定量蛋白质组学揭示hfq2在嗜水气单胞菌多效生理功能中的重要作用
发布时间:2021-11-05 04:54
Hfq蛋白是一种进化上高度保守的sRNA分子伴侣蛋白,可在转录后水平调控RNA翻译并在细菌生理功能调节中发挥重要作用。大多数细菌基因组只有一个hfq拷贝,然而少数细菌在其染色体上含有两个甚至多个hfq拷贝。目前对Hfq蛋白的分子机制理论大多是建立在常见的Hfq蛋白(Hfq1)上,而Hfq2蛋白由于在大肠杆菌等模式生物中不存在,其聚体形成模式与功能的研究较为缺乏。据以往报道,不同细菌不同hfq拷贝的生理功能具有多样性,且与Hfq1相比Hfq2的同源性具有较大差异,这提示Hfq2蛋白的功能与调控机制在不同微生物中可能会有所不同,其作用在很大程度上仍然不清楚,有待进一步的研究。本实验室前期对嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)ATCC 7966(NC008570.1)的全基因组分析发现该菌基因组中含有两个hfq拷贝,一个是常见的hfq,其基因名是AHA0924,与大多数细菌Hfq有着较高的同源性,其生物学功能研究较为清楚;另一个hfq拷贝,本文将其简称为hfq2,其基因名是AHA3797,是一个含有121个...
【文章来源】:福建农林大学福建省
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
模式菌株大肠杆菌Hfq蛋白的结构示意图
图 1-2 Hfq 在 sRNA 介导中的作用[8]Fig 1-2 The role of Hfq in sRNA mediated新的研究已将 Hfq 在 sRNA 介导中的作用机制具体到某些特定基因菌的 csgD 基因,如图 1-3 所示。csgD 是 sRNAs 介导的转录后调节的降解依赖于 hfq。在 Hfq 的协助下,OmrA、OmrB、McaS、RprA、G 和 RybB 等 sRNA 对转录因子 csgD 的表达具有负作用。通常情况下点或者裂解位点上的 sRNAs、Hfq 和核糖核酸酶 E(RNase E)位csgD mRNA 上。McaS,RprA,GcvB 和 OmrA / B 蛋白都有与核糖端配对的碱基对。当 OmrA 和 OmrB 引起翻译抑制时,McaS、R 诱导 mRNA 的核糖核酸裂解,当结合在 Hfq 结合位点上游 5'-末端附抑制 RNase E 裂解、并且减轻由 McaS 诱导的 csgD 基因表达抑制。bB 通过在核糖体结合位点结合 CsgD 来抑制翻译起始复合物的形成制起始核糖体进入的目的。在某些情况下,与 csgD 结合的 sRNA
图 1-3 sRNA 介导的 CsyD 与 Hfq 调控模型[30]Fig 1-3 Model for sRNA-mediated regulation of CsgD and H sRNA-asRNA 的相互配对过程中的作用 sRNA 发生作用外,还会与顺式反义 RNA(natura作。30 多年前第一次在细菌中发现 asRNA,asRNA
本文编号:3477116
【文章来源】:福建农林大学福建省
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
模式菌株大肠杆菌Hfq蛋白的结构示意图
图 1-2 Hfq 在 sRNA 介导中的作用[8]Fig 1-2 The role of Hfq in sRNA mediated新的研究已将 Hfq 在 sRNA 介导中的作用机制具体到某些特定基因菌的 csgD 基因,如图 1-3 所示。csgD 是 sRNAs 介导的转录后调节的降解依赖于 hfq。在 Hfq 的协助下,OmrA、OmrB、McaS、RprA、G 和 RybB 等 sRNA 对转录因子 csgD 的表达具有负作用。通常情况下点或者裂解位点上的 sRNAs、Hfq 和核糖核酸酶 E(RNase E)位csgD mRNA 上。McaS,RprA,GcvB 和 OmrA / B 蛋白都有与核糖端配对的碱基对。当 OmrA 和 OmrB 引起翻译抑制时,McaS、R 诱导 mRNA 的核糖核酸裂解,当结合在 Hfq 结合位点上游 5'-末端附抑制 RNase E 裂解、并且减轻由 McaS 诱导的 csgD 基因表达抑制。bB 通过在核糖体结合位点结合 CsgD 来抑制翻译起始复合物的形成制起始核糖体进入的目的。在某些情况下,与 csgD 结合的 sRNA
图 1-3 sRNA 介导的 CsyD 与 Hfq 调控模型[30]Fig 1-3 Model for sRNA-mediated regulation of CsgD and H sRNA-asRNA 的相互配对过程中的作用 sRNA 发生作用外,还会与顺式反义 RNA(natura作。30 多年前第一次在细菌中发现 asRNA,asRNA
本文编号:3477116
本文链接:https://www.wllwen.com/projectlw/swxlw/3477116.html
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