 中国野生植物资源. 2018(01)
[8]基于EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术分析广东2个历史名茶群体遗传多样性[J]. 姜晓辉,方开星,陈栋,吴华玲. 热带作物学报. 2018(01)
[9]铁皮石斛EST-SSR引物的评价、甄选与应用研究[J]. 胡仲义,付涛,何月秋,李文,林立. 植物研究. 2017(01)
[10]蔷薇科6个属植物EST-SSR特征分析[J]. 张得芳,李淑娴,夏涛. 植物研究. 2014(06)
本文编号:3456135
【文章来源】:植物研究. 2020,40(06)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
二色补血草部分样品在SSRLB1引物处扩增的毛细管电泳检测
通过Mantel检验,结果显示:黄河三角洲二色补血草居群的遗传距离与地理距离之间无相关性(R2=0.001 2,P=0.374)(见图3);遗传距离与土壤盐度差异没有相关性(R2=0.005 8,P=0.4)(见图4);土壤盐度与遗传参数He、参数I关系结果显示:(R2=0.001,P=0.918),说明土壤盐度和遗传参数I没有相关性;(R2=0.005 9,P=0.821),说明土壤盐度和遗传参数He没有相关性(见图5)。图3 SSR分析的遗传距离矩阵与地理位置矩阵的相关性
SSR分析的遗传距离矩阵与地理位置矩阵的相关性
【参考文献】:
期刊论文
[1]新麦草种质的SSR遗传多样性及群体结构分析[J]. 张晨,云岚,李珍,王俊,郭宏宇,盛誉,石子英,徐学宝. 植物遗传资源学报. 2019(01)
[2]富民枳种质资源的SSR遗传多样性研究[J]. 张珊珊,甘云浩,杨文忠,段宗亮,丁红茜,康红梅,诺苏那玛. 西部林业科学. 2018(04)
[3]基于荧光SSR标记的白杨派种质资源遗传多样性研究[J]. 姚俊修,毛秀红,李善文,刘学良,吴德军. 北京林业大学学报. 2018(06)
[4]基于SSR标记的杜仲群体遗传多样性及遗传结构[J]. 李洪果,贾宏炎,李武志,杜红岩,乌云塔娜,刘攀峰,包文泉. 中南林业科技大学学报. 2018(05)
[5]椭圆叶花锚简化基因组的SSR信息分析及SSR引物开发[J]. 王久利,陈世龙,邢睿,宋相杰,朱明星,张发起. 植物研究. 2018(02)
[6]基于SSR标记的西藏光核桃群体遗传多样性和遗传结构分析[J]. 包文泉,乌云塔娜,杜红岩,李铁柱,刘慧敏,王淋,白玉娥. 林业科学. 2018(02)
[7]二色补血草研究现状和在渭南地区的综合开发利用[J]. 李红芳,韩建华,孙占育. 中国野生植物资源. 2018(01)
[8]基于EST-SSR毛细管电泳荧光标记技术分析广东2个历史名茶群体遗传多样性[J]. 姜晓辉,方开星,陈栋,吴华玲. 热带作物学报. 2018(01)
[9]铁皮石斛EST-SSR引物的评价、甄选与应用研究[J]. 胡仲义,付涛,何月秋,李文,林立. 植物研究. 2017(01)
[10]蔷薇科6个属植物EST-SSR特征分析[J]. 张得芳,李淑娴,夏涛. 植物研究. 2014(06)
本文编号:3456135
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3456135.html
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