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一株高产苯乳酸的古墓土壤葡糖醋杆菌FBFS97的全基因组测序与分析

发布时间:2021-10-24 21:42
  【背景】苯乳酸(phenyllactic acid,PLA)是一种应用潜力巨大的天然广谱抑菌物质。本课题组前期分离得到一株高产PLA的醋酸菌(acetic acid bacteria,AAB)——葡糖醋杆菌(Gluconacetobacter sp.)FBFS97,但尚未鉴定到种,而且其产PLA的分子机理尚不清楚。【目的】确定FBFS97的种属关系,解析FBFS97的遗传信息,特别是与PLA产生相关的基因。【方法】采用光学显微镜和扫描电镜对FBFS97的菌体形态进行表征,通过16S rRNA基因序列分析对FBFS97进行分类鉴定,并以高效液相色谱分析苯丙氨酸对其产PLA的影响。在此基础上,对FBFS97进行全基因组测序、拼接和基因预测,并进行GO/COG聚类、KEGG代谢通路和VFDB毒力等分析,以及PLA生物合成途径的预测。【结果】根据16S rRNA基因序列的比对结果,结合形态学分析,该菌被鉴定为古墓土壤葡糖醋杆菌(Gluconacetobacter tumulisoli)。将1 000 mg/L苯丙氨酸添加到FBFS97液体培养基中,发酵液中PLA最高浓度可达400 mg/L,为... 

【文章来源】:微生物学通报. 2020,47(05)北大核心CSCD

【文章页数】:10 页

【部分图文】:

一株高产苯乳酸的古墓土壤葡糖醋杆菌FBFS97的全基因组测序与分析


葡糖醋杆菌FBFS97的形态学分析

序列,杆菌,基因,序列


基于16S rRNA基因序列的系统发育树

土壤图,古墓,基因组,杆菌


基因组测序与分析显示,古墓土壤葡糖醋杆菌FBFS97的基因组大小为3 988 308 bp,(G+C)mol%含量为66.62%,共编码3 500个基因,基因组圈图见图4。2.4 基因组注释


本文编号:3456035

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